EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. CNGA4[ENSG00000132259.8]
Enhancers that regulate CNGA4[ENSG00000132259.8]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr11 6217696 6217859 vista9496 6255995 38136
VISTA
chr11 6222114 6222511 vista9497 6255995 33484
VISTA
chr11 6222729 6223104 vista9498 6255995 32891
VISTA
chr11 6224718 6224948 vista9499 6255995 31047
VISTA
chr11 6240600 6240982 vista9500 6255995 15013
VISTA
chr11 6245245 6253495 enh1620 6255995 2500
Blood (T-cell) Blood (Karpas-422) Stomach
chr11 6262210 6262374 vista9501 6255995 6215
VISTA
chr11 6269014 6275635 enh13721 6255995 13019
Skin (Keratinocyte) Ovary Large Intestine Bone (Osteoblast) Placenta Pancreas Uterus Stomach
chr11 6273296 6273510 vista9502 6255995 17301
VISTA
chr11 6281699 6281893 vista9503 6255995 25704
VISTA
chr11 6290237 6290402 vista9504 6255995 34242
VISTA
chr11 6315025 6319515 enh98777 6255995 59030
Uterus
chr11 6335038 6339430 enh62117 6255995 79043
Ovary Prostate (RWPE1) Esophagus Uterus Neural Stem Cells (H9) Heart
chr11 6344620 6344857 vista9505 6255995 88625
VISTA
chr11 6346046 6351918 enh67692 6255995 90051
Neural Stem Cells (H9)
Transcript facotrs that regulate CNGA4[ENSG00000132259.8]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr11 6251039 6251043 H1TF2 TRANSFAC yes 6255995 4952 37122765
chr11 6251039 6251043 NFE TRANSFAC yes 6255995 4952 37122766
chr11 6251039 6251043 SRF TRANSFAC yes 6255995 4952 37122767
chr11 6251042 6251049 NKX3-1 JASPAR yes 6255995 4946 37122768
chr11 6251064 6251084 RREB1 JASPAR yes 6255995 4911 37122769
chr11 6251074 6251095 IRF1 JASPAR yes 6255995 4900 37122770
chr11 6251075 6251089 TCF7L2 JASPAR yes 6255995 4906 37122771
chr11 6251082 6251097 IRF9 JASPAR yes 6255995 4898 37122772
chr11 6251105 6251122 ZNF410 JASPAR yes 6255995 4873 37122773
chr11 6251106 6251110 NFE TRANSFAC yes 6255995 4885 37122774
chr11 6251111 6251121 POU6F2 JASPAR yes 6255995 4874 37122775
chr11 6251112 6251122 ALX3 JASPAR yes 6255995 4873 37122776
chr11 6251112 6251122 EMX1 JASPAR yes 6255995 4873 37122777
chr11 6251112 6251122 EMX2 JASPAR yes 6255995 4873 37122778
chr11 6251112 6251122 ESX1 JASPAR yes 6255995 4873 37122779
chr11 6251112 6251122 EVX2 JASPAR yes 6255995 4873 37122780
chr11 6251112 6251122 GBX1 JASPAR yes 6255995 4873 37122781
chr11 6251112 6251122 GSX1 JASPAR yes 6255995 4873 37122782
chr11 6251112 6251122 GSX2 JASPAR yes 6255995 4873 37122783
chr11 6251112 6251122 HOXA2 JASPAR yes 6255995 4873 37122784
chr11 6251112 6251122 HOXB2 JASPAR yes 6255995 4873 37122785
chr11 6251112 6251122 HOXB3 JASPAR yes 6255995 4873 37122786
chr11 6251112 6251122 LBX2 JASPAR yes 6255995 4873 37122787
chr11 6251112 6251122 LHX2 JASPAR yes 6255995 4873 37122788
chr11 6251112 6251122 LHX6 JASPAR yes 6255995 4873 37122789
chr11 6251112 6251122 MIXL1 JASPAR yes 6255995 4873 37122790
chr11 6251112 6251122 NOTO JASPAR yes 6255995 4873 37122791
chr11 6251113 6251121 EN1 JASPAR yes 6255995 4874 37122792
chr11 6251113 6251121 ISX JASPAR yes 6255995 4874 37122793
chr11 6251113 6251121 LBX1 JASPAR yes 6255995 4874 37122794
chr11 6251113 6251121 LHX9 JASPAR yes 6255995 4874 37122795
