EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. HMGA1[ENSG00000137309.15]
Enhancers that regulate HMGA1[ENSG00000137309.15]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr6 34103896 34110734 enh72225 34204650 93916
Neural Stem Cells (H9) Embryonic Stem Cell Line (H1-hESC)
chr6 34110371 34110716 vista51667 34204650 93934
VISTA
chr6 34111450 34111793 vista51668 34204650 92857
VISTA
chr6 34112239 34112588 vista51669 34204650 92062
VISTA
chr6 34138905 34143235 enh23162 34204650 61415
Placenta
chr6 34145845 34152735 enh23163 34204650 51915
Blood (T-cell) Placenta Lung (PC-9) Thymus Epithelial (MCF-7)
chr6 34150537 34150894 vista51670 34204650 53756
VISTA
chr6 34155985 34160135 enh94644 34204650 44515
Spleen
chr6 34162125 34172429 enh72226 34204650 32221
Bone Marrow (K562) Colon (HCT116) Neural Stem Cells (H9)
chr6 34173295 34173599 vista51671 34204650 31051
VISTA
chr6 34189245 34199455 enh23164 34204650 5195
Bone Marrow (K562) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Esophagus Astrocyte Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Placenta Colon (HCT116) Uterus Pancreas (Panc1) Neural Stem Cells (H9) Thymus
chr6 34191726 34192136 vista51672 34204650 12514
VISTA
chr6 34202925 34203288 vista51673 34204650 1362
VISTA
chr6 34208365 34213130 enh84148 34204650 3715
Pancreas (Panc1) Prostate (PC-3)
chr6 34237905 34247355 enh66190 34204650 33255
Bone Marrow (K562) Liver (HepG2) Stomach Pancreas Uterus Heart
chr6 34261533 34278075 enh9062 34204650 56883
Bone Marrow (K562) Stomach Muscle (A673) Placenta Thyroid Adrenal Blood (Karpas-422) Heart
chr6 34280945 34290175 enh9063 34204650 76295
Bone Marrow (K562) Epithelial (MCF-7) Large Intestine Esophagus Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Stomach Placenta Peripheral Blood (MM.1S) Uterus Blood (Karpas-422) Lung (PC-9) Neural Stem Cells (H9) Blood (T-cell) Heart
chr6 34290525 34296970 enh23165 34204650 85875
Bone Marrow (K562) Placenta
chr6 34297565 34309455 enh9064 34204650 92915
Blood (OCI-LY7) Stomach Muscle (A673) Blood (Karpas-422) Heart Epithelial (MCF-7)
Transcript facotrs that regulate HMGA1[ENSG00000137309.15]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr6 34202496 34207014 POLR2A UCSC Txn Factor no Conserved 34204650 2154 108539794
chr6 34202685 34203265 TAF1 UCSC Txn Factor no Conserved 34204650 1385 108539795
chr6 34202934 34202943 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1707 70350662
chr6 34202939 34202951 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1699 70350663
chr6 34202941 34202950 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1700 70350664
chr6 34202946 34202950 LFA1 TRANSFAC yes 34204650 1700 70350665
chr6 34202950 34202956 SOX10 JASPAR yes 34204650 1694 70350666
chr6 34202952 34202964 YY1 JASPAR yes 34204650 1686 70350667
chr6 34202957 34202968 E2F6 JASPAR yes 34204650 1682 70350668
chr6 34202973 34202979 ZNF354C JASPAR yes 34204650 1671 70350669
chr6 34202976 34202996 RREB1 JASPAR yes 34204650 1654 70350670
chr6 34202977 34202997 RREB1 JASPAR yes 34204650 1653 70350671
chr6 34202978 34202985 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1665 70350672
chr6 34202979 34202984 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1666 70350673
chr6 34202979 34202985 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1665 70350674
chr6 34202979 34202999 RREB1 JASPAR yes 34204650 1651 70350675
chr6 34202980 34203000 RREB1 JASPAR yes 34204650 1650 70350676
