EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. WNT9A[ENSG00000143816.7]
Enhancers that regulate WNT9A[ENSG00000143816.7]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr1 228055297 228059943 enh94841 228135599 75656
Muscle (Myoblast)
chr1 228069592 228093895 enh12737 228135599 41704
Bone Marrow (K562) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Prostate (RWPE1) Blood (T-cell) Lung Stomach Placenta Breast Embryonic Stem Cell Line (H1-hESC) Pancreas Muscle (Myotube) Uterus Thymus Epithelial (MCF-7)
chr1 228073191 228073261 vista5402 228135599 62338
VISTA
chr1 228074836 228075224 vista5403 228135599 60375
VISTA
chr1 228079986 228080118 vista5404 228135599 55481
VISTA
chr1 228095829 228099979 enh61975 228135599 35620
Esophagus
chr1 228098321 228098415 vista5405 228135599 37184
VISTA
chr1 228100065 228105938 enh50232 228135599 29661
Prostate (RWPE1) Muscle (A673) Large Intestine
chr1 228120145 228126935 enh12738 228135599 8664
Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Liver Placenta Lung (PC-9) Uterus
chr1 228124828 228124930 vista5406 228135599 10669
VISTA
chr1 228129918 228134595 enh64199 228135599 1004
Uterus Heart
chr1 228147445 228152035 enh110683 228135599 11846
Cervix (HeLa-S3)
chr1 228157445 228162695 enh89542 228135599 21846
Prostate (RWPE1) Stomach
chr1 228198804 228205894 enh12739 228135599 63205
Prostate (PC-3) Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Placenta Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube)
chr1 228229225 228235795 enh79415 228135599 93626
Lung (PC-9) Prostate (PC-3) Prostate (RWPE1) Epithelial (MCF-7)
Transcript facotrs that regulate WNT9A[ENSG00000143816.7]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr1 228130622 228130632 SP1 JASPAR yes 228135599 4967 35896072
chr1 228130632 228130643 FOXH1 JASPAR yes 228135599 4956 35896073
chr1 228130636 228130646 TBR1 JASPAR yes 228135599 4953 35896074
chr1 228130636 228130647 TBX2 JASPAR yes 228135599 4952 35896075
chr1 228130638 228130646 TBX5 JASPAR yes 228135599 4953 35896076
chr1 228130638 228130658 RREB1 JASPAR yes 228135599 4941 35896077
chr1 228130641 228130655 PLAG1 JASPAR yes 228135599 4944 35896078
chr1 228130652 228130673 ZNF263 JASPAR yes 228135599 4926 35896079
chr1 228130654 228130660 SP1 TRANSFAC yes 228135599 4939 35896080
chr1 228130654 228130664 SP1 JASPAR yes 228135599 4935 35896081
chr1 228130677 228130691 PLAG1 JASPAR yes 228135599 4908 35896082
chr1 228130679 228130692 SCRT2 JASPAR yes 228135599 4907 35896083
chr1 228130679 228130694 SCRT1 JASPAR yes 228135599 4905 35896084
chr1 228130683 228130692 SNAI2 JASPAR yes 228135599 4907 35896085
chr1 228130683 228130693 ID4 JASPAR yes 228135599 4906 35896086
chr1 228130683 228130693 TCF3 JASPAR yes 228135599 4906 35896087
chr1 228130683 228130693 TCF4 JASPAR yes 228135599 4906 35896088
chr1 228130699 228130718 PAX5 JASPAR yes 228135599 4881 35896089
chr1 228130704 228130717 ZBTB18 JASPAR yes 228135599 4882 35896090
chr1 228130706 228130716 MSC JASPAR yes 228135599 4883 35896091
chr1 228130711 228130726 TFAP2A JASPAR yes 228135599 4873 35896092
chr1 228130711 228130726 TFAP2C JASPAR yes 228135599 4873 35896093
chr1 228130714 228130725 TFAP2A JASPAR yes 228135599 4874 35896094
chr1 228130714 228130725 TFAP2B JASPAR yes 228135599 4874 35896095
chr1 228130714 228130725 TFAP2C JASPAR yes 228135599 4874 35896096
chr1 228130714 228130726 TFAP2A JASPAR yes 228135599 4873 35896097
chr1 228130714 228130726 TFAP2B JASPAR yes 228135599 4873 35896098
chr1 228130714 228130726 TFAP2C JASPAR yes 228135599 4873 35896099
chr1 228130715 228130724 TFAP2A JASPAR yes 228135599 4875 35896100
chr1 228130769 228130778 THAP1 JASPAR yes 228135599 4821 35896101
chr1 228130785 228130796 E2F6 JASPAR yes 228135599 4803 35896102
chr1 228130788 228130802 PLAG1 JASPAR yes 228135599 4797 35896103
chr1 228130814 228130824 NFIA JASPAR yes 228135599 4775 35896104
chr1 228130815 228130824 NFIX JASPAR yes 228135599 4775 35896105
chr1 228130815 228130835 TBX19 JASPAR yes 228135599 4764 35896106
chr1 228130816 228130822 NFIC JASPAR yes 228135599 4777 35896107
chr1 228130817 228130833 T JASPAR yes 228135599 4766 35896108
chr1 228130820 228130828 HOXA5 JASPAR yes 228135599 4771 35896109
chr1 228130825 228130835 TBR1 JASPAR yes 228135599 4764 35896110
chr1 228130832 228130838 HiNF-A TRANSFAC yes 228135599 4761 35896111
chr1 228130840 228130846 SP1 TRANSFAC yes 228135599 4753 35896112
chr1 228130840 228130850 SP1 JASPAR yes 228135599 4749 35896113
chr1 228130841 228130851 ZNF740 JASPAR yes 228135599 4748 35896114
chr1 228130844 228130850 MZF1 JASPAR yes 228135599 4749 35896115
chr1 228130849 228130854 SP1 TRANSFAC yes 228135599 4745 35896116
chr1 228130854 228130862 UEF1 TRANSFAC yes 228135599 4737 35896117