chr11 6251113 6251121 PAX4 JASPAR yes 6255995 4874 37122796
chr11 6251113 6251121 PDX1 JASPAR yes 6255995 4874 37122797
chr11 6251113 6251121 PRRX1 JASPAR yes 6255995 4874 37122798
chr11 6251113 6251121 RAX2 JASPAR yes 6255995 4874 37122799
chr11 6251113 6251121 SHOX JASPAR yes 6255995 4874 37122800
chr11 6251113 6251121 UNCX JASPAR yes 6255995 4874 37122801
chr11 6251113 6251121 VAX1 JASPAR yes 6255995 4874 37122802
chr11 6251113 6251121 VAX2 JASPAR yes 6255995 4874 37122803
chr11 6251113 6251121 VSX1 JASPAR yes 6255995 4874 37122804
chr11 6251113 6251121 VSX2 JASPAR yes 6255995 4874 37122805
chr11 6251145 6251151 SOX10 JASPAR yes 6255995 4844 37122806
chr11 6251172 6251187 AR JASPAR yes 6255995 4808 37122807
chr11 6251177 6251191 STAT1 JASPAR yes 6255995 4804 37122808
chr11 6251192 6251207 HNF4G JASPAR yes 6255995 4788 37122809
chr11 6251193 6251207 NR2F1 JASPAR yes 6255995 4788 37122810
chr11 6251193 6251208 HNF4A JASPAR yes 6255995 4787 37122811
chr11 6251201 6251216 MEF2C JASPAR yes 6255995 4779 37122812
chr11 6251204 6251219 FOXP1 JASPAR yes 6255995 4776 37122813
chr11 6251205 6251220 FOXP1 JASPAR yes 6255995 4775 37122814
chr11 6251206 6251221 FOXP1 JASPAR yes 6255995 4774 37122815
chr11 6251206 6251227 IRF1 JASPAR yes 6255995 4768 37122816
chr11 6251207 6251222 FOXP1 JASPAR yes 6255995 4773 37122817
chr11 6251208 6251223 FOXP1 JASPAR yes 6255995 4772 37122818
chr11 6251208 6251229 IRF1 JASPAR yes 6255995 4766 37122819
chr11 6251209 6251224 FOXP1 JASPAR yes 6255995 4771 37122820
chr11 6251214 6251235 IRF1 JASPAR yes 6255995 4760 37122821
chr11 6251218 6251232 SPI1 JASPAR yes 6255995 4763 37122822
chr11 6251245 6251260 TFAP2C JASPAR yes 6255995 4735 37122823
chr11 6251247 6251262 TFAP2A JASPAR yes 6255995 4733 37122824
chr11 6251271 6251285 SPI1 JASPAR yes 6255995 4710 37122825
chr11 6251294 6251312 SRF JASPAR yes 6255995 4683 37122826
chr11 6251301 6251313 YY1 JASPAR yes 6255995 4682 37122827
chr11 6251350 6251365 RUNX2 JASPAR yes 6255995 4630 37122828
chr11 6251398 6251411 ELF1 JASPAR yes 6255995 4584 37122829
chr11 6251399 6251403 LFA1 TRANSFAC yes 6255995 4592 37122830
chr11 6251401 6251411 ERF JASPAR yes 6255995 4584 37122831
chr11 6251401 6251411 ETS1 JASPAR yes 6255995 4584 37122832
chr11 6251401 6251411 ETV6 JASPAR yes 6255995 4584 37122833
chr11 6251401 6251411 GABPA JASPAR yes 6255995 4584 37122834
chr11 6251401 6251412 ELK4 JASPAR yes 6255995 4583 37122835
chr11 6251401 6251412 FLI1 JASPAR yes 6255995 4583 37122836
chr11 6251402 6251410 EHF JASPAR yes 6255995 4585 37122837
chr11 6251402 6251410 FEV JASPAR yes 6255995 4585 37122838
chr11 6251403 6251410 SPI1 JASPAR yes 6255995 4585 37122839
chr11 6251427 6251441 NR2F1 JASPAR yes 6255995 4554 37122840
chr11 6251427 6251441 RXRG JASPAR yes 6255995 4554 37122841
chr11 6251440 6251461 ZNF263 JASPAR yes 6255995 4534 37122842
chr11 6251448 6251469 ZNF263 JASPAR yes 6255995 4526 37122843
chr11 6251451 6251472 ZNF263 JASPAR yes 6255995 4523 37122844
chr11 6251452 6251459 CEBPA TRANSFAC yes 6255995 4536 37122845
chr11 6251453 6251464 E2F6 JASPAR yes 6255995 4531 37122846
