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Enhancers that regulate BEST1[ENSG00000167995.11]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr11 61616405 61623515 enh64476 61717293 93778
Muscle (A673) Brain (SK-N-MC) Heart
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Bone Marrow (K562) Cervix (HeLa-S3) Muscle (A673) Colon (HCT116) Uterus Heart Epithelial (MCF-7)
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VISTA
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VISTA
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Bone Marrow (K562) Brain (SK-N-SH) Ovary Bone (Osteoblast) Stomach Muscle (A673) Placenta Blood (Karpas-422) Pancreas Uterus Heart
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VISTA
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Placenta
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VISTA
chr11 61674625 61686555 enh13963 61717293 30738
Stomach Placenta Uterus Heart
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VISTA
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VISTA
chr11 61713558 61713889 vista10471 61717293 3404
VISTA
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Placenta Lung (PC-9)
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Blood (Karpas-422)
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Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Epithelial (MCF-7) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Ovary Stomach Thyroid Lung (PC-9) Pancreas Uterus Heart
chr11 61738760 61739751 vista10472 61717293 21467
VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Liver (HepG2) Brain (SK-N-MC) Large Intestine Ovary Bone (Osteoblast) Colon (HCT116) Uterus Muscle (Myoblast) Pancreas Muscle (Myotube) Neural Stem Cells (H9) Stomach
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VISTA
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VISTA
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Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Placenta Thyroid Lung (PC-9) Uterus Epithelial (MCF-7)
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Prostate (RWPE1) Blood (T-cell) Bone (Osteoblast) Lung Stomach Placenta Lung (PC-9) Uterus Thymus Epithelial (MCF-7)
chr11 61792928 61793609 vista10484 61717293 75635
VISTA
chr11 61798928 61803472 enh62163 61717293 81635
Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Esophagus Colon (HCT116) Lung (PC-9)
chr11 61800988 61801486 vista10485 61717293 83695
VISTA
chr11 61807063 61824450 enh13967 61717293 89770
Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Blood (OCI-LY7) Stomach Placenta Colon (HCT116) Breast Lung (PC-9) Pancreas Epithelial (MCF-7)
Transcript facotrs that regulate BEST1[ENSG00000167995.11]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr11 61721669 61721690 ZNF263 JASPAR yes 61717293 4376 39172596
chr11 61721675 61721681 TCF4 TRANSFAC yes 61717293 4382 39172597
chr11 61721680 61721690 SP1 JASPAR yes 61717293 4387 39172598
chr11 61721682 61721703 ZNF263 JASPAR yes 61717293 4389 39172599
chr11 61721683 61721695 INSM1 JASPAR yes 61717293 4390 39172600
chr11 61721683 61721704 ZNF263 JASPAR yes 61717293 4390 39172601
chr11 61721686 61721696 SP1 JASPAR yes 61717293 4393 39172602
chr11 61721687 61721697 SP1 JASPAR yes 61717293 4394 39172603
chr11 61721689 61721695 NFE2 TRANSFAC yes 61717293 4396 39172604
chr11 61721690 61721702 INSM1 JASPAR yes 61717293 4397 39172605
chr11 61721690 61721702 TFAP2A JASPAR yes 61717293 4397 39172606
chr11 61721694 61721704 SP1 JASPAR yes 61717293 4401 39172607
chr11 61721701 61721707 MZF1 JASPAR yes 61717293 4408 39172608
chr11 61721707 61721711 NFE TRANSFAC yes 61717293 4414 39172609
chr11 61721713 61721723 ZNF740 JASPAR yes 61717293 4420 39172610
chr11 61721715 61721725 ZNF740 JASPAR yes 61717293 4422 39172611
chr11 61721735 61721746 HOXA10 JASPAR yes 61717293 4442 39172612