chr6 34202981 34202990 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1660 70350677
chr6 34202982 34202992 SP1 JASPAR yes 34204650 1658 70350678
chr6 34202982 34203002 RREB1 JASPAR yes 34204650 1648 70350679
chr6 34202983 34203003 RREB1 JASPAR yes 34204650 1647 70350680
chr6 34202984 34202994 ZNF740 JASPAR yes 34204650 1656 70350681
chr6 34202987 34203007 RREB1 JASPAR yes 34204650 1643 70350682
chr6 34202988 34202998 SP1 JASPAR yes 34204650 1652 70350683
chr6 34202991 34203007 ZNF143 JASPAR yes 34204650 1643 70350684
chr6 34203001 34203007 SOX10 JASPAR yes 34204650 1643 70350685
chr6 34203004 34203022 ESR2 JASPAR yes 34204650 1628 70350686
chr6 34203005 34203022 ESR1 JASPAR yes 34204650 1628 70350687
chr6 34203006 34203021 ESR2 JASPAR yes 34204650 1629 70350688
chr6 34203006 34203026 ESR1 JASPAR yes 34204650 1624 70350689
chr6 34203007 34203011 LFA1 TRANSFAC yes 34204650 1639 70350690
chr6 34203014 34203019 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1631 70350691
chr6 34203014 34203020 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1630 70350692
chr6 34203016 34203037 ZNF263 JASPAR yes 34204650 1613 70350693
chr6 34203017 34203023 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1627 70350694
chr6 34203017 34203027 SP1 JASPAR yes 34204650 1623 70350695
chr6 34203042 34203048 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1602 70350696
chr6 34203042 34203052 SP1 JASPAR yes 34204650 1598 70350697
chr6 34203047 34203052 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1598 70350698
chr6 34203048 34203063 NR2C2 JASPAR yes 34204650 1587 70350699
chr6 34203048 34203069 ZNF263 JASPAR yes 34204650 1581 70350700
chr6 34203059 34203065 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1585 70350701
chr6 34203059 34203069 SP1 JASPAR yes 34204650 1581 70350702
chr6 34203059 34203069 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1581 70350703
chr6 34203063 34203075 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1575 70350704
chr6 34203063 34203075 TFAP2B JASPAR yes 34204650 1575 70350705
chr6 34203063 34203078 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1572 70350706
chr6 34203065 34203074 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1576 70350707
chr6 34203073 34203078 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1572 70350708
chr6 34203085 34203098 ELF1 JASPAR yes 34204650 1552 70350709
chr6 34203086 34203093 SPI1 JASPAR yes 34204650 1557 70350710
chr6 34203086 34203094 FEV JASPAR yes 34204650 1556 70350711
chr6 34203088 34203093 ETS2 TRANSFAC yes 34204650 1557 70350712
chr6 34203088 34203103 PRDM1 JASPAR yes 34204650 1547 70350713
chr6 34203091 34203855 MAX UCSC Txn Factor no Conserved 34204650 795 108539796
chr6 34203092 34203102 MZF1 JASPAR yes 34204650 1548 70350714
chr6 34203092 34203104 E2F8 JASPAR yes 34204650 1546 70350715
chr6 34203095 34203101 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1549 70350716
chr6 34203103 34203109 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1541 70350717
chr6 34203104 34203109 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1541 70350718
chr6 34203114 34203124 NFKB1 JASPAR yes 34204650 1526 70350719
chr6 34203114 34203125 NFKB1 JASPAR yes 34204650 1525 70350720
chr6 34203118 34203133 RFX5 JASPAR yes 34204650 1517 70350721
chr6 34203119 34203464 E2F6 UCSC Txn Factor no Conserved 34204650 1186 108539797
chr6 34203137 34203142 USF2 TRANSFAC yes 34204650 1508 70350722