chr11 6251455 6251476 ZNF263 JASPAR yes 6255995 4519 37122847
chr11 6251458 6251479 ZNF263 JASPAR yes 6255995 4516 37122848
chr11 6251464 6251474 SP1 JASPAR yes 6255995 4521 37122849
chr11 6251466 6251471 ETS2 TRANSFAC yes 6255995 4524 37122850
chr11 6251472 6251477 GATA2 JASPAR yes 6255995 4518 37122851
chr11 6251503 6251521 NR3C1 JASPAR yes 6255995 4474 37122852
chr11 6251515 6251530 STAT1 JASPAR yes 6255995 4465 37122853
chr11 6251517 6251528 STAT1 JASPAR yes 6255995 4467 37122854
chr11 6251517 6251528 STAT3 JASPAR yes 6255995 4467 37122855
chr11 6251529 6251533 ESR1 TRANSFAC yes 6255995 4462 37122856
chr11 6251547 6251560 SMAD2 JASPAR yes 6255995 4435 37122857
chr11 6251586 6251596 EMX1 JASPAR yes 6255995 4399 37122858
chr11 6251586 6251596 EMX2 JASPAR yes 6255995 4399 37122859
chr11 6251586 6251596 EVX2 JASPAR yes 6255995 4399 37122860
chr11 6251586 6251596 GBX1 JASPAR yes 6255995 4399 37122861
chr11 6251586 6251596 GBX2 JASPAR yes 6255995 4399 37122862
chr11 6251586 6251596 GSX1 JASPAR yes 6255995 4399 37122863
chr11 6251586 6251596 HOXA2 JASPAR yes 6255995 4399 37122864
chr11 6251586 6251596 HOXB2 JASPAR yes 6255995 4399 37122865
chr11 6251586 6251596 HOXB3 JASPAR yes 6255995 4399 37122866
chr11 6251586 6251596 LHX2 JASPAR yes 6255995 4399 37122867
chr11 6251586 6251596 LHX6 JASPAR yes 6255995 4399 37122868
chr11 6251586 6251596 MEOX1 JASPAR yes 6255995 4399 37122869
chr11 6251586 6251596 MEOX2 JASPAR yes 6255995 4399 37122870
chr11 6251586 6251596 NOTO JASPAR yes 6255995 4399 37122871
chr11 6251586 6251596 POU6F1 JASPAR yes 6255995 4399 37122872
chr11 6251587 6251595 DLX6 JASPAR yes 6255995 4400 37122873
chr11 6251587 6251595 EN1 JASPAR yes 6255995 4400 37122874
chr11 6251587 6251595 LBX1 JASPAR yes 6255995 4400 37122875
chr11 6251587 6251595 PAX4 JASPAR yes 6255995 4400 37122876
chr11 6251587 6251595 PDX1 JASPAR yes 6255995 4400 37122877
chr11 6251587 6251595 VAX1 JASPAR yes 6255995 4400 37122878
chr11 6251587 6251595 VAX2 JASPAR yes 6255995 4400 37122879
chr11 6251587 6251595 VSX1 JASPAR yes 6255995 4400 37122880
chr11 6251587 6251595 VSX2 JASPAR yes 6255995 4400 37122881
chr11 6251589 6251597 HOXA5 JASPAR yes 6255995 4398 37122882
chr11 6251618 6251634 RFX4 JASPAR yes 6255995 4361 37122883
chr11 6251627 6251641 SPI1 JASPAR yes 6255995 4354 37122884
chr11 6251643 6251653 SREBF2 JASPAR yes 6255995 4342 37122885
chr11 6251643 6251657 RORA JASPAR yes 6255995 4338 37122886
chr11 6251670 6251676 SOX10 JASPAR yes 6255995 4319 37122887
chr11 6251675 6251686 NFKB1 JASPAR yes 6255995 4309 37122888
chr11 6251679 6251698 PAX5 JASPAR yes 6255995 4297 37122889
chr11 6251680 6251700 RREB1 JASPAR yes 6255995 4295 37122890
chr11 6251681 6251701 RREB1 JASPAR yes 6255995 4294 37122891
chr11 6251684 6251704 RREB1 JASPAR yes 6255995 4291 37122892
chr11 6251685 6251705 RREB1 JASPAR yes 6255995 4290 37122893
chr11 6251687 6251702 RUNX2 JASPAR yes 6255995 4293 37122894
chr11 6251688 6251708 RREB1 JASPAR yes 6255995 4287 37122895
chr11 6251690 6251710 RREB1 JASPAR yes 6255995 4285 37122896
chr11 6251701 6251718 BCL6B JASPAR yes 6255995 4277 37122897
chr11 6251737 6251741 YY1 TRANSFAC yes 6255995 4254 37122898
