EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. HLA-E[ENSG00000204592.5]
Enhancers that regulate HLA-E[ENSG00000204592.5]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr6 30365585 30369735 enh84144 30457244 87509
Prostate (PC-3)
chr6 30416125 30421555 enh108060 30457244 35689
Blood (T-cell)
chr6 30434534 30434831 vista51514 30457244 22413
VISTA
chr6 30447945 30452095 enh91684 30457244 5149
Bone Marrow (K562)
chr6 30448319 30448624 vista51515 30457244 8620
VISTA
chr6 30453844 30454132 vista51516 30457244 3112
VISTA
chr6 30455675 30455831 vista51517 30457244 1413
VISTA
chr6 30460125 30470835 enh38942 30457244 2881
Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Brain (SK-N-MC) Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Stomach Lung (PC-9) Uterus Blood (T-cell) Heart
chr6 30473580 30480435 enh9029 30457244 16336
Brain (SK-N-MC) Blood (T-cell) Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422) Thymus Stomach
chr6 30477053 30477329 vista51518 30457244 19809
VISTA
chr6 30480725 30492015 enh9030 30457244 23481
Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Prostate (RWPE1) Esophagus Bone (Osteoblast) Blood (Karpas-422) Lung (PC-9) Breast Uterus Blood (T-cell)
chr6 30493525 30503995 enh38943 30457244 36281
Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Colon (HCT116) Peripheral Blood (MM.1S) Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Blood (T-cell) Stomach
chr6 30495647 30495976 vista51519 30457244 38403
VISTA
chr6 30497378 30497566 vista51520 30457244 40134
VISTA
chr6 30497672 30498068 vista51521 30457244 40428
VISTA
chr6 30519269 30519607 vista51522 30457244 62025
VISTA
chr6 30540485 30544635 enh108061 30457244 83241
Blood (T-cell)
Transcript facotrs that regulate HLA-E[ENSG00000204592.5]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr6 30453852 30453865 NFKB1 JASPAR yes 30457244 3379 70342835
chr6 30453852 30453865 NFKB2 JASPAR yes 30457244 3379 70342836
chr6 30453883 30453900 RARA JASPAR yes 30457244 3344 70342837
chr6 30453886 30453892 PTF TRANSFAC yes 30457244 3352 70342838
chr6 30453944 30453950 YY1 JASPAR yes 30457244 3294 70342839
chr6 30453955 30453960 GATA2 JASPAR yes 30457244 3284 70342840
chr6 30453969 30453980 GCM1 JASPAR yes 30457244 3264 70342841
chr6 30453985 30453996 NFIL3 JASPAR yes 30457244 3248 70342842
chr6 30453990 30453993 MYB TRANSFAC yes 30457244 3251 70342843
chr6 30454002 30454009 NKX3-1 JASPAR yes 30457244 3235 70342844
chr6 30454021 30454024 MYB TRANSFAC yes 30457244 3220 70342845
chr6 30454045 30454055 TBX21 JASPAR yes 30457244 3189 70342846
chr6 30454045 30454056 TBX2 JASPAR yes 30457244 3188 70342847
chr6 30454045 30454058 EOMES JASPAR yes 30457244 3186 70342848
chr6 30454046 30454056 TBR1 JASPAR yes 30457244 3188 70342849
chr6 30454051 30454059 FOXO3 JASPAR yes 30457244 3185 70342850
chr6 30454056 30454066 ZNF740 JASPAR yes 30457244 3178 70342851
chr6 30454056 30454070 ZIC1 JASPAR yes 30457244 3174 70342852
chr6 30454056 30454071 ZIC3 JASPAR yes 30457244 3173 70342853
chr6 30454056 30454071 ZIC4 JASPAR yes 30457244 3173 70342854
chr6 30454080 30454086 SOX10 JASPAR yes 30457244 3158 70342855
chr6 30454085 30454091 ZNF354C JASPAR yes 30457244 3153 70342856
chr6 30454087 30454092 GATA2 JASPAR yes 30457244 3152 70342857
chr6 30454095 30454109 STAT1 JASPAR yes 30457244 3135 70342858
chr6 30454095 30454110 STAT2 JASPAR yes 30457244 3134 70342859
chr6 30454100 30454114 IRF7 JASPAR yes 30457244 3130 70342860
chr6 30454101 30454116 PRDM1 JASPAR yes 30457244 3128 70342861
chr6 30454101 30454116 STAT2 JASPAR yes 30457244 3128 70342862
chr6 30454101 30454119 IRF2 JASPAR yes 30457244 3125 70342863
chr6 30455684 30455699 NR2C2 JASPAR yes 30457244 1545 70342864
chr6 30455686 30455696 SP1 JASPAR yes 30457244 1548 70342865