chr6 34203147 34203157 SP1 JASPAR yes 34204650 1493 70350723
chr6 34203148 34203156 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1494 70350724
chr6 34203148 34203157 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1493 70350725
chr6 34203148 34203158 SP1 JASPAR yes 34204650 1492 70350726
chr6 34203149 34203154 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1496 70350727
chr6 34203149 34203160 E2F4 JASPAR yes 34204650 1490 70350728
chr6 34203150 34203155 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1495 70350729
chr6 34203150 34203156 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1494 70350730
chr6 34203156 34203167 NRF1 JASPAR yes 34204650 1483 70350731
chr6 34203164 34203179 ZIC4 JASPAR yes 34204650 1471 70350732
chr6 34203170 34203176 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1474 70350733
chr6 34203171 34203176 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1474 70350734
chr6 34203177 34203186 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1464 70350735
chr6 34203201 34203216 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1434 70350736
chr6 34203201 34203216 TFAP2C JASPAR yes 34204650 1434 70350737
chr6 34203203 34203215 INSM1 JASPAR yes 34204650 1435 70350738
chr6 34203204 34203215 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1435 70350739
chr6 34203205 34203214 TFAP2A JASPAR yes 34204650 1436 70350740
chr6 34203222 34203236 PLAG1 JASPAR yes 34204650 1414 70350741
chr6 34203222 34203236 RXRB JASPAR yes 34204650 1414 70350742
chr6 34203222 34203236 RXRG JASPAR yes 34204650 1414 70350743
chr6 34203222 34203237 LEF1 JASPAR yes 34204650 1413 70350744
chr6 34203222 34203237 NR2C2 JASPAR yes 34204650 1413 70350745
chr6 34203223 34203237 TCF7L2 JASPAR yes 34204650 1413 70350746
chr6 34203240 34203604 TEAD4 UCSC Txn Factor no Conserved 34204650 1046 108539798
chr6 34203255 34203266 E2F4 JASPAR yes 34204650 1384 70350747
chr6 34203255 34203266 E2F6 JASPAR yes 34204650 1384 70350748
chr6 34203255 34203276 ZNF263 JASPAR yes 34204650 1374 70350749
chr6 34203256 34203267 E2F1 JASPAR yes 34204650 1383 70350750
chr6 34203256 34203268 E2F8 JASPAR yes 34204650 1382 70350751
chr6 34203260 34203265 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1385 70350752
chr6 34203269 34203277 WT1 TRANSFAC yes 34204650 1373 70350753
chr6 34203271 34203280 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1370 70350754
chr6 34203272 34203278 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1372 70350755
chr6 34203272 34203282 SP1 JASPAR yes 34204650 1368 70350756
chr6 34203273 34203280 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1370 70350757
chr6 34203274 34203279 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1371 70350758
chr6 34203274 34203280 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1370 70350759
chr6 34203274 34203281 SP1 TRANSFAC yes 34204650 1369 70350760
chr6 34208370 34208376 SP1 TRANSFAC yes 34204650 3720 101197786
chr6 34208382 34208386 LFA1 TRANSFAC yes 34204650 3732 101197787
chr6 34208394 34208409 TFAP2A JASPAR yes 34204650 3744 101197788
chr6 34208394 34208409 TFAP2C JASPAR yes 34204650 3744 101197789
chr6 34208396 34208405 TFAP2A JASPAR yes 34204650 3746 101197790
chr6 34208400 34208414 PLAG1 JASPAR yes 34204650 3750 101197791
chr6 34208401 34208406 SP1 TRANSFAC yes 34204650 3751 101197792
chr6 34208402 34208416 EBF1 JASPAR yes 34204650 3752 101197793
