EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. IFT122[ENSG00000163913.7]
Enhancers that regulate IFT122[ENSG00000163913.7]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr3 129060132 129067823 enh20927 129158968 91145
Placenta Colon (HCT116) Brain (SK-N-SH) Heart
chr3 129070114 129074264 enh65752 129158968 84704
Heart
chr3 129074966 129080366 enh115805 129158968 78602
Brain (SK-N-SH)
chr3 129095885 129119955 enh7528 129158968 39013
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Epithelial (MCF-7) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Brain (SK-N-SH) Astrocyte Bone (Osteoblast) Colon (HCT116) Thyroid Pancreas (Panc1) Blood (Karpas-422) Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Spleen Muscle (Myotube) Uterus Heart
chr3 129129825 129136975 enh35867 129158968 21993
Astrocyte Liver (HepG2)
chr3 129140665 129146375 enh7529 129158968 12593
Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Liver Blood (OCI-LY7) Blood (Karpas-422) Pancreas Spleen
chr3 129161185 129168235 enh70840 129158968 2217
Pancreas Neural Stem Cells (H9)
chr3 129167159 129167354 vista42405 129158968 8191
VISTA
chr3 129180710 129180864 vista42406 129158968 21742
VISTA
chr3 129189985 129194135 enh93205 129158968 31017
Liver (HepG2)
chr3 129198965 129207495 enh20928 129158968 39997
Prostate (RWPE1) Astrocyte Placenta Uterus Neural Stem Cells (H9)
chr3 129204579 129204997 vista42407 129158968 45611
VISTA
chr3 129208027 129224155 enh65753 129158968 49059
Liver (HepG2) Bone (Osteoblast) Epithelial (MCF-7) Heart
chr3 129244298 129244494 vista42408 129158968 85330
VISTA
chr3 129245035 129245230 vista42409 129158968 86067
VISTA
chr3 129245456 129245718 vista42410 129158968 86488
VISTA
Transcript facotrs that regulate IFT122[ENSG00000163913.7]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr3 129162353 129162365 TAL1 JASPAR yes 129158968 3385 5660578
chr3 129162389 129162393 H1TF2 TRANSFAC yes 129158968 3421 5660579
chr3 129162389 129162393 NFE TRANSFAC yes 129158968 3421 5660580
chr3 129162389 129162393 SRF TRANSFAC yes 129158968 3421 5660581
chr3 129162404 129162418 BATF3 JASPAR yes 129158968 3436 5660582
chr3 129162408 129162413 H4TF1 TRANSFAC yes 129158968 3440 5660583
chr3 129162408 129162419 CEBPB JASPAR yes 129158968 3440 5660584
chr3 129162408 129162420 HLF JASPAR yes 129158968 3440 5660585
chr3 129162409 129162420 CEBPA JASPAR yes 129158968 3441 5660586
chr3 129162415 129162426 PHOX2A JASPAR yes 129158968 3447 5660587
chr3 129162415 129162426 PROP1 JASPAR yes 129158968 3447 5660588
chr3 129162418 129162430 FOXI1 JASPAR yes 129158968 3450 5660589
chr3 129162421 129162425 YY1 TRANSFAC yes 129158968 3453 5660590
chr3 129162421 129162432 HOXA10 JASPAR yes 129158968 3453 5660591
chr3 129162422 129162431 CDX1 JASPAR yes 129158968 3454 5660592
chr3 129162422 129162433 CDX2 JASPAR yes 129158968 3454 5660593
chr3 129162446 129162462 ZNF143 JASPAR yes 129158968 3478 5660594
chr3 129162458 129162462 H4TF2 TRANSFAC yes 129158968 3490 5660595
chr3 129162474 129162490 SOX4 JASPAR yes 129158968 3506 5660596
chr3 129162475 129162490 SOX21 JASPAR yes 129158968 3507 5660597
chr3 129162475 129162491 SOX4 JASPAR yes 129158968 3507 5660598
chr3 129162505 129162517 MEF2A JASPAR yes 129158968 3537 5660599
chr3 129162505 129162517 MEF2B JASPAR yes 129158968 3537 5660600
chr3 129162505 129162517 MEF2D JASPAR yes 129158968 3537 5660601