chr1 228130855 228130863 MEIS2 JASPAR yes 228135599 4736 35896118
chr1 228130855 228130863 MEIS3 JASPAR yes 228135599 4736 35896119
chr1 228130856 228130868 PKNOX2 JASPAR yes 228135599 4731 35896120
chr1 228130889 228130900 EBF1 JASPAR yes 228135599 4699 35896121
chr1 228130895 228130914 REST JASPAR yes 228135599 4685 35896122
chr1 228130908 228130914 NFE2 TRANSFAC yes 228135599 4685 35896123
chr1 228130935 228130945 NFKB1 JASPAR yes 228135599 4654 35896124
chr1 228130935 228130946 NFKB1 JASPAR yes 228135599 4653 35896125
chr1 228130948 228130954 NFE2 TRANSFAC yes 228135599 4645 35896126
chr1 228130951 228130971 RREB1 JASPAR yes 228135599 4628 35896127
chr1 228130952 228130962 SP1 JASPAR yes 228135599 4637 35896128
chr1 228131008 228131020 ZBTB7A JASPAR yes 228135599 4579 35896129
chr1 228131062 228131074 FOXI1 JASPAR yes 228135599 4525 35896130
chr1 228131062 228131077 MEF2A JASPAR yes 228135599 4522 35896131
chr1 228131071 228131075 TEAD2 TRANSFAC yes 228135599 4524 35896132
chr1 228131071 228131076 TBP TRANSFAC yes 228135599 4523 35896133
chr1 228131081 228131092 HOXC13 JASPAR yes 228135599 4507 35896134
chr1 228131089 228131102 SCRT2 JASPAR yes 228135599 4497 35896135
chr1 228131096 228131109 SMAD2 JASPAR yes 228135599 4490 35896136
chr1 228131201 228131215 TLX1 JASPAR yes 228135599 4384 35896137
chr1 228131202 228131216 TLX1 JASPAR yes 228135599 4383 35896138
chr1 228131203 228131214 USF2 JASPAR yes 228135599 4385 35896139
chr1 228131206 228131211 USF2 TRANSFAC yes 228135599 4388 35896140
chr1 228131239 228131250 FOXH1 JASPAR yes 228135599 4349 35896141
chr1 228131255 228131267 YY1 JASPAR yes 228135599 4332 35896142
chr1 228131258 228131264 YY1 JASPAR yes 228135599 4335 35896143
chr1 228131266 228131287 IRF1 JASPAR yes 228135599 4312 35896144
chr1 228131269 228131283 IRF7 JASPAR yes 228135599 4316 35896145
chr1 228131270 228131284 STAT1 JASPAR yes 228135599 4315 35896146
chr1 228131270 228131285 STAT2 JASPAR yes 228135599 4314 35896147
chr1 228131271 228131283 IRF1 JASPAR yes 228135599 4316 35896148
chr1 228131272 228131293 IRF1 JASPAR yes 228135599 4306 35896149
chr1 228131274 228131289 IRF9 JASPAR yes 228135599 4310 35896150
chr1 228131295 228131308 ELF1 JASPAR yes 228135599 4291 35896151
chr1 228131298 228131308 ETV6 JASPAR yes 228135599 4291 35896152
chr1 228131298 228131309 ELK4 JASPAR yes 228135599 4290 35896153
chr1 228131298 228131309 FLI1 JASPAR yes 228135599 4290 35896154
chr1 228131298 228131319 ZNF263 JASPAR yes 228135599 4280 35896155
chr1 228131299 228131307 EHF JASPAR yes 228135599 4292 35896156
chr1 228131300 228131307 SPI1 JASPAR yes 228135599 4292 35896157
chr1 228131336 228131342 HiNF-A TRANSFAC yes 228135599 4257 35896158
chr1 228131366 228131372 NFIC JASPAR yes 228135599 4227 35896159
chr1 228131393 228131398 SP1 TRANSFAC yes 228135599 4201 35896160
chr1 228131394 228131399 SP1 TRANSFAC yes 228135599 4200 35896161
chr1 228131394 228131400 SP1 TRANSFAC yes 228135599 4199 35896162
chr1 228131419 228131422 MYB TRANSFAC yes 228135599 4177 35896163
chr1 228131419 228131433 NR2F1 JASPAR yes 228135599 4166 35896164
chr1 228131438 228131452 CREB3L1 JASPAR yes 228135599 4147 35896165
chr1 228131439 228131453 XBP1 JASPAR yes 228135599 4146 35896166
chr1 228131441 228131446 ATF1 TRANSFAC yes 228135599 4153 35896167
chr1 228131447 228131457 RELA JASPAR yes 228135599 4142 35896168
chr1 228131447 228131458 NFKB1 JASPAR yes 228135599 4141 35896169
chr1 228131453 228131464 EBF1 JASPAR yes 228135599 4135 35896170
chr1 228131508 228131529 IRF1 JASPAR yes 228135599 4070 35896171
chr1 228131510 228131522 MEF2D JASPAR yes 228135599 4077 35896172
chr1 228131525 228131531 TBP TRANSFAC yes 228135599 4068 35896173
chr1 228131525 228131536 PROP1 JASPAR yes 228135599 4063 35896174
chr1 228131539 228131547 OTX2 JASPAR yes 228135599 4052 35896175
chr1 228131539 228131548 PITX3 JASPAR yes 228135599 4051 35896176
chr1 228131556 228131568 ZBTB7A JASPAR yes 228135599 4031 35896177
chr1 228131561 228131565 H4TF2 TRANSFAC yes 228135599 4034 35896178
chr1 228131584 228131592 TBX15 JASPAR yes 228135599 4007 35896179
chr1 228131584 228131595 E2F6 JASPAR yes 228135599 4004 35896180
chr1 228131585 228131590 SP1 TRANSFAC yes 228135599 4009 35896181
chr1 228131658 228131669 NFE2L2 JASPAR yes 228135599 3930 35896182
chr1 228131674 228131678 NFE TRANSFAC yes 228135599 3921 35896183
chr1 228131679 228131689 HOXB13 JASPAR yes 228135599 3910 35896184
chr1 228131679 228131689 HOXD13 JASPAR yes 228135599 3910 35896185
chr1 228131680 228131700 RREB1 JASPAR yes 228135599 3899 35896186
chr1 228131683 228131698 FOXP1 JASPAR yes 228135599 3901 35896187
chr1 228131684 228131705 IRF1 JASPAR yes 228135599 3894 35896188
