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Enhancers that regulate SPARCL1[ENSG00000152583.8]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Blood (Karpas-422)
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Uterus
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VISTA
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Esophagus Astrocyte Muscle (Myoblast) Breast Muscle (Myotube) Uterus
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Uterus
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Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Epithelial (MCF-7) Brain (SK-N-SH) Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Lung Stomach Muscle (A673) Colon (HCT116) Peripheral Blood (MM.1S) Uterus Blood (Karpas-422) Lung (PC-9) Neural Stem Cells (H9) Heart
chr4 88441557 88441872 vista45341 88452213 10341
VISTA
chr4 88443267 88443740 vista45342 88452213 8473
VISTA
chr4 88446974 88447282 vista45343 88452213 4931
VISTA
chr4 88459665 88468505 enh63331 88452213 7452
Heart Esophagus Lung Uterus Neural Stem Cells (H9) Epithelial (MCF-7)
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VISTA
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VISTA
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Prostate (PC-3) Prostate (RWPE1) Bone (Osteoblast) Peripheral Blood (MM.1S) Lung (PC-9) Spleen Neural Stem Cells (H9) Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7)
chr4 88474539 88474761 vista45346 88452213 22326
VISTA
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VISTA
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VISTA
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Prostate (PC-3) Neural Stem Cells (H9) Epithelial (MCF-7)
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Esophagus Uterus Lung (PC-9)
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Brain (SK-N-MC) Astrocyte Bone (Osteoblast) Muscle (Myotube) Uterus Epithelial (MCF-7)
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Uterus
Transcript facotrs that regulate SPARCL1[ENSG00000152583.8]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr4 88447821 88447834 TFAP2B JASPAR yes 88452213 4379 91124743
chr4 88447821 88447834 TFAP2C JASPAR yes 88452213 4379 91124744
chr4 88447833 88447842 ZEB1 JASPAR yes 88452213 4371 91124745
chr4 88447834 88447844 FIGLA JASPAR yes 88452213 4369 91124746
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chr4 88447834 88447844 TCF3 JASPAR yes 88452213 4369 91124748
chr4 88447834 88447844 TCF4 JASPAR yes 88452213 4369 91124749
chr4 88447836 88447841 USF2 TRANSFAC yes 88452213 4372 91124750
chr4 88447844 88447858 POU4F1 JASPAR yes 88452213 4355 91124751
chr4 88447844 88447860 POU4F2 JASPAR yes 88452213 4353 91124752
chr4 88447844 88447860 POU4F3 JASPAR yes 88452213 4353 91124753
chr4 88447849 88447853 YY1 TRANSFAC yes 88452213 4360 91124754
chr4 88447850 88447860 HOXA13 JASPAR yes 88452213 4353 91124755
chr4 88447850 88447860 HOXD13 JASPAR yes 88452213 4353 91124756
chr4 88447850 88447861 HOXA10 JASPAR yes 88452213 4352 91124757
chr4 88447851 88447860 CDX1 JASPAR yes 88452213 4353 91124758
chr4 88447851 88447862 CDX2 JASPAR yes 88452213 4351 91124759
chr4 88447871 88447875 TEAD2 TRANSFAC yes 88452213 4338 91124760
chr4 88447873 88447880 NKX3-1 JASPAR yes 88452213 4333 91124761
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chr4 88447878 88447889 ELF5 JASPAR yes 88452213 4324 91124763
chr4 88447880 88447885 ETS2 TRANSFAC yes 88452213 4328 91124764
chr4 88447893 88447904 FOXC1 JASPAR yes 88452213 4309 91124765