chr3 129162506 129162516 MEF2A JASPAR yes 129158968 3538 5660602
chr3 129162507 129162511 TEAD2 TRANSFAC yes 129158968 3539 5660603
chr3 129162507 129162517 ALX3 JASPAR yes 129158968 3539 5660604
chr3 129162507 129162517 GSX2 JASPAR yes 129158968 3539 5660605
chr3 129162507 129162517 MNX1 JASPAR yes 129158968 3539 5660606
chr3 129162508 129162516 LMX1A JASPAR yes 129158968 3540 5660607
chr3 129162508 129162516 LMX1B JASPAR yes 129158968 3540 5660608
chr3 129162508 129162516 NKX6-1 JASPAR yes 129158968 3540 5660609
chr3 129162508 129162516 NKX6-2 JASPAR yes 129158968 3540 5660610
chr3 129162508 129162516 VAX1 JASPAR yes 129158968 3540 5660611
chr3 129162508 129162516 VAX2 JASPAR yes 129158968 3540 5660612
chr3 129162508 129162516 VSX1 JASPAR yes 129158968 3540 5660613
chr3 129162508 129162516 VSX2 JASPAR yes 129158968 3540 5660614
chr3 129162518 129162522 LFA1 TRANSFAC yes 129158968 3550 5660615
chr3 129162538 129162541 MYB TRANSFAC yes 129158968 3570 5660616
chr3 129162542 129162557 FOXP1 JASPAR yes 129158968 3574 5660617
chr3 129162560 129162564 TEAD2 TRANSFAC yes 129158968 3592 5660618
chr3 129162571 129162585 IRF7 JASPAR yes 129158968 3603 5660619
chr3 129162594 129162601 NKX3-1 JASPAR yes 129158968 3626 5660620
chr3 129162594 129162605 PROP1 JASPAR yes 129158968 3626 5660621
chr3 129162595 129162610 AR JASPAR yes 129158968 3627 5660622
chr3 129162600 129162604 YY1 TRANSFAC yes 129158968 3632 5660623
chr3 129162613 129162618 NFY TRANSFAC yes 129158968 3645 5660624
chr3 129162618 129162622 LFA1 TRANSFAC yes 129158968 3650 5660625
chr3 129162637 129162652 MEF2A JASPAR yes 129158968 3669 5660626
chr3 129162641 129162645 YY1 TRANSFAC yes 129158968 3673 5660627
chr3 129162646 129162654 EHF JASPAR yes 129158968 3678 5660628
chr3 129162648 129162663 HNF4G JASPAR yes 129158968 3680 5660629
chr3 129162672 129162686 IRF7 JASPAR yes 129158968 3704 5660630
chr3 129162691 129162705 SPIC JASPAR yes 129158968 3723 5660631
chr3 129162695 129162702 SPIB JASPAR yes 129158968 3727 5660632
chr3 129162697 129162709 TEAD1 JASPAR yes 129158968 3729 5660633
chr3 129162698 129162718 TP53 JASPAR yes 129158968 3730 5660634
chr3 129162700 129162716 SOX8 JASPAR yes 129158968 3732 5660635
chr3 129162702 129162717 TP53 JASPAR yes 129158968 3734 5660636
chr3 129162722 129162733 NFE2 JASPAR yes 129158968 3754 5660637
chr3 129162723 129162732 JDP2 JASPAR yes 129158968 3755 5660638
chr3 129162734 129162740 HiNF-A TRANSFAC yes 129158968 3766 5660639
chr3 129162754 129162771 RARA JASPAR yes 129158968 3786 5660640
chr3 129162754 129162771 RXRA JASPAR yes 129158968 3786 5660641
chr3 129162765 129162775 RORA JASPAR yes 129158968 3797 5660642
chr3 129162779 129162792 NR2F1 JASPAR yes 129158968 3811 5660643
chr3 129162781 129162789 NR4A2 JASPAR yes 129158968 3813 5660644
chr3 129162782 129162797 ESR2 JASPAR yes 129158968 3814 5660645
chr3 129162782 129162799 RARA JASPAR yes 129158968 3814 5660646
chr3 129162783 129162787 ESR1 TRANSFAC yes 129158968 3815 5660647
chr3 129162784 129162796 HNF1B JASPAR yes 129158968 3816 5660648
chr3 129162796 129162810 TCF7L2 JASPAR yes 129158968 3828 5660649
chr3 129162799 129162805 LEF1 TRANSFAC yes 129158968 3831 5660650
chr3 129162799 129162805 TCF4 TRANSFAC yes 129158968 3831 5660651
chr3 129162800 129162815 JUND JASPAR yes 129158968 3832 5660652
chr3 129162801 129162814 JUN JASPAR yes 129158968 3833 5660653