chr1 228131685 228131705 RREB1 JASPAR yes 228135599 3894 35896189
chr1 228131686 228131701 IRF9 JASPAR yes 228135599 3898 35896190
chr1 228131688 228131700 IRF1 JASPAR yes 228135599 3899 35896191
chr1 228131701 228131718 RXRA JASPAR yes 228135599 3881 35896192
chr1 228131706 228131717 USF1 JASPAR yes 228135599 3882 35896193
chr1 228131706 228131717 USF2 JASPAR yes 228135599 3882 35896194
chr1 228131712 228131722 RORA JASPAR yes 228135599 3877 35896195
chr1 228131743 228131755 IRF1 JASPAR yes 228135599 3844 35896196
chr1 228131744 228131759 FOXP1 JASPAR yes 228135599 3840 35896197
chr1 228131746 228131766 RREB1 JASPAR yes 228135599 3833 35896198
chr1 228131747 228131758 FOXP2 JASPAR yes 228135599 3841 35896199
chr1 228131748 228131756 FOXO3 JASPAR yes 228135599 3843 35896200
chr1 228131750 228131770 RREB1 JASPAR yes 228135599 3829 35896201
chr1 228131751 228131757 HiNF-A TRANSFAC yes 228135599 3842 35896202
chr1 228131752 228131772 RREB1 JASPAR yes 228135599 3827 35896203
chr1 228131754 228131774 RREB1 JASPAR yes 228135599 3825 35896204
chr1 228131756 228131776 RREB1 JASPAR yes 228135599 3823 35896205
chr1 228131758 228131778 RREB1 JASPAR yes 228135599 3821 35896206
chr1 228131760 228131780 RREB1 JASPAR yes 228135599 3819 35896207
chr1 228131776 228131786 TEAD1 JASPAR yes 228135599 3813 35896208
chr1 228131782 228131786 H1TF2 TRANSFAC yes 228135599 3813 35896209
chr1 228131782 228131786 NFE TRANSFAC yes 228135599 3813 35896210
chr1 228131782 228131786 SRF TRANSFAC yes 228135599 3813 35896211
chr1 228131798 228131802 YY1 TRANSFAC yes 228135599 3797 35896212
chr1 228131800 228131812 PBX1 JASPAR yes 228135599 3787 35896213
chr1 228131801 228131806 GATA2 JASPAR yes 228135599 3793 35896214
chr1 228131815 228131831 SOX4 JASPAR yes 228135599 3768 35896215
chr1 228131816 228131831 SOX21 JASPAR yes 228135599 3768 35896216
chr1 228131819 228131829 ETV6 JASPAR yes 228135599 3770 35896217
chr1 228131828 228131841 ZBTB18 JASPAR yes 228135599 3758 35896218
chr1 228131830 228131842 TAL1 JASPAR yes 228135599 3757 35896219
chr1 228131844 228131859 MYBL2 JASPAR yes 228135599 3740 35896220
chr1 228131855 228131859 ESR1 TRANSFAC yes 228135599 3740 35896221
chr1 228131892 228131895 MYB TRANSFAC yes 228135599 3704 35896222
chr1 228131921 228131924 MYB TRANSFAC yes 228135599 3675 35896223
chr1 228131936 228131954 MAFF JASPAR yes 228135599 3645 35896224
chr1 228131938 228131953 MAFK JASPAR yes 228135599 3646 35896225
chr1 228131950 228131969 PAX5 JASPAR yes 228135599 3630 35896226
chr1 228131989 228131993 YY1 TRANSFAC yes 228135599 3606 35896227
chr1 228131989 228132004 STAT1 JASPAR yes 228135599 3595 35896228
chr1 228131991 228132002 STAT1 JASPAR yes 228135599 3597 35896229
chr1 228131991 228132002 STAT3 JASPAR yes 228135599 3597 35896230
chr1 228131997 228132012 HSF1 JASPAR yes 228135599 3587 35896231
chr1 228132002 228132022 ESR1 JASPAR yes 228135599 3577 35896232
chr1 228132005 228132023 ESR2 JASPAR yes 228135599 3576 35896233
chr1 228132006 228132024 ESR2 JASPAR yes 228135599 3575 35896234
chr1 228132007 228132022 ESR2 JASPAR yes 228135599 3577 35896235
chr1 228132007 228132027 ESR1 JASPAR yes 228135599 3572 35896236
chr1 228132038 228132048 NKX2-3 JASPAR yes 228135599 3551 35896237
chr1 228132043 228132058 RFX5 JASPAR yes 228135599 3541 35896238
chr1 228132044 228132061 BCL6B JASPAR yes 228135599 3538 35896239
chr1 228132059 228132068 SP1 TRANSFAC yes 228135599 3531 35896240
chr1 228132059 228132069 SP1 JASPAR yes 228135599 3530 35896241
chr1 228132060 228132069 SP1 TRANSFAC yes 228135599 3530 35896242
chr1 228132061 228132067 MAZ TRANSFAC yes 228135599 3532 35896243
chr1 228132072 228132076 LFA1 TRANSFAC yes 228135599 3523 35896244
chr1 228132103 228132113 SREBF1 JASPAR yes 228135599 3486 35896245
chr1 228132103 228132113 SREBF2 JASPAR yes 228135599 3486 35896246
chr1 228132111 228132131 TP53 JASPAR yes 228135599 3468 35896247
chr1 228132114 228132129 HSF1 JASPAR yes 228135599 3470 35896248
chr1 228132115 228132128 HSF1 JASPAR yes 228135599 3471 35896249
chr1 228132115 228132128 HSF2 JASPAR yes 228135599 3471 35896250
chr1 228132115 228132128 HSF4 JASPAR yes 228135599 3471 35896251
chr1 228132127 228132139 HNF1B JASPAR yes 228135599 3460 35896252
chr1 228132191 228132195 YY1 TRANSFAC yes 228135599 3404 35896253
chr1 228132200 228132211 FOXH1 JASPAR yes 228135599 3388 35896254
chr1 228132201 228132207 ZNF354C JASPAR yes 228135599 3392 35896255
chr1 228132223 228132239 NFYA JASPAR yes 228135599 3360 35896256
chr1 228132228 228132232 H1TF2 TRANSFAC yes 228135599 3367 35896257
chr1 228132228 228132232 NFE TRANSFAC yes 228135599 3367 35896258
chr1 228132228 228132232 SRF TRANSFAC yes 228135599 3367 35896259
chr1 228132228 228132238 HOXB13 JASPAR yes 228135599 3361 35896260