chr4 88447937 88447952 AR JASPAR yes 88452213 4261 91124766
chr4 88447940 88447950 NEUROG2 JASPAR yes 88452213 4263 91124767
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chr4 88447977 88447989 PBX1 JASPAR yes 88452213 4224 91124769
chr4 88447978 88447992 ONECUT2 JASPAR yes 88452213 4221 91124770
chr4 88447982 88447995 DUXA JASPAR yes 88452213 4218 91124771
chr4 88447983 88447994 DUX4 JASPAR yes 88452213 4219 91124772
chr4 88448001 88448013 YY1 JASPAR yes 88452213 4200 91124773
chr4 88448061 88448065 TEAD2 TRANSFAC yes 88452213 4148 91124774
chr4 88448062 88448070 RHOXF1 JASPAR yes 88452213 4143 91124775
chr4 88448069 88448073 YY1 TRANSFAC yes 88452213 4140 91124776
chr4 88448069 88448084 STAT1 JASPAR yes 88452213 4129 91124777
chr4 88448096 88448102 SOX10 JASPAR yes 88452213 4111 91124778
chr4 88448107 88448122 FOXA1 JASPAR yes 88452213 4091 91124779
chr4 88448111 88448122 FOXA1 JASPAR yes 88452213 4091 91124780
chr4 88448133 88448137 YY1 TRANSFAC yes 88452213 4076 91124781
chr4 88448135 88448146 RUNX1 JASPAR yes 88452213 4067 91124782
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chr4 88448154 88448158 TEAD2 TRANSFAC yes 88452213 4055 91124784
chr4 88448154 88448159 TBP TRANSFAC yes 88452213 4054 91124785
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chr4 88448169 88448180 FOXB1 JASPAR yes 88452213 4033 91124789
chr4 88448169 88448180 FOXC1 JASPAR yes 88452213 4033 91124790
chr4 88448169 88448181 FOXC2 JASPAR yes 88452213 4032 91124791
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chr4 88448171 88448175 TEAD2 TRANSFAC yes 88452213 4038 91124793
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chr4 88448180 88448192 TAL1 JASPAR yes 88452213 4021 91124796
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chr4 88448182 88448194 TAL1 JASPAR yes 88452213 4019 91124803
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chr4 88448207 88448211 ESR1 TRANSFAC yes 88452213 4002 91124811
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chr4 88448303 88448314 FOSL1 JASPAR yes 88452213 3899 91124830
chr4 88448341 88448345 NFE TRANSFAC yes 88452213 3868 91124831
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chr4 88448374 88448388 PLAG1 JASPAR yes 88452213 3825 91124835
chr4 88448441 88448446 ETS2 TRANSFAC yes 88452213 3767 91124836
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chr4 88448457 88448469 MEF2D JASPAR yes 88452213 3744 91124839
chr4 88448457 88448471 FOXF2 JASPAR yes 88452213 3742 91124840
chr4 88448458 88448468 MEF2A JASPAR yes 88452213 3745 91124841
chr4 88448459 88448463 YY1 TRANSFAC yes 88452213 3750 91124842
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chr4 88448459 88448469 HOXB13 JASPAR yes 88452213 3744 91124844
chr4 88448459 88448469 HOXD13 JASPAR yes 88452213 3744 91124845
chr4 88448463 88448475 ZBTB7B JASPAR yes 88452213 3738 91124846
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chr4 88448488 88448501 HSF4 JASPAR yes 88452213 3712 91124851
chr4 88448501 88448506 GATA2 JASPAR yes 88452213 3707 91124852
chr4 88448520 88448529 NKX2-8 JASPAR yes 88452213 3684 91124853
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chr4 88448796 88448801 ETS2 TRANSFAC yes 88452213 3412 91124899
chr4 88448796 88448804 FEV JASPAR yes 88452213 3409 91124900
chr4 88448797 88448808 NFKB1 JASPAR yes 88452213 3405 91124901
chr4 88448798 88448808 REL JASPAR yes 88452213 3405 91124902
chr4 88448807 88448822 SOX21 JASPAR yes 88452213 3391 91124903
chr4 88448807 88448823 SOX4 JASPAR yes 88452213 3390 91124904
chr4 88448812 88448822 GBX2 JASPAR yes 88452213 3391 91124905