chr3 129162803 129162818 JUND JASPAR yes 129158968 3835 5660654
chr3 129162804 129162817 JUN JASPAR yes 129158968 3836 5660655
chr3 129162805 129162812 JUN TRANSFAC yes 129158968 3837 5660656
chr3 129162830 129162835 ETS2 TRANSFAC yes 129158968 3862 5660657
chr3 129162833 129162848 RUNX2 JASPAR yes 129158968 3865 5660658
chr3 129162838 129162848 TEAD1 JASPAR yes 129158968 3870 5660659
chr3 129162891 129162899 RHOXF1 JASPAR yes 129158968 3923 5660660
chr3 129162894 129162900 ZNF354C JASPAR yes 129158968 3926 5660661
chr3 129162903 129162914 FOXH1 JASPAR yes 129158968 3935 5660662
chr3 129162906 129162919 SCRT2 JASPAR yes 129158968 3938 5660663
chr3 129162906 129162921 SCRT1 JASPAR yes 129158968 3938 5660664
chr3 129162907 129162913 ZNF354C JASPAR yes 129158968 3939 5660665
chr3 129162929 129162934 GATA2 JASPAR yes 129158968 3961 5660666
chr3 129162972 129162976 NFE TRANSFAC yes 129158968 4004 5660667
chr3 129162973 129162978 GATA2 JASPAR yes 129158968 4005 5660668
chr3 129162986 129162996 TBX21 JASPAR yes 129158968 4018 5660669
chr3 129162986 129162997 TBX2 JASPAR yes 129158968 4018 5660670
chr3 129162986 129163007 IRF1 JASPAR yes 129158968 4018 5660671
chr3 129162987 129162997 TBR1 JASPAR yes 129158968 4019 5660672
chr3 129162990 129163005 PRDM1 JASPAR yes 129158968 4022 5660673
chr3 129162995 129163001 TCF4 TRANSFAC yes 129158968 4027 5660674
chr3 129163005 129163011 GATA3 JASPAR yes 129158968 4037 5660675
chr3 129163020 129163041 ZNF263 JASPAR yes 129158968 4052 5660676
chr3 129163035 129163045 MZF1 JASPAR yes 129158968 4067 5660677
chr3 129163052 129163064 YY1 JASPAR yes 129158968 4084 5660678
chr3 129163076 129163088 TGIF2 JASPAR yes 129158968 4108 5660679
chr3 129163081 129163090 NFIX JASPAR yes 129158968 4113 5660680
chr3 129163081 129163091 NFIA JASPAR yes 129158968 4113 5660681
chr3 129163083 129163089 NFIC JASPAR yes 129158968 4115 5660682
chr3 129163094 129163101 SPIB JASPAR yes 129158968 4126 5660683
chr3 129163094 129163115 ZNF263 JASPAR yes 129158968 4126 5660684
chr3 129163099 129163113 IRF7 JASPAR yes 129158968 4131 5660685
chr3 129163100 129163114 SPIC JASPAR yes 129158968 4132 5660686
chr3 129163116 129163121 ETS2 TRANSFAC yes 129158968 4148 5660687
chr3 129163116 129163124 EHF JASPAR yes 129158968 4148 5660688
chr3 129163134 129163145 RUNX1 JASPAR yes 129158968 4166 5660689
chr3 129163192 129163205 EOMES JASPAR yes 129158968 4224 5660690
chr3 129163236 129163251 RFX5 JASPAR yes 129158968 4268 5660691
chr3 129163275 129163293 NFYA JASPAR yes 129158968 4307 5660692
chr3 129163281 129163296 NFYB JASPAR yes 129158968 4313 5660693
chr3 129163295 129163314 PAX5 JASPAR yes 129158968 4327 5660694
chr3 129163297 129163301 LFA1 TRANSFAC yes 129158968 4329 5660695
chr3 129163309 129163313 NFE TRANSFAC yes 129158968 4341 5660696
chr3 129163314 129163318 NFE TRANSFAC yes 129158968 4346 5660697
chr3 129163318 129163336 NR3C1 JASPAR yes 129158968 4350 5660698
chr3 129163324 129163328 YY1 TRANSFAC yes 129158968 4356 5660699
chr3 129163327 129163339 FOXC2 JASPAR yes 129158968 4359 5660700
chr3 129163328 129163339 FOXC1 JASPAR yes 129158968 4360 5660701
chr3 129163361 129163382 IRF1 JASPAR yes 129158968 4393 5660702
chr3 129163363 129163384 IRF1 JASPAR yes 129158968 4395 5660703
chr3 129163368 129163383 FOXP1 JASPAR yes 129158968 4400 5660704
chr3 129163370 129163385 FOXP1 JASPAR yes 129158968 4402 5660705