chr1 228132232 228132235 MYB TRANSFAC yes 228135599 3364 35896261
chr1 228132248 228132263 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3336 35896262
chr1 228132248 228132263 TFAP2C JASPAR yes 228135599 3336 35896263
chr1 228132250 228132262 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3337 35896264
chr1 228132250 228132262 TFAP2B JASPAR yes 228135599 3337 35896265
chr1 228132250 228132262 TFAP2C JASPAR yes 228135599 3337 35896266
chr1 228132250 228132265 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3334 35896267
chr1 228132250 228132265 TFAP2C JASPAR yes 228135599 3334 35896268
chr1 228132260 228132274 PLAG1 JASPAR yes 228135599 3325 35896269
chr1 228132272 228132276 H1TF2 TRANSFAC yes 228135599 3323 35896270
chr1 228132272 228132276 NFE TRANSFAC yes 228135599 3323 35896271
chr1 228132272 228132276 SRF TRANSFAC yes 228135599 3323 35896272
chr1 228132284 228132288 ESR1 TRANSFAC yes 228135599 3311 35896273
chr1 228132292 228132311 REST JASPAR yes 228135599 3288 35896274
chr1 228132332 228132345 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3254 35896275
chr1 228132338 228132344 YY1 JASPAR yes 228135599 3255 35896276
chr1 228132351 228132356 SP1 TRANSFAC yes 228135599 3243 35896277
chr1 228132359 228132370 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3229 35896278
chr1 228132359 228132370 TFAP2B JASPAR yes 228135599 3229 35896279
chr1 228132359 228132370 TFAP2C JASPAR yes 228135599 3229 35896280
chr1 228132360 228132369 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3230 35896281
chr1 228132365 228132369 LFA1 TRANSFAC yes 228135599 3230 35896282
chr1 228132405 228132420 STAT1 JASPAR yes 228135599 3179 35896283
chr1 228132407 228132418 STAT3 JASPAR yes 228135599 3181 35896284
chr1 228132415 228132430 TFAP2C JASPAR yes 228135599 3169 35896285
chr1 228132447 228132451 LFA1 TRANSFAC yes 228135599 3148 35896286
chr1 228132454 228132460 NFIC JASPAR yes 228135599 3139 35896287
chr1 228132494 228132497 MYB TRANSFAC yes 228135599 3102 35896288
chr1 228132494 228132510 SOX4 JASPAR yes 228135599 3089 35896289
chr1 228132522 228132537 HNF4G JASPAR yes 228135599 3062 35896290
chr1 228132523 228132537 NR2F1 JASPAR yes 228135599 3062 35896291
chr1 228132533 228132545 ZBTB7C JASPAR yes 228135599 3054 35896292
chr1 228132536 228132551 RUNX2 JASPAR yes 228135599 3048 35896293
chr1 228132537 228132557 RREB1 JASPAR yes 228135599 3042 35896294
chr1 228132546 228132561 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3038 35896295
chr1 228132546 228132561 TFAP2C JASPAR yes 228135599 3038 35896296
chr1 228132549 228132560 TFAP2A JASPAR yes 228135599 3039 35896297
chr1 228132549 228132560 TFAP2B JASPAR yes 228135599 3039 35896298
chr1 228132549 228132560 TFAP2C JASPAR yes 228135599 3039 35896299
chr1 228132563 228132569 TBP TRANSFAC yes 228135599 3030 35896300
chr1 228132580 228132585 ETS2 TRANSFAC yes 228135599 3014 35896301
chr1 228132621 228132626 ETS2 TRANSFAC yes 228135599 2973 35896302
chr1 228132634 228132649 RFX5 JASPAR yes 228135599 2950 35896303
chr1 228132639 228132653 TLX1 JASPAR yes 228135599 2946 35896304
chr1 228132644 228132657 SMAD2 JASPAR yes 228135599 2942 35896305
chr1 228132667 228132682 NR2C2 JASPAR yes 228135599 2917 35896306
chr1 228132670 228132675 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2924 35896307
chr1 228132676 228132680 H4TF2 TRANSFAC yes 228135599 2919 35896308
chr1 228132680 228132695 ZIC3 JASPAR yes 228135599 2904 35896309
chr1 228132680 228132695 ZIC4 JASPAR yes 228135599 2904 35896310
chr1 228132691 228132695 LFA1 TRANSFAC yes 228135599 2904 35896311
chr1 228132701 228132713 INSM1 JASPAR yes 228135599 2886 35896312
chr1 228132706 228132725 REST JASPAR yes 228135599 2874 35896313
chr1 228132743 228132764 REST JASPAR yes 228135599 2835 35896314
chr1 228132749 228132760 EBF1 JASPAR yes 228135599 2839 35896315
chr1 228132775 228132783 OTX1 JASPAR yes 228135599 2816 35896316
chr1 228132775 228132783 OTX2 JASPAR yes 228135599 2816 35896317
chr1 228132777 228132787 TFCP2 JASPAR yes 228135599 2812 35896318
chr1 228132778 228132789 SPDEF JASPAR yes 228135599 2810 35896319
chr1 228132793 228132803 TFAP4 JASPAR yes 228135599 2796 35896320
chr1 228132800 228132815 RUNX2 JASPAR yes 228135599 2784 35896321
chr1 228132801 228132810 RUNX2 JASPAR yes 228135599 2789 35896322
chr1 228132801 228132811 RUNX3 JASPAR yes 228135599 2788 35896323
chr1 228132831 228132836 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2763 35896324
chr1 228132839 228132843 H1TF2 TRANSFAC yes 228135599 2756 35896325
chr1 228132839 228132843 NFE TRANSFAC yes 228135599 2756 35896326
chr1 228132839 228132843 SRF TRANSFAC yes 228135599 2756 35896327