chr11 6251743 6251764 ZNF263 JASPAR yes 6255995 4231 37122899
chr11 6251751 6251758 NFATC2 JASPAR yes 6255995 4237 37122900
chr11 6251787 6251791 H4TF2 TRANSFAC yes 6255995 4204 37122901
chr11 6251790 6251811 ZNF263 JASPAR yes 6255995 4184 37122902
chr11 6251802 6251813 E2F6 JASPAR yes 6255995 4182 37122903
chr11 6251821 6251835 SPI1 JASPAR yes 6255995 4160 37122904
chr11 6251864 6251868 H4TF2 TRANSFAC yes 6255995 4127 37122905
chr11 6251871 6251875 H1TF2 TRANSFAC yes 6255995 4120 37122906
chr11 6251871 6251875 NFE TRANSFAC yes 6255995 4120 37122907
chr11 6251871 6251875 SRF TRANSFAC yes 6255995 4120 37122908
chr11 6251878 6251892 IRF7 JASPAR yes 6255995 4103 37122909
chr11 6251878 6251892 IRF8 JASPAR yes 6255995 4103 37122910
chr11 6251879 6251897 IRF2 JASPAR yes 6255995 4098 37122911
chr11 6251955 6251962 MEIS1 JASPAR yes 6255995 4033 37122912
chr11 6251955 6251963 MEIS2 JASPAR yes 6255995 4032 37122913
chr11 6251969 6251990 IRF1 JASPAR yes 6255995 4005 37122914
chr11 6251973 6251987 STAT1 JASPAR yes 6255995 4008 37122915
chr11 6251973 6251988 PRDM1 JASPAR yes 6255995 4007 37122916
chr11 6251973 6251988 STAT2 JASPAR yes 6255995 4007 37122917
chr11 6251973 6251993 PPARG JASPAR yes 6255995 4002 37122918
chr11 6251978 6251992 IRF8 JASPAR yes 6255995 4003 37122919
chr11 6252000 6252017 RARA JASPAR yes 6255995 3978 37122920
chr11 6252001 6252006 GATA2 JASPAR yes 6255995 3989 37122921
chr11 6252001 6252016 PRDM1 JASPAR yes 6255995 3979 37122922
chr11 6252001 6252016 STAT2 JASPAR yes 6255995 3979 37122923
chr11 6252005 6252010 ETS2 TRANSFAC yes 6255995 3985 37122924
chr11 6252019 6252023 LFA1 TRANSFAC yes 6255995 3972 37122925
chr11 6252034 6252046 TEAD1 JASPAR yes 6255995 3949 37122926
chr11 6252035 6252043 TEAD3 JASPAR yes 6255995 3952 37122927
chr11 6252046 6252053 SPIB JASPAR yes 6255995 3942 37122928
chr11 6252046 6252057 FLI1 JASPAR yes 6255995 3938 37122929
chr11 6252062 6252068 SOX10 JASPAR yes 6255995 3927 37122930
chr11 6252067 6252072 H4TF1 TRANSFAC yes 6255995 3923 37122931
chr11 6252074 6252089 MEF2C JASPAR yes 6255995 3906 37122932
chr11 6252081 6252097 SOX8 JASPAR yes 6255995 3898 37122933
chr11 6252097 6252117 PPARG JASPAR yes 6255995 3878 37122934
chr11 6252107 6252116 SRY JASPAR yes 6255995 3879 37122935
chr11 6252115 6252129 POU1F1 JASPAR yes 6255995 3866 37122936
chr11 6252175 6252185 BARHL2 JASPAR yes 6255995 3810 37122937
chr11 6252176 6252191 JUND JASPAR yes 6255995 3804 37122938
chr11 6252177 6252190 JUN JASPAR yes 6255995 3805 37122939
chr11 6252178 6252191 ATF4 JASPAR yes 6255995 3804 37122940
chr11 6252181 6252199 SRF JASPAR yes 6255995 3796 37122941
chr11 6252183 6252201 SRF JASPAR yes 6255995 3794 37122942
chr11 6252189 6252200 CEBPA JASPAR yes 6255995 3795 37122943
chr11 6252215 6252230 AR JASPAR yes 6255995 3765 37122944
chr11 6252221 6252227 SOX10 JASPAR yes 6255995 3768 37122945
chr11 6252248 6252263 NR2C2 JASPAR yes 6255995 3732 37122946
chr11 6252265 6252276 FOXH1 JASPAR yes 6255995 3719 37122947
chr11 6252266 6252281 MEF2C JASPAR yes 6255995 3714 37122948
chr11 6252269 6252273 YY1 TRANSFAC yes 6255995 3722 37122949
