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Enhancers that regulate GJC1[ENSG00000182963.5]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Uterus
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Heart
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VISTA
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chr17 42872286 42872458 vista24899 42908184 35726
VISTA
chr17 42876736 42881579 enh65043 42908184 26605
Uterus Heart
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Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-MC) Prostate (RWPE1) Astrocyte Bone (Osteoblast) Colon (HCT116) Muscle (Myoblast) Pancreas (Panc1) Muscle (Myotube) Uterus
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VISTA
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Liver (HepG2) Heart
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Bone Marrow (K562) Astrocyte Bone (Osteoblast)
Transcript facotrs that regulate GJC1[ENSG00000182963.5]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr17 42904404 42904415 FOSL2 JASPAR yes 42908184 3769 54417124
chr17 42904406 42904419 SMAD2 JASPAR yes 42908184 3765 54417125
chr17 42904409 42904419 TBR1 JASPAR yes 42908184 3765 54417126
chr17 42904410 42904420 TBX21 JASPAR yes 42908184 3764 54417127
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chr17 42904411 42904419 TBX4 JASPAR yes 42908184 3765 54417131
chr17 42904411 42904419 TBX5 JASPAR yes 42908184 3765 54417132
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chr17 42904411 42904424 ZBTB18 JASPAR yes 42908184 3760 54417136
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chr17 42905438 42905458 TP63 JASPAR yes 42908184 2726 54417279
chr17 42905440 42905455 TP53 JASPAR yes 42908184 2729 54417280
chr17 42905455 42905465 ETV6 JASPAR yes 42908184 2719 54417281
chr17 42905457 42905462 ETS2 TRANSFAC yes 42908184 2722 54417282
chr17 42905463 42905481 NFYA JASPAR yes 42908184 2703 54417283
chr17 42905475 42905481 HiNF-A TRANSFAC yes 42908184 2703 54417284
chr17 42905486 42905496 TEAD1 JASPAR yes 42908184 2688 54417285
chr17 42905486 42905496 TEAD4 JASPAR yes 42908184 2688 54417286
chr17 42905487 42905495 TEAD3 JASPAR yes 42908184 2689 54417287
chr17 42905490 42905495 ETS2 TRANSFAC yes 42908184 2689 54417288
chr17 42905509 42905522 POU2F2 JASPAR yes 42908184 2662 54417289
chr17 42905510 42905521 FOXC1 JASPAR yes 42908184 2663 54417290
chr17 42905510 42905522 FOXC2 JASPAR yes 42908184 2662 54417291
chr17 42905511 42905523 FOXI1 JASPAR yes 42908184 2661 54417292
chr17 42905516 42905531 MEF2C JASPAR yes 42908184 2653 54417293
chr17 42905518 42905522 TEAD2 TRANSFAC yes 42908184 2662 54417294
chr17 42905528 42905539 PHOX2A JASPAR yes 42908184 2645 54417295
chr17 42905528 42905539 PROP1 JASPAR yes 42908184 2645 54417296
chr17 42905531 42905541 GSX2 JASPAR yes 42908184 2643 54417297
chr17 42905531 42905541 HESX1 JASPAR yes 42908184 2643 54417298
chr17 42905531 42905541 LBX2 JASPAR yes 42908184 2643 54417299
chr17 42905531 42905541 MIXL1 JASPAR yes 42908184 2643 54417300
chr17 42905531 42905541 MNX1 JASPAR yes 42908184 2643 54417301
chr17 42905531 42905541 RAX JASPAR yes 42908184 2643 54417302
chr17 42905532 42905540 ISX JASPAR yes 42908184 2644 54417303
chr17 42905532 42905540 LHX9 JASPAR yes 42908184 2644 54417304
chr17 42905532 42905540 LMX1B JASPAR yes 42908184 2644 54417305
chr17 42905532 42905540 PRRX1 JASPAR yes 42908184 2644 54417306
chr17 42905532 42905540 RAX2 JASPAR yes 42908184 2644 54417307
chr17 42905532 42905540 SHOX JASPAR yes 42908184 2644 54417308
chr17 42905532 42905540 UNCX JASPAR yes 42908184 2644 54417309
chr17 42905539 42905545 SOX10 JASPAR yes 42908184 2639 54417310
chr17 42905544 42905549 GATA2 JASPAR yes 42908184 2635 54417311
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chr17 42905557 42905561 TEAD2 TRANSFAC yes 42908184 2623 54417314
chr17 42905559 42905566 NKX3-1 JASPAR yes 42908184 2618 54417315
chr17 42905567 42905576 SRY JASPAR yes 42908184 2608 54417316