chr1 228132891 228132895 TEAD2 TRANSFAC yes 228135599 2704 35896328
chr1 228132891 228132902 ESRRB JASPAR yes 228135599 2697 35896329
chr1 228132893 228132896 MYB TRANSFAC yes 228135599 2703 35896330
chr1 228132899 228132904 TFAP2A TRANSFAC yes 228135599 2695 35896331
chr1 228132899 228132905 MZF1 JASPAR yes 228135599 2694 35896332
chr1 228132920 228132934 PLAG1 JASPAR yes 228135599 2665 35896333
chr1 228132927 228132944 RARA JASPAR yes 228135599 2655 35896334
chr1 228132927 228132944 RXRA JASPAR yes 228135599 2655 35896335
chr1 228132934 228132947 NR2F1 JASPAR yes 228135599 2652 35896336
chr1 228132936 228132947 ESRRA JASPAR yes 228135599 2652 35896337
chr1 228132938 228132955 RARA JASPAR yes 228135599 2644 35896338
chr1 228132969 228132973 NFE TRANSFAC yes 228135599 2626 35896339
chr1 228132970 228132980 SMAD3 JASPAR yes 228135599 2619 35896340
chr1 228132978 228132992 TLX1 JASPAR yes 228135599 2607 35896341
chr1 228132980 228132992 INSM1 JASPAR yes 228135599 2607 35896342
chr1 228132985 228132990 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2609 35896343
chr1 228133003 228133013 MAX JASPAR yes 228135599 2586 35896344
chr1 228133029 228133041 TAL1 JASPAR yes 228135599 2558 35896345
chr1 228133038 228133057 CTCF JASPAR yes 228135599 2542 35896346
chr1 228133043 228133052 SNAI2 JASPAR yes 228135599 2547 35896347
chr1 228133044 228133049 USF2 TRANSFAC yes 228135599 2550 35896348
chr1 228133054 228133069 HNF4G JASPAR yes 228135599 2530 35896349
chr1 228133055 228133070 HNF4A JASPAR yes 228135599 2529 35896350
chr1 228133063 228133080 RXRA JASPAR yes 228135599 2519 35896351
chr1 228133079 228133099 PPARG JASPAR yes 228135599 2500 35896352
chr1 228133092 228133098 MZF1 JASPAR yes 228135599 2501 35896353
chr1 228133092 228133105 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2494 35896354
chr1 228133092 228133107 ZIC3 JASPAR yes 228135599 2492 35896355
chr1 228133092 228133107 ZIC4 JASPAR yes 228135599 2492 35896356
chr1 228133093 228133107 GLIS2 JASPAR yes 228135599 2492 35896357
chr1 228133093 228133107 GLIS3 JASPAR yes 228135599 2492 35896358
chr1 228133093 228133107 ZIC1 JASPAR yes 228135599 2492 35896359
chr1 228133103 228133107 H4TF2 TRANSFAC yes 228135599 2492 35896360
chr1 228133113 228133128 HNF4G JASPAR yes 228135599 2471 35896361
chr1 228133114 228133129 HNF4A JASPAR yes 228135599 2470 35896362
chr1 228133115 228133130 TFAP2C JASPAR yes 228135599 2469 35896363
chr1 228133120 228133135 HSF1 JASPAR yes 228135599 2464 35896364
chr1 228133134 228133138 LFA1 TRANSFAC yes 228135599 2461 35896365
chr1 228133134 228133146 INSM1 JASPAR yes 228135599 2453 35896366
chr1 228133140 228133151 E2F1 JASPAR yes 228135599 2448 35896367
chr1 228133141 228133154 SMAD2 JASPAR yes 228135599 2445 35896368
chr1 228133182 228133188 MAZ TRANSFAC yes 228135599 2411 35896369
chr1 228133191 228133211 ESR1 JASPAR yes 228135599 2388 35896370
chr1 228133193 228133213 PPARG JASPAR yes 228135599 2386 35896371
chr1 228133195 228133212 ESR1 JASPAR yes 228135599 2387 35896372
chr1 228133195 228133213 ESR2 JASPAR yes 228135599 2386 35896373
chr1 228133196 228133211 ESR2 JASPAR yes 228135599 2388 35896374
chr1 228133196 228133216 ESR1 JASPAR yes 228135599 2383 35896375
chr1 228133197 228133201 H4TF2 TRANSFAC yes 228135599 2398 35896376
chr1 228133197 228133211 CREB3 JASPAR yes 228135599 2388 35896377
chr1 228133197 228133217 ESR1 JASPAR yes 228135599 2382 35896378
chr1 228133199 228133209 MLXIPL JASPAR yes 228135599 2390 35896379
chr1 228133199 228133209 MLX JASPAR yes 228135599 2390 35896380
chr1 228133199 228133209 MNT JASPAR yes 228135599 2390 35896381
chr1 228133199 228133209 TFE3 JASPAR yes 228135599 2390 35896382
chr1 228133199 228133209 TFEB JASPAR yes 228135599 2390 35896383
chr1 228133199 228133210 USF1 JASPAR yes 228135599 2389 35896384
chr1 228133199 228133210 USF2 JASPAR yes 228135599 2389 35896385
chr1 228133200 228133207 USF1 JASPAR yes 228135599 2392 35896386
chr1 228133200 228133210 MAX JASPAR yes 228135599 2389 35896387
chr1 228133201 228133206 MYC TRANSFAC yes 228135599 2393 35896388
chr1 228133201 228133206 USF1 TRANSFAC yes 228135599 2393 35896389
chr1 228133201 228133206 USF2 TRANSFAC yes 228135599 2393 35896390
chr1 228133201 228133214 NR2F1 JASPAR yes 228135599 2385 35896391
chr1 228133207 228133217 SP1 JASPAR yes 228135599 2382 35896392
chr1 228133208 228133223 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2376 35896393
chr1 228133208 228133223 TFAP2C JASPAR yes 228135599 2376 35896394
chr1 228133208 228133229 ZNF263 JASPAR yes 228135599 2370 35896395
chr1 228133210 228133222 INSM1 JASPAR yes 228135599 2377 35896396
chr1 228133211 228133222 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2377 35896397