chr11 6252318 6252334 SOX8 JASPAR yes 6255995 3661 37122950
chr11 6252328 6252337 SRY JASPAR yes 6255995 3658 37122951
chr11 6252335 6252341 TBP TRANSFAC yes 6255995 3654 37122952
chr11 6252347 6252357 SREBF1 JASPAR yes 6255995 3638 37122953
chr11 6252347 6252357 SREBF2 JASPAR yes 6255995 3638 37122954
chr11 6252350 6252367 RXRA JASPAR yes 6255995 3628 37122955
chr11 6252353 6252363 MZF1 JASPAR yes 6255995 3632 37122956
chr11 6252376 6252383 MEIS1 JASPAR yes 6255995 3612 37122957
chr11 6252387 6252398 DMRT3 JASPAR yes 6255995 3597 37122958
chr11 6252413 6252427 GATA2 JASPAR yes 6255995 3568 37122959
chr11 6252415 6252422 GATA3 TRANSFAC yes 6255995 3573 37122960
chr11 6252415 6252423 GATA5 JASPAR yes 6255995 3572 37122961
chr11 6252418 6252421 MYB TRANSFAC yes 6255995 3574 37122962
chr11 6252438 6252451 HSF2 JASPAR yes 6255995 3544 37122963
chr11 6252447 6252462 HNF1A JASPAR yes 6255995 3533 37122964
chr11 6252448 6252461 HNF1B JASPAR yes 6255995 3534 37122965
chr11 6252455 6252460 MYB TRANSFAC yes 6255995 3535 37122966
chr11 6252486 6252492 TCF4 TRANSFAC yes 6255995 3503 37122967
chr11 6252487 6252499 PKNOX1 JASPAR yes 6255995 3496 37122968
chr11 6252487 6252499 TGIF2 JASPAR yes 6255995 3496 37122969
chr11 6252520 6252526 GATA3 JASPAR yes 6255995 3469 37122970
chr11 6252527 6252532 GATA2 JASPAR yes 6255995 3463 37122971
chr11 6252532 6252541 THAP1 JASPAR yes 6255995 3454 37122972
chr11 6252535 6252539 LFA1 TRANSFAC yes 6255995 3456 37122973
chr11 6252554 6252558 LFA1 TRANSFAC yes 6255995 3437 37122974
chr11 6252570 6252585 MEF2C JASPAR yes 6255995 3410 37122975
chr11 6252580 6252592 POU2F1 JASPAR yes 6255995 3403 37122976
chr11 6252580 6252593 POU3F3 JASPAR yes 6255995 3402 37122977
chr11 6252581 6252593 POU3F1 JASPAR yes 6255995 3402 37122978
chr11 6252581 6252593 POU3F2 JASPAR yes 6255995 3402 37122979
chr11 6252612 6252626 ONECUT1 JASPAR yes 6255995 3369 37122980
chr11 6252612 6252626 ONECUT2 JASPAR yes 6255995 3369 37122981
chr11 6252612 6252626 ONECUT3 JASPAR yes 6255995 3369 37122982
chr11 6252615 6252625 CUX2 JASPAR yes 6255995 3370 37122983
chr11 6252616 6252630 FOXF2 JASPAR yes 6255995 3365 37122984
chr11 6252617 6252628 FOXH1 JASPAR yes 6255995 3367 37122985
chr11 6252617 6252632 FOXA1 JASPAR yes 6255995 3363 37122986
chr11 6252619 6252631 FOXI1 JASPAR yes 6255995 3364 37122987
chr11 6252621 6252629 FOXG1 JASPAR yes 6255995 3366 37122988
chr11 6252643 6252660 ESR1 JASPAR yes 6255995 3335 37122989
chr11 6252664 6252670 SOX10 JASPAR yes 6255995 3325 37122990
chr11 6252671 6252681 MEOX2 JASPAR yes 6255995 3314 37122991
chr11 6252678 6252688 POU6F2 JASPAR yes 6255995 3307 37122992
chr11 6252682 6252686 YY1 TRANSFAC yes 6255995 3309 37122993
chr11 6252689 6252710 IRF1 JASPAR yes 6255995 3285 37122994
chr11 6252690 6252702 FOXC2 JASPAR yes 6255995 3293 37122995
chr11 6252691 6252702 FOXC1 JASPAR yes 6255995 3293 37122996
chr11 6252691 6252706 PRDM1 JASPAR yes 6255995 3289 37122997
chr11 6252692 6252696 YY1 TRANSFAC yes 6255995 3299 37122998
chr11 6252692 6252706 STAT1 JASPAR yes 6255995 3289 37122999
chr11 6252693 6252714 IRF1 JASPAR yes 6255995 3281 37123000
