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Enhancers that regulate RAB11B[ENSG00000185236.7]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Placenta
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Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Epithelial (MCF-7) Brain (SK-N-SH) Prostate (RWPE1) Ovary Esophagus Lung (PC-9) Muscle (A673) Placenta Colon (HCT116) Muscle (Myoblast) Pancreas Pancreas (Panc1) Muscle (Myotube) Uterus Blood (T-cell) Heart
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VISTA
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Astrocyte Colon (HCT116) Uterus Epithelial (MCF-7) Kidney Skin (Keratinocyte) Stomach Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Thyroid Neural Stem Cells (H9) Prostate (PC-3) Large Intestine Esophagus Placenta Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Liver (HepG2) Prostate (RWPE1) Muscle (A673) Heart
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VISTA
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Transcript facotrs that regulate RAB11B[ENSG00000185236.7]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr19 8457977 8457982 ETS2 TRANSFAC yes 8454865 3112 112365122
chr19 8457981 8457994 HSF1 JASPAR yes 8454865 3116 112365123
chr19 8457995 8458000 ETS2 TRANSFAC yes 8454865 3130 112365124
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chr19 8458006 8458022 SOX4 JASPAR yes 8454865 3141 112365127
chr19 8458012 8458028 SOX8 JASPAR yes 8454865 3147 112365128
chr19 8458017 8458028 FOXH1 JASPAR yes 8454865 3152 112365129
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chr19 8458029 8458039 GSX1 JASPAR yes 8454865 3164 112365133
chr19 8458029 8458039 MEOX1 JASPAR yes 8454865 3164 112365134
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chr19 8458030 8458038 VAX2 JASPAR yes 8454865 3165 112365141
chr19 8458030 8458038 VSX1 JASPAR yes 8454865 3165 112365142
chr19 8458030 8458038 VSX2 JASPAR yes 8454865 3165 112365143
chr19 8458030 8458040 MEF2A JASPAR yes 8454865 3165 112365144
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chr19 8458073 8458087 TLX1 JASPAR yes 8454865 3208 112365150
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chr19 8458102 8458112 GBX2 JASPAR yes 8454865 3237 112365156
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chr19 8458103 8458111 MSX1 JASPAR yes 8454865 3238 112365160
chr19 8458103 8458111 MSX2 JASPAR yes 8454865 3238 112365161
chr19 8458103 8458111 PDX1 JASPAR yes 8454865 3238 112365162
chr19 8458123 8458128 H4TF1 TRANSFAC yes 8454865 3258 112365163
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chr19 8458167 8458181 PLAG1 JASPAR yes 8454865 3302 112365169
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chr19 8458275 8458285 NHLH1 JASPAR yes 8454865 3410 112365184
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chr19 8458281 8458293 TFAP2A JASPAR yes 8454865 3416 112365193
chr19 8458282 8458291 TFAP2A JASPAR yes 8454865 3417 112365194
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chr19 8458462 8458467 TFAP2A TRANSFAC yes 8454865 3597 112365228
chr19 8458462 8458468 MZF1 JASPAR yes 8454865 3597 112365229
chr19 8458467 8458479 FOXI1 JASPAR yes 8454865 3602 112365230
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chr19 8458484 8458490 MZF1 JASPAR yes 8454865 3619 112365234
chr19 8458488 8458492 YY1 TRANSFAC yes 8454865 3623 112365235
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chr19 8458572 8458587 TFAP2C JASPAR yes 8454865 3707 112365243
chr19 8458573 8458584 EBF1 JASPAR yes 8454865 3708 112365244
chr19 8458574 8458583 TFAP2A JASPAR yes 8454865 3709 112365245
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chr19 8458708 8458721 TFAP2A JASPAR yes 8454865 3843 112365257
chr19 8458708 8458721 TFAP2B JASPAR yes 8454865 3843 112365258
chr19 8458708 8458721 TFAP2C JASPAR yes 8454865 3843 112365259
chr19 8458709 8458720 EBF1 JASPAR yes 8454865 3844 112365260
chr19 8458709 8458723 PLAG1 JASPAR yes 8454865 3844 112365261
chr19 8458711 8458720 TFAP2A JASPAR yes 8454865 3846 112365262
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chr19 8458832 8458844 ZBTB7B JASPAR yes 8454865 3967 112365276
chr19 8458832 8458844 ZBTB7C JASPAR yes 8454865 3967 112365277
chr19 8458866 8458886 TP53 JASPAR yes 8454865 4001 112365278
chr19 8458872 8458892 TP53 JASPAR yes 8454865 4007 112365279
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SNPs associated with RAB11B[ENSG00000185236.7], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
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chr19 7860123 rs141533501 G A 594742 Pancreas 0.0789624 5424764
chr19 8793320 rs35507112 T G 324002 Spleen 0.15992 5430433
chr19 7658470 rs117128252 C T 796395 Uterus 0.503921 5423137
chr19 8451430 rs12981318 G A 3435 Thyroid 0.00309821 5428507
chr19 7477025 rs7255362 A G 977840 Lung 0.165415 5421936
Details of RAB11B[ENSG00000185236.7]
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Genomic Location chr19:8454865-8469318[+]
TSS 8454865
Gene Name RAB11B
Ensembl ID ENSG00000185236.7
ENTREZID 9230
Uniprot
Q15907
Protein Name
Ras-related protein Rab-11B
Expression levels of RAB11B[ENSG00000185236.7]
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