chr4 88448812 88448822 HOXB3 JASPAR yes 88452213 3391 91124906
chr4 88448812 88448822 MNX1 JASPAR yes 88452213 3391 91124907
chr4 88448813 88448821 BARX1 JASPAR yes 88452213 3392 91124908
chr4 88448813 88448821 EN1 JASPAR yes 88452213 3392 91124909
chr4 88448813 88448821 ISL2 JASPAR yes 88452213 3392 91124910
chr4 88448813 88448821 MSX1 JASPAR yes 88452213 3392 91124911
chr4 88448813 88448821 MSX2 JASPAR yes 88452213 3392 91124912
chr4 88448813 88448821 PDX1 JASPAR yes 88452213 3392 91124913
chr4 88448813 88448822 VENTX JASPAR yes 88452213 3391 91124914
chr4 88448815 88448826 CEBPB JASPAR yes 88452213 3387 91124915
chr4 88448816 88448826 CEBPB JASPAR yes 88452213 3387 91124916
chr4 88448816 88448826 CEBPE JASPAR yes 88452213 3387 91124917
chr4 88448816 88448826 CEBPG JASPAR yes 88452213 3387 91124918
chr4 88448816 88448827 CEBPA JASPAR yes 88452213 3386 91124919
chr4 88448841 88448862 IRF1 JASPAR yes 88452213 3351 91124920
chr4 88448845 88448860 PRDM1 JASPAR yes 88452213 3353 91124921
chr4 88448852 88448867 HNF4G JASPAR yes 88452213 3346 91124922
chr4 88448853 88448867 NR2F1 JASPAR yes 88452213 3346 91124923
chr4 88448853 88448868 HNF4A JASPAR yes 88452213 3345 91124924
chr4 88448861 88448876 MEF2C JASPAR yes 88452213 3337 91124925
chr4 88448862 88448877 MEF2A JASPAR yes 88452213 3336 91124926
chr4 88448863 88448870 TBP TRANSFAC yes 88452213 3343 91124927
chr4 88448863 88448870 TFIID TRANSFAC yes 88452213 3343 91124928
chr4 88448871 88448874 MYB TRANSFAC yes 88452213 3339 91124929
chr4 88448873 88448883 MAX JASPAR yes 88452213 3330 91124930
chr4 88448909 88448927 NFYA JASPAR yes 88452213 3286 91124931
chr4 88448912 88448928 NFYA JASPAR yes 88452213 3285 91124932
chr4 88448913 88448924 FOXH1 JASPAR yes 88452213 3289 91124933
chr4 88448915 88448930 NFYB JASPAR yes 88452213 3283 91124934
chr4 88448917 88448922 NFY TRANSFAC yes 88452213 3291 91124935
chr4 88448927 88448934 POU2F1 TRANSFAC yes 88452213 3279 91124936
chr4 88448946 88448965 PAX5 JASPAR yes 88452213 3248 91124937
chr4 88448952 88448958 TCF4 TRANSFAC yes 88452213 3255 91124938
chr4 88448985 88448988 MYB TRANSFAC yes 88452213 3225 91124939
chr4 88449012 88449027 FOXP1 JASPAR yes 88452213 3186 91124940
chr4 88449014 88449029 FOXP1 JASPAR yes 88452213 3184 91124941
chr4 88449018 88449024 TBP TRANSFAC yes 88452213 3189 91124942
chr4 88449030 88449040 HMBOX1 JASPAR yes 88452213 3173 91124943
chr4 88449034 88449043 SRY JASPAR yes 88452213 3170 91124944
chr4 88449036 88449039 MYB TRANSFAC yes 88452213 3174 91124945
chr4 88449036 88449045 SOX9 JASPAR yes 88452213 3168 91124946
SNPs associated with SPARCL1[ENSG00000152583.8], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr4 88440217 rs17012758 A G 0 Esophagus 0.0199372 7672116
chr4 88462729 rs7681694 G A 10516 Pancreas 0.00977251 7672275
chr4 88447816 rs62315968 C T 0 Breast 7.49796e-08 7672222
chr4 88437710 rs10001608 T C 0 Spleen 0.0158644 7672075
chr4 88291233 rs6531983 A G 103254 Uterus 0.0777864 7671614
chr4 88809782 rs115345087 T C 357569 Stomach 0.137293 7673605
chr4 88468386 rs7685612 G A 16173 Adrenal 0.00577219 7672372
Details of SPARCL1[ENSG00000152583.8]
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Genomic Location chr4:88394487-88452213[-]
TSS 88452213
Gene Name SPARCL1
Ensembl ID ENSG00000152583.8
ENTREZID 8404
Uniprot
Q8N4S1
B7ZB68
Q14515
A0A024RDE1
Protein Name
Proliferation-inducing protein 33
SPARC-like 1
SPARC-like protein 1
Expression levels of SPARCL1[ENSG00000152583.8]
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