chr6 34208403 34208414 EBF1 JASPAR yes 34204650 3753 101197794
chr6 34208404 34208415 EBF1 JASPAR yes 34204650 3754 101197795
chr6 34208438 34208459 ZNF263 JASPAR yes 34204650 3788 101197796
chr6 34208439 34208459 RREB1 JASPAR yes 34204650 3789 101197797
chr6 34208440 34208448 TBX5 JASPAR yes 34204650 3790 101197798
chr6 34208446 34208467 ZNF263 JASPAR yes 34204650 3796 101197799
chr6 34208449 34208470 ZNF263 JASPAR yes 34204650 3799 101197800
chr6 34208478 34208490 FOXI1 JASPAR yes 34204650 3828 101197801
chr6 34208502 34208506 NFE TRANSFAC yes 34204650 3852 101197802
chr6 34208502 34208515 SMAD2 JASPAR yes 34204650 3852 101197803
chr6 34208520 34208526 YY1 JASPAR yes 34204650 3870 101197804
chr6 34208522 34208543 ZNF263 JASPAR yes 34204650 3872 101197805
chr6 34208525 34208546 ZNF263 JASPAR yes 34204650 3875 101197806
chr6 34208531 34208541 FIGLA JASPAR yes 34204650 3881 101197807
chr6 34208531 34208541 TCF3 JASPAR yes 34204650 3881 101197808
chr6 34208532 34208541 SNAI2 JASPAR yes 34204650 3882 101197809
chr6 34208533 34208538 USF2 TRANSFAC yes 34204650 3883 101197810
chr6 34208551 34208556 ETS2 TRANSFAC yes 34204650 3901 101197811
chr6 34208554 34208565 BATF JASPAR yes 34204650 3904 101197812
chr6 34208568 34208583 HNF4A JASPAR yes 34204650 3918 101197813
chr6 34208589 34208596 E2F1 TRANSFAC yes 34204650 3939 101197814
chr6 34208598 34208611 ELF1 JASPAR yes 34204650 3948 101197815
chr6 34208619 34208638 REST JASPAR yes 34204650 3969 101197816
chr6 34208627 34208632 SP1 TRANSFAC yes 34204650 3977 101197817
chr6 34208627 34208634 SP1 TRANSFAC yes 34204650 3977 101197818
chr6 34208627 34208637 SP1 JASPAR yes 34204650 3977 101197819
chr6 34208634 34208638 LFA1 TRANSFAC yes 34204650 3984 101197820
chr6 34208659 34208678 REST JASPAR yes 34204650 4009 101197821
chr6 34208660 34208677 BCL6B JASPAR yes 34204650 4010 101197822
chr6 34208686 34208697 USF1 JASPAR yes 34204650 4036 101197823
chr6 34208689 34208698 ZEB1 JASPAR yes 34204650 4039 101197824
chr6 34208691 34208696 SP1 TRANSFAC yes 34204650 4041 101197825
chr6 34208706 34208712 TCF4 TRANSFAC yes 34204650 4056 101197826
chr6 34208724 34208737 TFAP2B JASPAR yes 34204650 4074 101197827
chr6 34208724 34208737 TFAP2C JASPAR yes 34204650 4074 101197828
chr6 34208728 34208743 RFX5 JASPAR yes 34204650 4078 101197829
chr6 34208765 34208783 TP73 JASPAR yes 34204650 4115 101197830
chr6 34208766 34208781 TP53 JASPAR yes 34204650 4116 101197831
chr6 34208772 34208788 ZNF143 JASPAR yes 34204650 4122 101197832
chr6 34208822 34208833 E2F6 JASPAR yes 34204650 4172 101197833
chr6 34208825 34208833 TBX15 JASPAR yes 34204650 4175 101197834
chr6 34208825 34208834 ZEB1 JASPAR yes 34204650 4175 101197835
chr6 34208826 34208836 FIGLA JASPAR yes 34204650 4176 101197836
chr6 34208826 34208836 TCF3 JASPAR yes 34204650 4176 101197837
chr6 34208826 34208836 TCF4 JASPAR yes 34204650 4176 101197838
chr6 34208827 34208836 SNAI2 JASPAR yes 34204650 4177 101197839
chr6 34208828 34208833 USF2 TRANSFAC yes 34204650 4178 101197840
chr6 34208828 34208847 REST JASPAR yes 34204650 4178 101197841
chr6 34208843 34208849 NFE2 TRANSFAC yes 34204650 4193 101197842
chr6 34208862 34208866 ESR1 TRANSFAC yes 34204650 4212 101197843
chr6 34208876 34208895 REST JASPAR yes 34204650 4226 101197844
chr6 34208881 34208892 EBF1 JASPAR yes 34204650 4231 101197845
chr6 34208897 34208902 SP1 TRANSFAC yes 34204650 4247 101197846
chr6 34208928 34208932 H1TF2 TRANSFAC yes 34204650 4278 101197847