chr11 6252694 6252709 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3286 37123001
chr11 6252694 6252715 IRF1 JASPAR yes 6255995 3280 37123002
chr11 6252695 6252716 IRF1 JASPAR yes 6255995 3279 37123003
chr11 6252696 6252711 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3284 37123004
chr11 6252696 6252717 IRF1 JASPAR yes 6255995 3278 37123005
chr11 6252697 6252718 IRF1 JASPAR yes 6255995 3277 37123006
chr11 6252698 6252713 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3282 37123007
chr11 6252698 6252719 IRF1 JASPAR yes 6255995 3276 37123008
chr11 6252699 6252714 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3281 37123009
chr11 6252699 6252720 IRF1 JASPAR yes 6255995 3275 37123010
chr11 6252700 6252715 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3280 37123011
chr11 6252700 6252721 IRF1 JASPAR yes 6255995 3274 37123012
chr11 6252701 6252716 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3279 37123013
chr11 6252701 6252722 IRF1 JASPAR yes 6255995 3273 37123014
chr11 6252702 6252717 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3278 37123015
chr11 6252702 6252723 IRF1 JASPAR yes 6255995 3272 37123016
chr11 6252703 6252718 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3277 37123017
chr11 6252704 6252719 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3276 37123018
chr11 6252705 6252720 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3275 37123019
chr11 6252706 6252721 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3274 37123020
chr11 6252707 6252722 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3273 37123021
chr11 6252708 6252723 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3272 37123022
chr11 6252709 6252724 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3271 37123023
chr11 6252710 6252725 FOXP1 JASPAR yes 6255995 3270 37123024
chr11 6252711 6252731 RREB1 JASPAR yes 6255995 3264 37123025
chr11 6252724 6252729 SP1 TRANSFAC yes 6255995 3266 37123026
chr11 6252727 6252732 SP1 TRANSFAC yes 6255995 3263 37123027
chr11 6252727 6252745 ESR1 JASPAR yes 6255995 3250 37123028
chr11 6252728 6252743 ESR2 JASPAR yes 6255995 3252 37123029
chr11 6252734 6252738 NFE TRANSFAC yes 6255995 3257 37123030
chr11 6252746 6252755 NKX2-8 JASPAR yes 6255995 3240 37123031
chr11 6252756 6252766 SREBF1 JASPAR yes 6255995 3229 37123032
chr11 6252756 6252766 SREBF2 JASPAR yes 6255995 3229 37123033
chr11 6252757 6252765 MGA JASPAR yes 6255995 3230 37123034
chr11 6252757 6252772 JUND JASPAR yes 6255995 3223 37123035
chr11 6252759 6252773 ATF7 JASPAR yes 6255995 3222 37123036
chr11 6252760 6252772 JDP2 JASPAR yes 6255995 3223 37123037
chr11 6252760 6252775 JUND JASPAR yes 6255995 3220 37123038
chr11 6252761 6252769 NR4A2 JASPAR yes 6255995 3226 37123039
chr11 6252761 6252774 JUN JASPAR yes 6255995 3221 37123040
chr11 6252762 6252770 CREB1 JASPAR yes 6255995 3225 37123041
chr11 6252768 6252785 ESR1 JASPAR yes 6255995 3210 37123042
chr11 6252785 6252798 TFAP2B JASPAR yes 6255995 3197 37123043
chr11 6252785 6252798 TFAP2C JASPAR yes 6255995 3197 37123044
chr11 6252805 6252816 E2F6 JASPAR yes 6255995 3179 37123045