chr3 129163371 129163386 FOXP1 JASPAR yes 129158968 4403 5660706
chr3 129163396 129163415 RFX2 JASPAR yes 129158968 4428 5660707
chr3 129163398 129163413 RFX5 JASPAR yes 129158968 4430 5660708
chr3 129163419 129163428 NF-IL6 TRANSFAC yes 129158968 4451 5660709
chr3 129163420 129163430 CEBPB JASPAR yes 129158968 4452 5660710
chr3 129163420 129163430 CEBPD JASPAR yes 129158968 4452 5660711
chr3 129163420 129163430 CEBPE JASPAR yes 129158968 4452 5660712
chr3 129163420 129163430 CEBPG JASPAR yes 129158968 4452 5660713
chr3 129163420 129163431 CEBPB JASPAR yes 129158968 4452 5660714
chr3 129163445 129163454 SP1 TRANSFAC yes 129158968 4477 5660715
chr3 129163446 129163454 SP1 TRANSFAC yes 129158968 4478 5660716
chr3 129163446 129163456 SP1 JASPAR yes 129158968 4478 5660717
chr3 129163467 129163488 ZNF263 JASPAR yes 129158968 4499 5660718
chr3 129163493 129163501 TBX15 JASPAR yes 129158968 4525 5660719
chr3 129163494 129163499 SP1 TRANSFAC yes 129158968 4526 5660720
chr3 129163498 129163513 SCRT1 JASPAR yes 129158968 4530 5660721
chr3 129163502 129163511 SNAI2 JASPAR yes 129158968 4534 5660722
chr3 129163502 129163512 FIGLA JASPAR yes 129158968 4534 5660723
chr3 129163502 129163512 ID4 JASPAR yes 129158968 4534 5660724
chr3 129163502 129163512 TCF3 JASPAR yes 129158968 4534 5660725
chr3 129163502 129163512 TCF4 JASPAR yes 129158968 4534 5660726
chr3 129163504 129163513 ZEB1 JASPAR yes 129158968 4536 5660727
chr3 129163510 129163531 REST JASPAR yes 129158968 4542 5660728
chr3 129163511 129163530 REST JASPAR yes 129158968 4543 5660729
chr3 129163516 129163526 SP1 JASPAR yes 129158968 4548 5660730
chr3 129163519 129163524 SP1 TRANSFAC yes 129158968 4551 5660731
chr3 129163533 129163548 MEF2A JASPAR yes 129158968 4565 5660732
chr3 129163534 129163549 MEF2C JASPAR yes 129158968 4566 5660733
chr3 129163535 129163547 MEF2A JASPAR yes 129158968 4567 5660734
chr3 129163535 129163547 MEF2B JASPAR yes 129158968 4567 5660735
chr3 129163535 129163547 MEF2D JASPAR yes 129158968 4567 5660736
chr3 129163537 129163541 YY1 TRANSFAC yes 129158968 4569 5660737
chr3 129163555 129163566 CEBPB JASPAR yes 129158968 4587 5660738
chr3 129163558 129163570 YY1 JASPAR yes 129158968 4590 5660739
chr3 129163587 129163600 NR2F1 JASPAR yes 129158968 4619 5660740
chr3 129163614 129163628 GLIS3 JASPAR yes 129158968 4646 5660741
chr3 129163642 129163653 FOSL2 JASPAR yes 129158968 4674 5660742
chr3 129163649 129163667 TP53 JASPAR yes 129158968 4681 5660743
chr3 129163649 129163667 TP73 JASPAR yes 129158968 4681 5660744
chr3 129163671 129163687 POU4F2 JASPAR yes 129158968 4703 5660745
chr3 129163674 129163683 SRY JASPAR yes 129158968 4706 5660746
chr3 129163676 129163679 MYB TRANSFAC yes 129158968 4708 5660747
chr3 129163684 129163696 HNF1B JASPAR yes 129158968 4716 5660748
chr3 129163685 129163699 POU4F1 JASPAR yes 129158968 4717 5660749
chr3 129163685 129163701 POU4F3 JASPAR yes 129158968 4717 5660750
chr3 129163691 129163696 MYB TRANSFAC yes 129158968 4723 5660751
chr3 129163697 129163700 MYB TRANSFAC yes 129158968 4729 5660752
chr3 129163710 129163720 HOXD13 JASPAR yes 129158968 4742 5660753
chr3 129163710 129163721 HOXA10 JASPAR yes 129158968 4742 5660754
chr3 129163719 129163724 ETS2 TRANSFAC yes 129158968 4751 5660755
chr3 129163728 129163746 ESR1 JASPAR yes 129158968 4760 5660756
chr3 129163731 129163735 ESR1 TRANSFAC yes 129158968 4763 5660757