chr6 34208928 34208932 NFE TRANSFAC yes 34204650 4278 101197848
chr6 34208928 34208932 SRF TRANSFAC yes 34204650 4278 101197849
chr6 34208955 34208969 NR2F1 JASPAR yes 34204650 4305 101197850
chr6 34208960 34208973 NR2F1 JASPAR yes 34204650 4310 101197851
chr6 34208962 34208970 NR4A2 JASPAR yes 34204650 4312 101197852
chr6 34208963 34208978 ESR2 JASPAR yes 34204650 4313 101197853
chr6 34208964 34208968 ESR1 TRANSFAC yes 34204650 4314 101197854
chr6 34208964 34208974 MAX JASPAR yes 34204650 4314 101197855
chr6 34208964 34208975 USF1 JASPAR yes 34204650 4314 101197856
chr6 34208964 34208975 USF2 JASPAR yes 34204650 4314 101197857
chr6 34208965 34208975 TFEB JASPAR yes 34204650 4315 101197858
chr6 34208965 34208975 TFEC JASPAR yes 34204650 4315 101197859
chr6 34208984 34209000 E2F2 JASPAR yes 34204650 4334 101197860
chr6 34209003 34209013 NFATC3 JASPAR yes 34204650 4353 101197861
chr6 34209007 34209018 FOXH1 JASPAR yes 34204650 4357 101197862
chr6 34209008 34209012 H1TF2 TRANSFAC yes 34204650 4358 101197863
chr6 34209008 34209012 NFE TRANSFAC yes 34204650 4358 101197864
chr6 34209008 34209012 SRF TRANSFAC yes 34204650 4358 101197865
chr6 34209011 34209017 ZNF354C JASPAR yes 34204650 4361 101197866
chr6 34209024 34209032 HOXA5 JASPAR yes 34204650 4374 101197867
chr6 34209056 34209070 IRF7 JASPAR yes 34204650 4406 101197868
chr6 34209083 34209098 HNF1A JASPAR yes 34204650 4433 101197869
chr6 34209084 34209096 HNF1B JASPAR yes 34204650 4434 101197870
chr6 34209084 34209097 HNF1B JASPAR yes 34204650 4434 101197871
chr6 34209090 34209094 YY1 TRANSFAC yes 34204650 4440 101197872
chr6 34209145 34209152 NKX3-1 JASPAR yes 34204650 4495 101197873
chr6 34209157 34209178 ZNF263 JASPAR yes 34204650 4507 101197874
chr6 34209165 34209175 ETV6 JASPAR yes 34204650 4515 101197875
chr6 34209165 34209176 ELF5 JASPAR yes 34204650 4515 101197876
chr6 34209165 34209177 EHF JASPAR yes 34204650 4515 101197877
chr6 34209165 34209178 ELF1 JASPAR yes 34204650 4515 101197878
chr6 34209165 34209179 SPI1 JASPAR yes 34204650 4515 101197879
chr6 34209165 34209179 SPIC JASPAR yes 34204650 4515 101197880
chr6 34209166 34209173 SPI1 JASPAR yes 34204650 4516 101197881
chr6 34209166 34209174 EHF JASPAR yes 34204650 4516 101197882
chr6 34209178 34209187 ZEB1 JASPAR yes 34204650 4528 101197883
chr6 34209178 34209189 TBX2 JASPAR yes 34204650 4528 101197884
chr6 34209179 34209189 TBR1 JASPAR yes 34204650 4529 101197885
chr6 34209192 34209212 TP63 JASPAR yes 34204650 4542 101197886
chr6 34209207 34209217 FIGLA JASPAR yes 34204650 4557 101197887
chr6 34209207 34209217 ID4 JASPAR yes 34204650 4557 101197888
chr6 34209207 34209217 MSC JASPAR yes 34204650 4557 101197889
chr6 34209207 34209217 MYF6 JASPAR yes 34204650 4557 101197890
chr6 34209207 34209217 TCF3 JASPAR yes 34204650 4557 101197891
chr6 34209207 34209217 TCF4 JASPAR yes 34204650 4557 101197892
chr6 34209208 34209217 SNAI2 JASPAR yes 34204650 4558 101197893
chr6 34209209 34209214 USF2 TRANSFAC yes 34204650 4559 101197894
chr6 34209210 34209216 PTF TRANSFAC yes 34204650 4560 101197895
chr6 34209241 34209254 HSF2 JASPAR yes 34204650 4591 101197896
chr6 34209250 34209254 LFA1 TRANSFAC yes 34204650 4600 101197897
chr6 34209253 34209268 TFAP2C JASPAR yes 34204650 4603 101197898
chr6 34209272 34209282 NFATC3 JASPAR yes 34204650 4622 101197899
chr6 34209275 34209289 STAT1 JASPAR yes 34204650 4625 101197900
chr6 34209275 34209290 STAT2 JASPAR yes 34204650 4625 101197901
chr6 34209275 34209293 IRF2 JASPAR yes 34204650 4625 101197902