chr11 6252808 6252816 TBX15 JASPAR yes 6255995 3179 37123046
chr11 6252837 6252853 T JASPAR yes 6255995 3142 37123047
chr11 6252853 6252861 TBX5 JASPAR yes 6255995 3134 37123048
chr11 6252853 6252862 ZEB1 JASPAR yes 6255995 3133 37123049
chr11 6252853 6252866 ZBTB18 JASPAR yes 6255995 3129 37123050
chr11 6252854 6252864 ID4 JASPAR yes 6255995 3131 37123051
chr11 6252854 6252864 TCF3 JASPAR yes 6255995 3131 37123052
chr11 6252854 6252864 TCF4 JASPAR yes 6255995 3131 37123053
chr11 6252856 6252861 USF2 TRANSFAC yes 6255995 3134 37123054
chr11 6252868 6252888 RREB1 JASPAR yes 6255995 3107 37123055
chr11 6252869 6252889 RREB1 JASPAR yes 6255995 3106 37123056
chr11 6252870 6252890 RREB1 JASPAR yes 6255995 3105 37123057
chr11 6252872 6252877 SP1 TRANSFAC yes 6255995 3118 37123058
chr11 6252872 6252892 RREB1 JASPAR yes 6255995 3103 37123059
chr11 6252873 6252893 RREB1 JASPAR yes 6255995 3102 37123060
chr11 6252874 6252894 RREB1 JASPAR yes 6255995 3101 37123061
chr11 6252875 6252895 RREB1 JASPAR yes 6255995 3100 37123062
chr11 6252877 6252897 RREB1 JASPAR yes 6255995 3098 37123063
chr11 6252882 6252894 ZBTB7B JASPAR yes 6255995 3101 37123064
chr11 6252882 6252894 ZBTB7C JASPAR yes 6255995 3101 37123065
chr11 6252882 6252897 RUNX2 JASPAR yes 6255995 3098 37123066
chr11 6252892 6252902 HOXA13 JASPAR yes 6255995 3093 37123067
chr11 6252892 6252902 HOXB13 JASPAR yes 6255995 3093 37123068
chr11 6252892 6252902 HOXD13 JASPAR yes 6255995 3093 37123069
chr11 6252892 6252903 HOXA10 JASPAR yes 6255995 3092 37123070
chr11 6252893 6252902 CDX1 JASPAR yes 6255995 3093 37123071
chr11 6252893 6252904 CDX2 JASPAR yes 6255995 3091 37123072
chr11 6252901 6252921 RREB1 JASPAR yes 6255995 3074 37123073
chr11 6252904 6252924 RREB1 JASPAR yes 6255995 3071 37123074
chr11 6252924 6252934 SP1 JASPAR yes 6255995 3061 37123075
chr11 6253012 6253023 FOSL2 JASPAR yes 6255995 2972 37123076
chr11 6253022 6253027 SP1 TRANSFAC yes 6255995 2968 37123077
chr11 6253029 6253046 ZNF410 JASPAR yes 6255995 2949 37123078
chr11 6253038 6253056 IRF2 JASPAR yes 6255995 2939 37123079
chr11 6253041 6253052 FOXB1 JASPAR yes 6255995 2943 37123080
chr11 6253041 6253052 FOXC1 JASPAR yes 6255995 2943 37123081
chr11 6253042 6253046 YY1 TRANSFAC yes 6255995 2949 37123082
chr11 6253050 6253054 YY1 TRANSFAC yes 6255995 2941 37123083
chr11 6253057 6253061 YY1 TRANSFAC yes 6255995 2934 37123084
chr11 6253066 6253080 IRF7 JASPAR yes 6255995 2915 37123085
chr11 6253071 6253076 MYB TRANSFAC yes 6255995 2919 37123086
chr11 6253081 6253089 FOXO3 JASPAR yes 6255995 2906 37123087
chr11 6253090 6253103 SMAD2 JASPAR yes 6255995 2892 37123088
chr11 6253117 6253131 EBF1 JASPAR yes 6255995 2864 37123089
chr11 6253119 6253130 EBF1 JASPAR yes 6255995 2865 37123090
chr11 6253138 6253154 POU4F3 JASPAR yes 6255995 2841 37123091
chr11 6253140 6253154 POU4F1 JASPAR yes 6255995 2841 37123092
chr11 6253157 6253174 ZNF410 JASPAR yes 6255995 2821 37123093
chr11 6253159 6253164 GATA2 JASPAR yes 6255995 2831 37123094
chr11 6253160 6253171 CDX2 JASPAR yes 6255995 2824 37123095
chr11 6253162 6253171 CDX1 JASPAR yes 6255995 2824 37123096