chr11 61721736 61721745 CDX1 JASPAR yes 61717293 4443 39172613
chr11 61721752 61721767 RUNX2 JASPAR yes 61717293 4459 39172614
chr11 61721760 61721774 XBP1 JASPAR yes 61717293 4467 39172615
chr11 61721761 61721775 CREB3 JASPAR yes 61717293 4468 39172616
chr11 61721761 61721775 CREB3L1 JASPAR yes 61717293 4468 39172617
chr11 61721772 61721776 NFE TRANSFAC yes 61717293 4479 39172618
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chr11 61721819 61721829 TEAD1 JASPAR yes 61717293 4526 39172620
chr11 61721819 61721829 TEAD4 JASPAR yes 61717293 4526 39172621
chr11 61721819 61721831 TEAD1 JASPAR yes 61717293 4526 39172622
chr11 61721820 61721828 TEAD3 JASPAR yes 61717293 4527 39172623
chr11 61721835 61721840 GATA2 JASPAR yes 61717293 4542 39172624
chr11 61721837 61721853 SOX8 JASPAR yes 61717293 4544 39172625
chr11 61721846 61721860 BATF3 JASPAR yes 61717293 4553 39172626
chr11 61721881 61721895 STAT1 JASPAR yes 61717293 4588 39172627
chr11 61721895 61721898 MYB TRANSFAC yes 61717293 4602 39172628
chr11 61721922 61721932 GSX1 JASPAR yes 61717293 4629 39172629
chr11 61721922 61721932 GSX2 JASPAR yes 61717293 4629 39172630
chr11 61721922 61721933 HOXC13 JASPAR yes 61717293 4629 39172631
chr11 61721923 61721931 NKX6-1 JASPAR yes 61717293 4630 39172632
chr11 61721923 61721931 NKX6-2 JASPAR yes 61717293 4630 39172633
chr11 61721925 61721929 YY1 TRANSFAC yes 61717293 4632 39172634
chr11 61721939 61721960 IRF1 JASPAR yes 61717293 4646 39172635
chr11 61721941 61721956 STAT2 JASPAR yes 61717293 4648 39172636
chr11 61721942 61721956 STAT1 JASPAR yes 61717293 4649 39172637
chr11 61721946 61721961 FOXP1 JASPAR yes 61717293 4653 39172638
chr11 61721947 61721962 FOXP1 JASPAR yes 61717293 4654 39172639
chr11 61721951 61721965 IRF7 JASPAR yes 61717293 4658 39172640
chr11 61721954 61721964 MEF2A JASPAR yes 61717293 4661 39172641
chr11 61721971 61721990 PAX5 JASPAR yes 61717293 4678 39172642
chr11 61721975 61721986 NFE2L2 JASPAR yes 61717293 4682 39172643
chr11 61721979 61721983 NFE TRANSFAC yes 61717293 4686 39172644
chr11 61721991 61722000 NKX2-8 JASPAR yes 61717293 4698 39172645
chr11 61722050 61722058 GATA1 TRANSFAC yes 61717293 4757 39172646
chr11 61722053 61722057 NFE TRANSFAC yes 61717293 4760 39172647
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chr11 61722053 61722059 GATA3 JASPAR yes 61717293 4760 39172649
chr11 61722083 61722093 NEUROD2 JASPAR yes 61717293 4790 39172650
chr11 61722119 61722125 GATA3 JASPAR yes 61717293 4826 39172651
chr11 61722162 61722166 H4TF2 TRANSFAC yes 61717293 4869 39172652
chr11 61722197 61722207 TBR1 JASPAR yes 61717293 4904 39172653
chr11 61722207 61722212 MYC TRANSFAC yes 61717293 4914 39172654
chr11 61722250 61722263 NR2F1 JASPAR yes 61717293 4957 39172655
chr11 61722269 61722275 TCF1 TRANSFAC yes 61717293 4976 39172656
SNPs associated with BEST1[ENSG00000167995.11], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr11 62201586 rs116846164 G T 468599 Heart 0.106462 2031181
chr11 61581656 rs174559 G A 135637 Heart 0.135663 2026811
chr11 60794403 rs3019537 C G 922890 Pancreas 0.340264 2022069
chr11 61745953 rs2028062 G A 12966 Breast 0.377421 2028105
chr11 61803683 rs35124768 T C 70696 Spleen 0.197382 2028982
chr11 62233303 rs76500609 A G 500316 Thyroid 0.184923 2031598
chr11 61272309 rs11230723 C T 444984 Liver 0.304386 2024497
chr11 61737244 rs3758977 T G 4257 Lung 0.0476356 2028014
Details of BEST1[ENSG00000167995.11]
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Genomic Location chr11:61717293-61732987[+]
TSS 61717293
Gene Name BEST1
Ensembl ID ENSG00000167995.11
ENTREZID 7439
Uniprot
B7Z1N8
A0A0C4DGE9
B7Z375
A0A0S2Z579
A0A0S2Z4M4
O76090
Protein Name
Bestrophin
Bestrophin 1 isoform 8
Bestrophin-1
Expression levels of BEST1[ENSG00000167995.11]
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