chr6 34209279 34209284 MYB TRANSFAC yes 34204650 4629 101197903
chr6 34209305 34209310 TFAP2A TRANSFAC yes 34204650 4655 101197904
chr6 34209305 34209311 MZF1 JASPAR yes 34204650 4655 101197905
chr6 34209310 34209330 PPARG JASPAR yes 34204650 4660 101197906
chr6 34209319 34209337 RARA JASPAR yes 34204650 4669 101197907
chr6 34209348 34209354 MZF1 JASPAR yes 34204650 4698 101197908
chr6 34209353 34209359 SOX10 JASPAR yes 34204650 4703 101197909
chr6 34209376 34209389 SMAD2 JASPAR yes 34204650 4726 101197910
chr6 34209397 34209401 LFA1 TRANSFAC yes 34204650 4747 101197911
chr6 34209418 34209422 YY1 TRANSFAC yes 34204650 4768 101197912
chr6 34209423 34209427 LFA1 TRANSFAC yes 34204650 4773 101197913
chr6 34209427 34209437 ZNF740 JASPAR yes 34204650 4777 101197914
chr6 34209430 34209443 NFKB1 JASPAR yes 34204650 4780 101197915
chr6 34209431 34209442 NFKB1 JASPAR yes 34204650 4781 101197916
chr6 34209434 34209451 RARA JASPAR yes 34204650 4784 101197917
chr6 34209458 34209470 PKNOX1 JASPAR yes 34204650 4808 101197918
chr6 34209458 34209470 PKNOX2 JASPAR yes 34204650 4808 101197919
chr6 34209458 34209470 TGIF1 JASPAR yes 34204650 4808 101197920
chr6 34209458 34209470 TGIF2 JASPAR yes 34204650 4808 101197921
chr6 34209459 34209469 MSC JASPAR yes 34204650 4809 101197922
chr6 34209459 34209469 MYF6 JASPAR yes 34204650 4809 101197923
chr6 34209463 34209471 MEIS2 JASPAR yes 34204650 4813 101197924
chr6 34209463 34209471 MEIS3 JASPAR yes 34204650 4813 101197925
chr6 34209464 34209468 NFE TRANSFAC yes 34204650 4814 101197926
chr6 34209544 34209558 RXRB JASPAR yes 34204650 4894 101197927
chr6 34209544 34209558 RXRG JASPAR yes 34204650 4894 101197928
chr6 34209544 34209559 HNF4G JASPAR yes 34204650 4894 101197929
chr6 34209544 34209559 NR2C2 JASPAR yes 34204650 4894 101197930
chr6 34209550 34209556 NFE2 TRANSFAC yes 34204650 4900 101197931
chr6 34209550 34209562 INSM1 JASPAR yes 34204650 4900 101197932
chr6 34209562 34209573 DMRT3 JASPAR yes 34204650 4912 101197933
chr6 34209563 34209578 SCRT1 JASPAR yes 34204650 4913 101197934
chr6 34209575 34209584 ZEB1 JASPAR yes 34204650 4925 101197935
chr6 34209578 34209583 USF2 TRANSFAC yes 34204650 4928 101197936
chr6 34209594 34209598 NFE TRANSFAC yes 34204650 4944 101197937
chr6 34209596 34209617 REST JASPAR yes 34204650 4946 101197938
chr6 34209616 34209627 NRL JASPAR yes 34204650 4966 101197939
SNPs associated with HMGA1[ENSG00000137309.15], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 34290533 rs6924682 T G 76525 Esophagus 0.0464364 8980249
chr6 35063925 rs114616503 C T 849917 Heart 0.0948253 8985696
chr6 33920551 rs2495965 T C 284099 Pancreas 0.0908323 8977924
chr6 33851133 rs16869650 G A 353517 Spleen 0.207362 8977013
chr6 33851052 rs11759059 C A 353598 Ovary 0.381921 8977011
chr6 33863662 rs1998630 A G 340988 Liver 0.123378 8977226
chr6 33515681 rs78017122 T A 688969 Lung 0.170998 8973890
chr6 33896859 rs56286921 G A 307791 Stomach 0.318683 8977714
Details of HMGA1[ENSG00000137309.15]
Back to top
Genomic Location chr6:34204650-34214008[+]
TSS 34204650
Gene Name HMGA1
Ensembl ID ENSG00000137309.15
ENTREZID 3159
Uniprot
Q5T6U8
P17096
Protein Name
isoform CRA_b
isoform CRA_c
isoform CRA_e
HMGA1 protein
High mobility group AT-hook 1
High mobility group AT-hook 1
High mobility group AT-hook 1
High mobility group AT-hook 1
High mobility group protein HMG-I/HMG-Y
Expression levels of HMGA1[ENSG00000137309.15]
Back to top