chr11 6253162 6253172 HOXA13 JASPAR yes 6255995 2823 37123097
chr11 6253162 6253172 HOXB13 JASPAR yes 6255995 2823 37123098
chr11 6253162 6253172 HOXD13 JASPAR yes 6255995 2823 37123099
chr11 6253208 6253212 YY1 TRANSFAC yes 6255995 2783 37123100
chr11 6253242 6253251 NKX3-2 JASPAR yes 6255995 2744 37123101
chr11 6253243 6253251 ISL2 JASPAR yes 6255995 2744 37123102
chr11 6253266 6253282 SRF JASPAR yes 6255995 2713 37123103
chr11 6253276 6253292 POU4F2 JASPAR yes 6255995 2703 37123104
chr11 6253276 6253292 POU4F3 JASPAR yes 6255995 2703 37123105
chr11 6253279 6253289 BARHL2 JASPAR yes 6255995 2706 37123106
chr11 6253279 6253293 POU4F1 JASPAR yes 6255995 2702 37123107
chr11 6253279 6253294 HNF1A JASPAR yes 6255995 2701 37123108
chr11 6253280 6253293 HNF1B JASPAR yes 6255995 2702 37123109
chr11 6253281 6253291 PAX3 JASPAR yes 6255995 2704 37123110
chr11 6253281 6253291 PAX7 JASPAR yes 6255995 2704 37123111
chr11 6253281 6253293 HNF1B JASPAR yes 6255995 2702 37123112
chr11 6253289 6253292 MYB TRANSFAC yes 6255995 2703 37123113
chr11 6253295 6253315 TP53 JASPAR yes 6255995 2680 37123114
chr11 6253302 6253314 GRHL1 JASPAR yes 6255995 2681 37123115
chr11 6253312 6253333 ZNF263 JASPAR yes 6255995 2662 37123116
chr11 6253313 6253317 NFE TRANSFAC yes 6255995 2678 37123117
chr11 6253313 6253318 GATA1 TRANSFAC yes 6255995 2677 37123118
chr11 6253313 6253319 GATA3 JASPAR yes 6255995 2676 37123119
chr11 6253315 6253336 ZNF263 JASPAR yes 6255995 2659 37123120
chr11 6253371 6253382 DMRT3 JASPAR yes 6255995 2613 37123121
chr11 6253385 6253395 PAX3 JASPAR yes 6255995 2600 37123122
chr11 6253385 6253395 PAX7 JASPAR yes 6255995 2600 37123123
chr11 6253390 6253394 YY1 TRANSFAC yes 6255995 2601 37123124
chr11 6253394 6253401 NKX3-1 JASPAR yes 6255995 2594 37123125
chr11 6253410 6253414 YY1 TRANSFAC yes 6255995 2581 37123126
chr11 6253427 6253432 GATA2 JASPAR yes 6255995 2563 37123127
chr11 6253428 6253439 FOXA1 JASPAR yes 6255995 2556 37123128
chr11 6253429 6253441 FOXC2 JASPAR yes 6255995 2554 37123129
chr11 6253432 6253441 SRY JASPAR yes 6255995 2554 37123130
chr11 6253446 6253462 SOX4 JASPAR yes 6255995 2533 37123131
chr11 6253452 6253459 POU2F1 TRANSFAC yes 6255995 2536 37123132
chr11 6253467 6253471 YY1 TRANSFAC yes 6255995 2524 37123133
chr11 6253470 6253474 TEAD2 TRANSFAC yes 6255995 2521 37123134
chr11 6253472 6253475 MYB TRANSFAC yes 6255995 2520 37123135
SNPs associated with CNGA4[ENSG00000132259.8], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr11 6256668 rs77094397 A G 0 Esophagus 1.67508e-16 1819241
chr11 6256668 rs77094397 A G 0 Esophagus 4.33035e-11 1819241
chr11 6256668 rs77094397 A G 0 Heart 2.59519e-10 1819241
chr11 6256668 rs77094397 A G 0 Spleen 9.77543e-10 1819241
chr11 6256668 rs77094397 A G 0 Thyroid 1.06317e-20 1819241
chr11 6256668 rs77094397 A G 0 Adrenal 0.0747097 1819241
Details of CNGA4[ENSG00000132259.8]
Back to top
Genomic Location chr11:6255995-6265659[+]
TSS 6255995
Gene Name CNGA4
Ensembl ID ENSG00000132259.8
ENTREZID 1262
Uniprot
Q8IV77
Protein Name
Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4
Expression levels of CNGA4[ENSG00000132259.8]
Back to top