chr3 129163758 129163772 POU4F1 JASPAR yes 129158968 4790 5660758
chr3 129163758 129163774 POU4F3 JASPAR yes 129158968 4790 5660759
chr3 129163778 129163792 RORA JASPAR yes 129158968 4810 5660760
chr3 129163783 129163803 PPARG JASPAR yes 129158968 4815 5660761
chr3 129163804 129163816 BHLHE23 JASPAR yes 129158968 4836 5660762
chr3 129163804 129163816 PKNOX1 JASPAR yes 129158968 4836 5660763
chr3 129163804 129163816 PKNOX2 JASPAR yes 129158968 4836 5660764
chr3 129163804 129163816 TGIF1 JASPAR yes 129158968 4836 5660765
chr3 129163804 129163816 TGIF2 JASPAR yes 129158968 4836 5660766
chr3 129163805 129163815 BHLHE22 JASPAR yes 129158968 4837 5660767
chr3 129163805 129163815 NEUROD2 JASPAR yes 129158968 4837 5660768
chr3 129163805 129163815 NEUROG2 JASPAR yes 129158968 4837 5660769
chr3 129163805 129163815 OLIG1 JASPAR yes 129158968 4837 5660770
chr3 129163805 129163815 OLIG2 JASPAR yes 129158968 4837 5660771
chr3 129163805 129163815 OLIG3 JASPAR yes 129158968 4837 5660772
chr3 129163808 129163819 FOXA1 JASPAR yes 129158968 4840 5660773
chr3 129163808 129163823 FOXA1 JASPAR yes 129158968 4840 5660774
chr3 129163809 129163820 FOXC1 JASPAR yes 129158968 4841 5660775
chr3 129163809 129163821 FOXC2 JASPAR yes 129158968 4841 5660776
chr3 129163811 129163817 NFIC JASPAR yes 129158968 4843 5660777
chr3 129163815 129163830 SOX21 JASPAR yes 129158968 4847 5660778
chr3 129163855 129163870 TFAP2A JASPAR yes 129158968 4887 5660779
chr3 129163855 129163870 TFAP2C JASPAR yes 129158968 4887 5660780
chr3 129163856 129163870 TLX1 JASPAR yes 129158968 4888 5660781
chr3 129163887 129163897 ETV1 JASPAR yes 129158968 4919 5660782
chr3 129163887 129163897 ETV4 JASPAR yes 129158968 4919 5660783
chr3 129163887 129163897 ETV5 JASPAR yes 129158968 4919 5660784
chr3 129163897 129163910 SMAD2 JASPAR yes 129158968 4929 5660785
chr3 129163902 129163910 MGA JASPAR yes 129158968 4934 5660786
chr3 129163902 129163910 TBX15 JASPAR yes 129158968 4934 5660787
chr3 129163902 129163910 TBX1 JASPAR yes 129158968 4934 5660788
chr3 129163902 129163910 TBX4 JASPAR yes 129158968 4934 5660789
chr3 129163902 129163910 TBX5 JASPAR yes 129158968 4934 5660790
chr3 129163903 129163912 NKX3-2 JASPAR yes 129158968 4935 5660791
chr3 129163903 129163913 NKX2-3 JASPAR yes 129158968 4935 5660792
chr3 129163904 129163912 ISL2 JASPAR yes 129158968 4936 5660793
chr3 129163950 129163963 NR2F1 JASPAR yes 129158968 4982 5660794
chr3 129163951 129163959 CREB1 JASPAR yes 129158968 4983 5660795
chr3 129163952 129163970 RARA JASPAR yes 129158968 4984 5660796
chr3 129163954 129163958 ESR1 TRANSFAC yes 129158968 4986 5660797
SNPs associated with IFT122[ENSG00000163913.7], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr3 129140738 rs60414131 A T 18230 Esophagus 1.52876e-05 7026097
chr3 129136060 rs113052965 C A 22908 Heart 3.9636e-07 7026079
chr3 129216672 rs3774774 A G 0 Heart 9.32718e-09 7026600
chr3 129109764 rs3806709 C A 49204 Breast 0.117569 7025820
chr3 128563551 rs9843124 G A 595417 Spleen 0.0183804 7022902
Details of IFT122[ENSG00000163913.7]
Back to top
Genomic Location chr3:129158968-129239198[+]
TSS 129158968
Gene Name IFT122
Ensembl ID ENSG00000163913.7
ENTREZID 55764
Uniprot
B4DST2
B3KUD1
Q9HBG6
Protein Name
Alternative protein IFT122
Intraflagellar transport protein 122 homolog
Expression levels of IFT122[ENSG00000163913.7]
Back to top