EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. GJA4[ENSG00000187513.8]
Enhancers that regulate GJA4[ENSG00000187513.8]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr1 35186665 35190815 enh111368 35258599 67784
Brain (SK-N-MC)
chr1 35206465 35210615 enh49708 35258599 47984
Large Intestine
chr1 35262405 35268035 enh87593 35258599 3806
Pancreas Adrenal
chr1 35268667 35276266 enh42929 35258599 10068
Muscle (Myotube)
chr1 35288785 35297065 enh64021 35258599 30186
Bone (Osteoblast) Stomach Pancreas Heart Epithelial (MCF-7)
chr1 35294449 35294485 vista1164 35258599 35850
VISTA
chr1 35299293 35304615 enh64022 35258599 40694
Thyroid Bone (Osteoblast) Heart
chr1 35306394 35321215 enh226 35258599 47795
Bone Marrow (K562) Astrocyte Colon (HCT116) Blood (Karpas-422) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Stomach Brain (SK-N-SH) Ovary Bone (Osteoblast) Thyroid Neural Stem Cells (H9) Esophagus Placenta Breast Spleen Prostate (RWPE1) Lung Heart
chr1 35309235 35309522 vista1165 35258599 50636
VISTA
chr1 35334105 35339335 enh47161 35258599 75506
Thymus
chr1 35336428 35336734 vista1166 35258599 77829
VISTA
Transcript facotrs that regulate GJA4[ENSG00000187513.8]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr1 35262448 35262464 POU4F2 JASPAR yes 35258599 3849 28073179
chr1 35262452 35262462 HOXA13 JASPAR yes 35258599 3853 28073180
chr1 35262452 35262462 HOXD13 JASPAR yes 35258599 3853 28073181
chr1 35262453 35262463 PAX7 JASPAR yes 35258599 3854 28073182
chr1 35262468 35262478 GABPA JASPAR yes 35258599 3869 28073183
chr1 35262468 35262481 ELF1 JASPAR yes 35258599 3869 28073184
chr1 35262471 35262476 ETS2 TRANSFAC yes 35258599 3872 28073185
chr1 35262475 35262482 NFATC2 JASPAR yes 35258599 3876 28073186
chr1 35262476 35262489 ZBTB18 JASPAR yes 35258599 3877 28073187
chr1 35262492 35262501 SOX9 JASPAR yes 35258599 3893 28073188
chr1 35262512 35262526 ONECUT1 JASPAR yes 35258599 3913 28073189
chr1 35262512 35262526 ONECUT2 JASPAR yes 35258599 3913 28073190
chr1 35262515 35262525 CUX1 JASPAR yes 35258599 3916 28073191
chr1 35262515 35262525 CUX2 JASPAR yes 35258599 3916 28073192
chr1 35262515 35262525 PAX3 JASPAR yes 35258599 3916 28073193
chr1 35262515 35262525 PAX7 JASPAR yes 35258599 3916 28073194
chr1 35262521 35262531 SREBF2 JASPAR yes 35258599 3922 28073195
chr1 35262553 35262568 AR JASPAR yes 35258599 3954 28073196
chr1 35262561 35262572 E2F6 JASPAR yes 35258599 3962 28073197
chr1 35262568 35262578 SP1 JASPAR yes 35258599 3969 28073198
chr1 35262571 35262577 NFE2 TRANSFAC yes 35258599 3972 28073199
chr1 35262576 35262594 MAFF JASPAR yes 35258599 3977 28073200
chr1 35262577 35262592 MAFK JASPAR yes 35258599 3978 28073201
chr1 35262595 35262605 SP1 JASPAR yes 35258599 3996 28073202
chr1 35262596 35262606 SP1 JASPAR yes 35258599 3997 28073203
chr1 35262598 35262604 NFE2 TRANSFAC yes 35258599 3999 28073204
chr1 35262601 35262611 ZNF740 JASPAR yes 35258599 4002 28073205
chr1 35262649 35262656 NFATC2 JASPAR yes 35258599 4050 28073206
chr1 35262666 35262672 ETS1 JASPAR yes 35258599 4067 28073207
chr1 35262666 35262672 SPI1 JASPAR yes 35258599 4067 28073208
chr1 35262678 35262692 GATA2 JASPAR yes 35258599 4079 28073209
chr1 35262684 35262703 CTCF JASPAR yes 35258599 4085 28073210
chr1 35262688 35262702 PLAG1 JASPAR yes 35258599 4089 28073211
chr1 35262708 35262723 RUNX2 JASPAR yes 35258599 4109 28073212
chr1 35262723 35262735 PBX1 JASPAR yes 35258599 4124 28073213