chr1 228133211 228133223 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2376 35896398
chr1 228133211 228133223 TFAP2B JASPAR yes 228135599 2376 35896399
chr1 228133211 228133223 TFAP2C JASPAR yes 228135599 2376 35896400
chr1 228133212 228133221 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2378 35896401
chr1 228133212 228133232 ESR1 JASPAR yes 228135599 2367 35896402
chr1 228133226 228133247 REST JASPAR yes 228135599 2352 35896403
chr1 228133227 228133246 REST JASPAR yes 228135599 2353 35896404
chr1 228133250 228133253 MYB TRANSFAC yes 228135599 2346 35896405
chr1 228133290 228133310 RREB1 JASPAR yes 228135599 2289 35896406
chr1 228133302 228133312 MZF1 JASPAR yes 228135599 2287 35896407
chr1 228133305 228133315 SP1 JASPAR yes 228135599 2284 35896408
chr1 228133307 228133312 ETS2 TRANSFAC yes 228135599 2287 35896409
chr1 228133331 228133341 SP1 JASPAR yes 228135599 2258 35896410
chr1 228133332 228133340 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2259 35896411
chr1 228133337 228133347 SP1 JASPAR yes 228135599 2252 35896412
chr1 228133347 228133358 FLI1 JASPAR yes 228135599 2241 35896413
chr1 228133348 228133359 ELF5 JASPAR yes 228135599 2240 35896414
chr1 228133348 228133361 ELF1 JASPAR yes 228135599 2238 35896415
chr1 228133367 228133372 ETS2 TRANSFAC yes 228135599 2227 35896416
chr1 228133376 228133390 PLAG1 JASPAR yes 228135599 2209 35896417
chr1 228133379 228133387 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2212 35896418
chr1 228133379 228133389 SP1 JASPAR yes 228135599 2210 35896419
chr1 228133383 228133398 ZIC3 JASPAR yes 228135599 2201 35896420
chr1 228133384 228133405 ZNF263 JASPAR yes 228135599 2194 35896421
chr1 228133386 228133392 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2207 35896422
chr1 228133401 228133407 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2192 35896423
chr1 228133415 228133430 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2169 35896424
chr1 228133418 228133430 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2169 35896425
chr1 228133418 228133430 TFAP2B JASPAR yes 228135599 2169 35896426
chr1 228133418 228133430 TFAP2C JASPAR yes 228135599 2169 35896427
chr1 228133419 228133428 TFAP2A JASPAR yes 228135599 2171 35896428
chr1 228133428 228133440 INSM1 JASPAR yes 228135599 2159 35896429
chr1 228133438 228133444 TCF4 TRANSFAC yes 228135599 2155 35896430
chr1 228133444 228133458 TLX1 JASPAR yes 228135599 2141 35896431
chr1 228133483 228133498 TFAP2C JASPAR yes 228135599 2101 35896432
chr1 228133491 228133506 HNF4G JASPAR yes 228135599 2093 35896433
chr1 228133495 228133501 SOX10 JASPAR yes 228135599 2098 35896434
chr1 228133507 228133517 MZF1 JASPAR yes 228135599 2082 35896435
chr1 228133510 228133516 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2083 35896436
chr1 228133510 228133520 SP1 JASPAR yes 228135599 2079 35896437
chr1 228133514 228133520 MZF1 JASPAR yes 228135599 2079 35896438
chr1 228133546 228133551 SP1 TRANSFAC yes 228135599 2048 35896439
chr1 228133560 228133579 REST JASPAR yes 228135599 2020 35896440
chr1 228133584 228133593 THAP1 JASPAR yes 228135599 2006 35896441
chr1 228133591 228133607 ZNF143 JASPAR yes 228135599 1992 35896442
chr1 228133601 228133611 ZNF740 JASPAR yes 228135599 1988 35896443
chr1 228133606 228133614 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1985 35896444
chr1 228133617 228133632 HSF1 JASPAR yes 228135599 1967 35896445
chr1 228133620 228133628 EHF JASPAR yes 228135599 1971 35896446
chr1 228133662 228133677 NR2C2 JASPAR yes 228135599 1922 35896447
chr1 228133674 228133686 PKNOX1 JASPAR yes 228135599 1913 35896448
chr1 228133674 228133686 PKNOX2 JASPAR yes 228135599 1913 35896449
chr1 228133674 228133686 TGIF1 JASPAR yes 228135599 1913 35896450
chr1 228133674 228133686 TGIF2 JASPAR yes 228135599 1913 35896451
chr1 228133675 228133685 MSC JASPAR yes 228135599 1914 35896452
chr1 228133680 228133684 NFE TRANSFAC yes 228135599 1915 35896453
chr1 228133683 228133689 MZF1 JASPAR yes 228135599 1910 35896454
chr1 228133683 228133695 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1904 35896455
chr1 228133683 228133695 TFAP2B JASPAR yes 228135599 1904 35896456
chr1 228133683 228133695 TFAP2C JASPAR yes 228135599 1904 35896457
chr1 228133701 228133716 HNF4A JASPAR yes 228135599 1883 35896458
chr1 228133702 228133717 HNF4G JASPAR yes 228135599 1882 35896459
chr1 228133709 228133719 RELA JASPAR yes 228135599 1880 35896460
chr1 228133709 228133720 NFKB1 JASPAR yes 228135599 1879 35896461
chr1 228133712 228133727 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1872 35896462
chr1 228133714 228133730 ZNF143 JASPAR yes 228135599 1869 35896463
chr1 228133722 228133726 LFA1 TRANSFAC yes 228135599 1873 35896464