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chr17 42905582 42905594 POU3F2 JASPAR yes 42908184 2590 54417321
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chr17 42905586 42905596 ESX1 JASPAR yes 42908184 2588 54417327
chr17 42905586 42905596 GSX1 JASPAR yes 42908184 2588 54417328
chr17 42905586 42905596 GSX2 JASPAR yes 42908184 2588 54417329
chr17 42905586 42905596 HESX1 JASPAR yes 42908184 2588 54417330
chr17 42905586 42905596 LBX2 JASPAR yes 42908184 2588 54417331
chr17 42905586 42905596 LHX2 JASPAR yes 42908184 2588 54417332
chr17 42905586 42905596 LHX6 JASPAR yes 42908184 2588 54417333
chr17 42905586 42905596 MIXL1 JASPAR yes 42908184 2588 54417334
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chr17 42905586 42905596 RAX JASPAR yes 42908184 2588 54417338
chr17 42905587 42905595 ISX JASPAR yes 42908184 2589 54417339
chr17 42905587 42905595 LMX1A JASPAR yes 42908184 2589 54417340
chr17 42905587 42905595 LMX1B JASPAR yes 42908184 2589 54417341
chr17 42905587 42905595 NKX6-1 JASPAR yes 42908184 2589 54417342
chr17 42905587 42905595 NKX6-2 JASPAR yes 42908184 2589 54417343
chr17 42905587 42905595 PRRX1 JASPAR yes 42908184 2589 54417344
chr17 42905587 42905595 RAX2 JASPAR yes 42908184 2589 54417345
chr17 42905587 42905595 SHOX JASPAR yes 42908184 2589 54417346
chr17 42905587 42905595 UNCX JASPAR yes 42908184 2589 54417347
chr17 42905587 42905595 VAX1 JASPAR yes 42908184 2589 54417348
chr17 42905601 42905609 RHOXF1 JASPAR yes 42908184 2575 54417349
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chr17 42905942 42905954 TAL1 JASPAR yes 42908184 2230 54417374
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chr17 42905990 42906002 HNF1B JASPAR yes 42908184 2182 54417381
chr17 42906007 42906011 YY1 TRANSFAC yes 42908184 2173 54417382
chr17 42906016 42906023 NKX3-1 JASPAR yes 42908184 2161 54417383
chr17 42906028 42906034 TCF1 TRANSFAC yes 42908184 2150 54417384
chr17 42906028 42906035 TCF4 TRANSFAC yes 42908184 2149 54417385
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chr17 42906055 42906064 POU3F4 JASPAR yes 42908184 2120 54417388
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chr17 42906100 42906112 POU2F1 JASPAR yes 42908184 2072 54417391
chr17 42906100 42906113 POU3F3 JASPAR yes 42908184 2071 54417392
chr17 42906100 42906114 POU1F1 JASPAR yes 42908184 2070 54417393
chr17 42906101 42906113 POU3F1 JASPAR yes 42908184 2071 54417394
chr17 42906101 42906113 POU3F2 JASPAR yes 42908184 2071 54417395
chr17 42906102 42906106 YY1 TRANSFAC yes 42908184 2078 54417396
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chr17 42906137 42906152 FOXP1 JASPAR yes 42908184 2032 54417399
chr17 42906138 42906149 FOXP2 JASPAR yes 42908184 2035 54417400
chr17 42906144 42906154 NFATC3 JASPAR yes 42908184 2030 54417401
chr17 42906145 42906152 NFATC2 JASPAR yes 42908184 2032 54417402
chr17 42906206 42906217 EBF1 JASPAR yes 42908184 1967 54417403
chr17 42906207 42906218 EBF1 JASPAR yes 42908184 1966 54417404
chr17 42906223 42906227 YY1 TRANSFAC yes 42908184 1957 54417405
SNPs associated with GJC1[ENSG00000182963.5], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr17 42934694 rs2277615 T C 26510 Esophagus 0.00011289 4891993
chr17 42664697 rs9944523 G A 211119 Esophagus 0.000124216 4890624
chr17 42917182 rs2586580 C T 8998 Heart 0.00120905 4891924
chr17 42917635 rs371205539 AAC A 9451 Heart 0.000272906 4891931
chr17 42438404 rs112376123 G A,C,T 437412 Spleen 0.335997 4889591
chr17 42934694 rs2277615 T C 26510 Thyroid 0.000956494 4891993
chr17 41952045 rs118042501 A T 923771 Stomach 0.444632 4886772
Details of GJC1[ENSG00000182963.5]
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Genomic Location chr17:42875816-42908184[-]
TSS 42908184
Gene Name GJC1
Ensembl ID ENSG00000182963.5
ENTREZID 10052
Uniprot
P36383
Protein Name
Gap junction delta-3 protein
Gap junction gamma-1 protein
Gap junction protein
Expression levels of GJC1[ENSG00000182963.5]
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