chr1 35262731 35262735 YY1 TRANSFAC yes 35258599 4132 28073214
chr1 35262742 35262763 IRF1 JASPAR yes 35258599 4143 28073215
chr1 35262744 35262759 STAT2 JASPAR yes 35258599 4145 28073216
chr1 35262745 35262759 STAT1 JASPAR yes 35258599 4146 28073217
chr1 35262759 35262762 MYB TRANSFAC yes 35258599 4160 28073218
chr1 35262764 35262778 IRF7 JASPAR yes 35258599 4165 28073219
chr1 35262767 35262779 POU2F1 JASPAR yes 35258599 4168 28073220
chr1 35262767 35262780 POU3F3 JASPAR yes 35258599 4168 28073221
chr1 35262767 35262781 POU1F1 JASPAR yes 35258599 4168 28073222
chr1 35262768 35262779 FOXA1 JASPAR yes 35258599 4169 28073223
chr1 35262768 35262780 POU3F1 JASPAR yes 35258599 4169 28073224
chr1 35262768 35262780 POU3F2 JASPAR yes 35258599 4169 28073225
chr1 35262768 35262781 POU2F2 JASPAR yes 35258599 4169 28073226
chr1 35262768 35262783 FOXA1 JASPAR yes 35258599 4169 28073227
chr1 35262769 35262778 POU3F4 JASPAR yes 35258599 4170 28073228
chr1 35262769 35262778 POU5F1B JASPAR yes 35258599 4170 28073229
chr1 35262769 35262780 FOXB1 JASPAR yes 35258599 4170 28073230
chr1 35262769 35262780 FOXC1 JASPAR yes 35258599 4170 28073231
chr1 35262769 35262781 FOXC2 JASPAR yes 35258599 4170 28073232
chr1 35262770 35262777 POU2F1 TRANSFAC yes 35258599 4171 28073233
chr1 35262770 35262777 POU2F2 TRANSFAC yes 35258599 4171 28073234
chr1 35262777 35262780 MYB TRANSFAC yes 35258599 4178 28073235
chr1 35262783 35262788 USF2 TRANSFAC yes 35258599 4184 28073236
chr1 35262805 35262821 SRF JASPAR yes 35258599 4206 28073237
chr1 35262806 35262818 FOXI1 JASPAR yes 35258599 4207 28073238
chr1 35262807 35262828 IRF1 JASPAR yes 35258599 4208 28073239
chr1 35262811 35262826 PRDM1 JASPAR yes 35258599 4212 28073240
chr1 35262863 35262876 EOMES JASPAR yes 35258599 4264 28073241
chr1 35262865 35262875 TBR1 JASPAR yes 35258599 4266 28073242
chr1 35262865 35262876 TBX20 JASPAR yes 35258599 4266 28073243
chr1 35262865 35262876 TBX2 JASPAR yes 35258599 4266 28073244
chr1 35262866 35262876 TBX21 JASPAR yes 35258599 4267 28073245
chr1 35262867 35262875 MGA JASPAR yes 35258599 4268 28073246
chr1 35262867 35262875 TBX15 JASPAR yes 35258599 4268 28073247
chr1 35262867 35262875 TBX1 JASPAR yes 35258599 4268 28073248
chr1 35262867 35262875 TBX4 JASPAR yes 35258599 4268 28073249
chr1 35262867 35262875 TBX5 JASPAR yes 35258599 4268 28073250
chr1 35262867 35262879 PKNOX1 JASPAR yes 35258599 4268 28073251
chr1 35262867 35262879 TGIF2 JASPAR yes 35258599 4268 28073252
chr1 35262886 35262889 MYB TRANSFAC yes 35258599 4287 28073253
chr1 35262897 35262916 CTCF JASPAR yes 35258599 4298 28073254
chr1 35262900 35262913 ELF1 JASPAR yes 35258599 4301 28073255
chr1 35262902 35262913 ELF5 JASPAR yes 35258599 4303 28073256
chr1 35262903 35262910 ETS1 TRANSFAC yes 35258599 4304 28073257
chr1 35262903 35262914 ELK4 JASPAR yes 35258599 4304 28073258
chr1 35262903 35262914 FLI1 JASPAR yes 35258599 4304 28073259
chr1 35262944 35262954 RORA JASPAR yes 35258599 4345 28073260
chr1 35262944 35262958 NR2F1 JASPAR yes 35258599 4345 28073261
chr1 35262976 35262988 PBX1 JASPAR yes 35258599 4377 28073262
chr1 35263034 35263044 ETV3 JASPAR yes 35258599 4435 28073263
chr1 35263063 35263067 H4TF2 TRANSFAC yes 35258599 4464 28073264
chr1 35263068 35263072 NFE TRANSFAC yes 35258599 4469 28073265
chr1 35263092 35263107 NR2C2 JASPAR yes 35258599 4493 28073266
chr1 35263093 35263107 RXRB JASPAR yes 35258599 4494 28073267
chr1 35263093 35263107 RXRG JASPAR yes 35258599 4494 28073268
chr1 35263141 35263145 YY1 TRANSFAC yes 35258599 4542 28073269