chr1 228133723 228133744 REST JASPAR yes 228135599 1855 35896465
chr1 228133724 228133743 REST JASPAR yes 228135599 1856 35896466
chr1 228133740 228133749 THAP1 JASPAR yes 228135599 1850 35896467
chr1 228133777 228133781 H4TF2 TRANSFAC yes 228135599 1818 35896468
chr1 228133797 228133811 PLAG1 JASPAR yes 228135599 1788 35896469
chr1 228133797 228133815 ESR2 JASPAR yes 228135599 1784 35896470
chr1 228133799 228133819 ESR1 JASPAR yes 228135599 1780 35896471
chr1 228133807 228133812 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1787 35896472
chr1 228133821 228133836 RUNX2 JASPAR yes 228135599 1763 35896473
chr1 228133832 228133841 NKX3-2 JASPAR yes 228135599 1758 35896474
chr1 228133832 228133842 NKX2-3 JASPAR yes 228135599 1757 35896475
chr1 228133833 228133841 ISL2 JASPAR yes 228135599 1758 35896476
chr1 228133833 228133842 NKX2-8 JASPAR yes 228135599 1757 35896477
chr1 228133852 228133867 RFX5 JASPAR yes 228135599 1732 35896478
chr1 228133876 228133880 NFE TRANSFAC yes 228135599 1719 35896479
chr1 228133894 228133900 HiNF-A TRANSFAC yes 228135599 1699 35896480
chr1 228133906 228133912 SOX10 JASPAR yes 228135599 1687 35896481
chr1 228133915 228133933 ESR2 JASPAR yes 228135599 1666 35896482
chr1 228133918 228133932 RXRB JASPAR yes 228135599 1667 35896483
chr1 228133918 228133932 RXRG JASPAR yes 228135599 1667 35896484
chr1 228133918 228133933 HNF4G JASPAR yes 228135599 1666 35896485
chr1 228133918 228133933 NR2C2 JASPAR yes 228135599 1666 35896486
chr1 228133921 228133934 NR2F1 JASPAR yes 228135599 1665 35896487
chr1 228133923 228133934 ESRRB JASPAR yes 228135599 1665 35896488
chr1 228133924 228133932 NR4A2 JASPAR yes 228135599 1667 35896489
chr1 228133936 228133951 ESR2 JASPAR yes 228135599 1648 35896490
chr1 228133936 228133951 HNF4G JASPAR yes 228135599 1648 35896491
chr1 228133937 228133941 LFA1 TRANSFAC yes 228135599 1658 35896492
chr1 228133937 228133952 HNF4A JASPAR yes 228135599 1647 35896493
chr1 228133941 228133947 SOX10 JASPAR yes 228135599 1652 35896494
chr1 228133952 228133958 GATA3 JASPAR yes 228135599 1641 35896495
chr1 228133957 228133961 ESR1 TRANSFAC yes 228135599 1638 35896496
chr1 228133990 228134000 SP1 JASPAR yes 228135599 1599 35896497
chr1 228133995 228134006 STAT1 JASPAR yes 228135599 1593 35896498
chr1 228134021 228134027 SOX10 JASPAR yes 228135599 1572 35896499
chr1 228134057 228134063 MZF1 JASPAR yes 228135599 1536 35896500
chr1 228134092 228134111 PAX5 JASPAR yes 228135599 1488 35896501
chr1 228134099 228134104 ETS2 TRANSFAC yes 228135599 1495 35896502
chr1 228134104 228134117 ZBTB18 JASPAR yes 228135599 1482 35896503
chr1 228134105 228134115 MSC JASPAR yes 228135599 1484 35896504
chr1 228134123 228134137 JUN JASPAR yes 228135599 1462 35896505
chr1 228134126 228134137 FOSL2 JASPAR yes 228135599 1462 35896506
chr1 228134126 228134137 JUNB JASPAR yes 228135599 1462 35896507
chr1 228134126 228134139 NFKB1 JASPAR yes 228135599 1460 35896508
chr1 228134127 228134138 FOS JASPAR yes 228135599 1461 35896509
chr1 228134127 228134138 FOSL1 JASPAR yes 228135599 1461 35896510
chr1 228134127 228134138 JUND JASPAR yes 228135599 1461 35896511
chr1 228134127 228134138 NFE2 JASPAR yes 228135599 1461 35896512
chr1 228134128 228134137 JDP2 JASPAR yes 228135599 1462 35896513
chr1 228134128 228134139 FOSL2 JASPAR yes 228135599 1460 35896514
chr1 228134128 228134139 JUNB JASPAR yes 228135599 1460 35896515
chr1 228134128 228134142 JUN JASPAR yes 228135599 1457 35896516
chr1 228134136 228134148 HINFP JASPAR yes 228135599 1451 35896517
chr1 228134138 228134153 SCRT1 JASPAR yes 228135599 1446 35896518
chr1 228134140 228134153 SCRT2 JASPAR yes 228135599 1446 35896519
chr1 228134150 228134161 E2F6 JASPAR yes 228135599 1438 35896520
chr1 228134160 228134173 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1426 35896521
chr1 228134160 228134173 TFAP2C JASPAR yes 228135599 1426 35896522
chr1 228134191 228134197 YY1 JASPAR yes 228135599 1402 35896523
chr1 228134194 228134212 TP73 JASPAR yes 228135599 1387 35896524
chr1 228134219 228134228 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1371 35896525
chr1 228134236 228134241 MYC TRANSFAC yes 228135599 1358 35896526
chr1 228134242 228134261 CTCF JASPAR yes 228135599 1338 35896527
chr1 228134255 228134266 GCM1 JASPAR yes 228135599 1333 35896528
chr1 228134261 228134266 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1333 35896529
chr1 228134264 228134278 PLAG1 JASPAR yes 228135599 1321 35896530
chr1 228134264 228134279 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1320 35896531
chr1 228134264 228134279 TFAP2C JASPAR yes 228135599 1320 35896532
chr1 228134265 228134270 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1329 35896533