chr1 35263183 35263188 GATA2 JASPAR yes 35258599 4584 28073270
chr1 35263185 35263191 MZF1 JASPAR yes 35258599 4586 28073271
chr1 35263194 35263212 SRF JASPAR yes 35258599 4595 28073272
chr1 35263214 35263229 LEF1 JASPAR yes 35258599 4615 28073273
chr1 35263237 35263243 HiNF-A TRANSFAC yes 35258599 4638 28073274
chr1 35263249 35263259 MZF1 JASPAR yes 35258599 4650 28073275
chr1 35263252 35263258 SP1 TRANSFAC yes 35258599 4653 28073276
chr1 35263252 35263262 SP1 JASPAR yes 35258599 4653 28073277
chr1 35263298 35263302 ESR1 TRANSFAC yes 35258599 4699 28073278
chr1 35263322 35263336 NR2F1 JASPAR yes 35258599 4723 28073279
chr1 35263327 35263336 NFIX JASPAR yes 35258599 4728 28073280
chr1 35263328 35263334 NFIC JASPAR yes 35258599 4729 28073281
chr1 35263344 35263348 H4TF2 TRANSFAC yes 35258599 4745 28073282
chr1 35263356 35263368 GLI2 JASPAR yes 35258599 4757 28073283
chr1 35263362 35263374 FOXI1 JASPAR yes 35258599 4763 28073284
chr1 35263366 35263372 HiNF-A TRANSFAC yes 35258599 4767 28073285
chr1 35263382 35263394 INSM1 JASPAR yes 35258599 4783 28073286
chr1 35263415 35263425 SP1 JASPAR yes 35258599 4816 28073287
chr1 35263424 35263434 SREBF1 JASPAR yes 35258599 4825 28073288
chr1 35263424 35263434 SREBF2 JASPAR yes 35258599 4825 28073289
chr1 35263424 35263434 TBX21 JASPAR yes 35258599 4825 28073290
chr1 35263425 35263433 MGA JASPAR yes 35258599 4826 28073291
chr1 35263431 35263435 YY1 TRANSFAC yes 35258599 4832 28073292
chr1 35263436 35263448 INSM1 JASPAR yes 35258599 4837 28073293
chr1 35263485 35263495 SP1 JASPAR yes 35258599 4886 28073294
chr1 35263489 35263497 TBX15 JASPAR yes 35258599 4890 28073295
chr1 35263489 35263498 ZEB1 JASPAR yes 35258599 4890 28073296
chr1 35263490 35263500 FIGLA JASPAR yes 35258599 4891 28073297
chr1 35263490 35263500 TCF3 JASPAR yes 35258599 4891 28073298
chr1 35263490 35263500 TCF4 JASPAR yes 35258599 4891 28073299
chr1 35263491 35263500 SNAI2 JASPAR yes 35258599 4892 28073300
chr1 35263492 35263497 USF2 TRANSFAC yes 35258599 4893 28073301
chr1 35263503 35263519 RFX2 JASPAR yes 35258599 4904 28073302
chr1 35263503 35263519 RFX5 JASPAR yes 35258599 4904 28073303
chr1 35263504 35263513 NFIX JASPAR yes 35258599 4905 28073304
chr1 35263504 35263523 RFX2 JASPAR yes 35258599 4905 28073305
chr1 35263506 35263512 NFIC JASPAR yes 35258599 4907 28073306
chr1 35263547 35263562 IRF9 JASPAR yes 35258599 4948 28073307
chr1 35263548 35263562 IRF8 JASPAR yes 35258599 4949 28073308
chr1 35263549 35263563 STAT1 JASPAR yes 35258599 4950 28073309
chr1 35263549 35263564 STAT2 JASPAR yes 35258599 4950 28073310
chr1 35263553 35263568 IRF9 JASPAR yes 35258599 4954 28073311
chr1 35263596 35263615 REST JASPAR yes 35258599 4997 28073312
SNPs associated with GJA4[ENSG00000187513.8], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr1 35312649 rs12134709 C A 51301 Esophagus 0.132593 227277
chr1 34841673 rs146304996 G T 416926 Esophagus 0.219795 225883
chr1 35253844 rs6697367 C T 4755 Heart 0.127649 226835
chr1 34800325 rs1342165 A G 458274 Breast 0.421546 225781
chr1 35085514 rs12734408 G A 173085 Ovary 0.440363 226405
chr1 35308591 rs11577735 A G 47243 Stomach 0.00040379 227233
Details of GJA4[ENSG00000187513.8]
Back to top
Genomic Location chr1:35258599-35261348[+]
TSS 35258599
Gene Name GJA4
Ensembl ID ENSG00000187513.8
ENTREZID 2701
Uniprot
P35212
Protein Name
Gap junction alpha-4 protein
Gap junction protein
Expression levels of GJA4[ENSG00000187513.8]
Back to top