chr1 228134266 228134280 EBF1 JASPAR yes 228135599 1319 35896534
chr1 228134266 228134281 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1318 35896535
chr1 228134267 228134278 EBF1 JASPAR yes 228135599 1321 35896536
chr1 228134268 228134277 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1322 35896537
chr1 228134291 228134302 ESRRA JASPAR yes 228135599 1297 35896538
chr1 228134315 228134336 IRF1 JASPAR yes 228135599 1263 35896539
chr1 228134317 228134338 ZNF263 JASPAR yes 228135599 1261 35896540
chr1 228134318 228134323 ETS2 TRANSFAC yes 228135599 1276 35896541
chr1 228134319 228134334 AR JASPAR yes 228135599 1265 35896542
chr1 228134320 228134341 ZNF263 JASPAR yes 228135599 1258 35896543
chr1 228134326 228134347 ZNF263 JASPAR yes 228135599 1252 35896544
chr1 228134327 228134341 TCF7L2 JASPAR yes 228135599 1258 35896545
chr1 228134327 228134342 LEF1 JASPAR yes 228135599 1257 35896546
chr1 228134327 228134348 ZNF263 JASPAR yes 228135599 1251 35896547
chr1 228134328 228134349 IRF1 JASPAR yes 228135599 1250 35896548
chr1 228134330 228134351 ZNF263 JASPAR yes 228135599 1248 35896549
chr1 228134332 228134347 PRDM1 JASPAR yes 228135599 1252 35896550
chr1 228134332 228134353 IRF1 JASPAR yes 228135599 1246 35896551
chr1 228134336 228134351 PRDM1 JASPAR yes 228135599 1248 35896552
chr1 228134338 228134359 IRF1 JASPAR yes 228135599 1240 35896553
chr1 228134342 228134357 STAT2 JASPAR yes 228135599 1242 35896554
chr1 228134343 228134358 FOXP1 JASPAR yes 228135599 1241 35896555
chr1 228134350 228134356 HiNF-A TRANSFAC yes 228135599 1243 35896556
chr1 228134350 228134371 IRF1 JASPAR yes 228135599 1228 35896557
chr1 228134354 228134360 SOX10 JASPAR yes 228135599 1239 35896558
chr1 228134354 228134368 SPIC JASPAR yes 228135599 1231 35896559
chr1 228134354 228134369 PRDM1 JASPAR yes 228135599 1230 35896560
chr1 228134366 228134378 E2F8 JASPAR yes 228135599 1221 35896561
chr1 228134379 228134383 YY1 TRANSFAC yes 228135599 1216 35896562
chr1 228134379 228134393 IRF7 JASPAR yes 228135599 1206 35896563
chr1 228134381 228134396 FOXP1 JASPAR yes 228135599 1203 35896564
chr1 228134382 228134394 FOXC2 JASPAR yes 228135599 1205 35896565
chr1 228134383 228134394 FOXC1 JASPAR yes 228135599 1205 35896566
chr1 228134384 228134388 YY1 TRANSFAC yes 228135599 1211 35896567
chr1 228134397 228134408 ETV2 JASPAR yes 228135599 1191 35896568
chr1 228134397 228134408 SPDEF JASPAR yes 228135599 1191 35896569
chr1 228134401 228134406 GATA2 JASPAR yes 228135599 1193 35896570
chr1 228134403 228134412 ZEB1 JASPAR yes 228135599 1187 35896571
chr1 228134404 228134414 ID4 JASPAR yes 228135599 1185 35896572
chr1 228134404 228134414 TCF3 JASPAR yes 228135599 1185 35896573
chr1 228134404 228134414 TCF4 JASPAR yes 228135599 1185 35896574
chr1 228134405 228134414 SNAI2 JASPAR yes 228135599 1185 35896575
chr1 228134406 228134411 USF2 TRANSFAC yes 228135599 1188 35896576
chr1 228134428 228134433 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1166 35896577
chr1 228134442 228134455 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1144 35896578
chr1 228134447 228134452 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1147 35896579
chr1 228134448 228134453 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1146 35896580
chr1 228134473 228134492 CTCF JASPAR yes 228135599 1107 35896581
chr1 228134474 228134479 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1120 35896582
chr1 228134529 228134539 SREBF2 JASPAR yes 228135599 1060 35896583
chr1 228134529 228134540 USF1 JASPAR yes 228135599 1059 35896584
chr1 228134529 228134540 USF2 JASPAR yes 228135599 1059 35896585
chr1 228134535 228134554 CTCF JASPAR yes 228135599 1045 35896586
chr1 228134545 228134551 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1048 35896587
chr1 228134546 228134551 SP1 TRANSFAC yes 228135599 1048 35896588
chr1 228134569 228134581 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1018 35896589
chr1 228134571 228134580 TFAP2A JASPAR yes 228135599 1019 35896590
SNPs associated with WNT9A[ENSG00000143816.7], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr1 228638431 rs113019603 C T 502832 Esophagus 0.0360941 1002639
chr1 228937542 rs74957118 T G 801943 Esophagus 6.55115e-06 1004489
chr1 228101119 rs10916243 A C 5238 Heart 0.0852408 1000067
chr1 228878345 rs12060173 A G 742746 Uterus 0.159314 1004044
chr1 228096004 rs112928714 T C 10353 Lung 0.177788 999987
chr1 229135018 rs114661558 C T 999419 Adrenal 0.430054 1006766
Details of WNT9A[ENSG00000143816.7]
Back to top
Genomic Location chr1:228106357-228135599[-]
TSS 228135599
Gene Name WNT9A
Ensembl ID ENSG00000143816.7
ENTREZID 7483
Uniprot
O14904
D9ZGG3
Protein Name
Protein Wnt
Protein Wnt-9a
Expression levels of WNT9A[ENSG00000143816.7]
Back to top