chr6 30455726 30455735 HIC2 JASPAR yes 30457244 1509 70342866
chr6 30455729 30455733 LFA1 TRANSFAC yes 30457244 1511 70342867
chr6 30455732 30455736 YY1 TRANSFAC yes 30457244 1508 70342868
chr6 30455741 30455751 MZF1 JASPAR yes 30457244 1493 70342869
chr6 30455747 30455753 PEA3 TRANSFAC yes 30457244 1491 70342870
chr6 30455750 30455763 POU2F2 JASPAR yes 30457244 1481 70342871
chr6 30455759 30455775 ZNF143 JASPAR yes 30457244 1469 70342872
chr6 30455763 30455773 HOXA13 JASPAR yes 30457244 1471 70342873
chr6 30455763 30455773 HOXB13 JASPAR yes 30457244 1471 70342874
chr6 30455763 30455773 HOXD13 JASPAR yes 30457244 1471 70342875
chr6 30455763 30455778 STAT1 JASPAR yes 30457244 1466 70342876
chr6 30455764 30455773 CDX1 JASPAR yes 30457244 1471 70342877
chr6 30455764 30455775 CDX2 JASPAR yes 30457244 1469 70342878
chr6 30455765 30455776 STAT1 JASPAR yes 30457244 1468 70342879
chr6 30455770 30455785 AR JASPAR yes 30457244 1459 70342880
chr6 30455810 30455815 ETS2 TRANSFAC yes 30457244 1429 70342881
chr6 30455818 30455822 H4TF2 TRANSFAC yes 30457244 1422 70342882
chr6 30461233 30461238 ETS2 TRANSFAC yes 30457244 3989 101034266
chr6 30461239 30461249 FIGLA JASPAR yes 30457244 3995 101034267
chr6 30461239 30461249 TCF3 JASPAR yes 30457244 3995 101034268
chr6 30461240 30461249 SNAI2 JASPAR yes 30457244 3996 101034269
chr6 30461241 30461246 USF2 TRANSFAC yes 30457244 3997 101034270
chr6 30461276 30461291 FOXP1 JASPAR yes 30457244 4032 101034271
chr6 30461277 30461286 SRY JASPAR yes 30457244 4033 101034272
chr6 30461277 30461288 FOXP2 JASPAR yes 30457244 4033 101034273
chr6 30461277 30461289 FOXC2 JASPAR yes 30457244 4033 101034274
chr6 30461278 30461289 FOXC1 JASPAR yes 30457244 4034 101034275
chr6 30461279 30461287 FOXO3 JASPAR yes 30457244 4035 101034276
chr6 30461287 30461302 RUNX2 JASPAR yes 30457244 4043 101034277
chr6 30461291 30461301 RUNX3 JASPAR yes 30457244 4047 101034278
chr6 30461292 30461301 RUNX2 JASPAR yes 30457244 4048 101034279
chr6 30461304 30461315 E2F6 JASPAR yes 30457244 4060 101034280
chr6 30461304 30461318 E2F7 JASPAR yes 30457244 4060 101034281
chr6 30461325 30461332 JUN TRANSFAC yes 30457244 4081 101034282
chr6 30461325 30461332 SP1 TRANSFAC yes 30457244 4081 101034283
chr6 30461330 30461339 PITX3 JASPAR yes 30457244 4086 101034284
chr6 30461330 30461340 GSC2 JASPAR yes 30457244 4086 101034285
chr6 30461330 30461340 GSC JASPAR yes 30457244 4086 101034286
chr6 30461331 30461339 OTX1 JASPAR yes 30457244 4087 101034287
chr6 30461331 30461339 OTX2 JASPAR yes 30457244 4087 101034288
chr6 30461331 30461339 RHOXF1 JASPAR yes 30457244 4087 101034289
chr6 30461332 30461350 SRF JASPAR yes 30457244 4088 101034290
chr6 30461358 30461363 SP1 TRANSFAC yes 30457244 4114 101034291
chr6 30461361 30461366 SP1 TRANSFAC yes 30457244 4117 101034292
chr6 30461369 30461387 NFYA JASPAR yes 30457244 4125 101034293
chr6 30461372 30461388 NFYA JASPAR yes 30457244 4128 101034294
chr6 30461375 30461388 DUXA JASPAR yes 30457244 4131 101034295
chr6 30461375 30461390 NFYB JASPAR yes 30457244 4131 101034296
chr6 30461376 30461387 DUX4 JASPAR yes 30457244 4132 101034297
chr6 30461377 30461382 NFY TRANSFAC yes 30457244 4133 101034298
chr6 30461399 30461413 PAX6 JASPAR yes 30457244 4155 101034299
chr6 30461412 30461422 PAX3 JASPAR yes 30457244 4168 101034300
chr6 30461412 30461422 PAX7 JASPAR yes 30457244 4168 101034301
chr6 30461415 30461423 RHOXF1 JASPAR yes 30457244 4171 101034302
chr6 30461415 30461424 PITX3 JASPAR yes 30457244 4171 101034303
chr6 30461419 30461427 BSX JASPAR yes 30457244 4175 101034304
chr6 30461419 30461428 VENTX JASPAR yes 30457244 4175 101034305
chr6 30461431 30461443 TEAD1 JASPAR yes 30457244 4187 101034306
chr6 30461454 30461458 TEAD2 TRANSFAC yes 30457244 4210 101034307
chr6 30461461 30461468 SPIB JASPAR yes 30457244 4217 101034308
chr6 30461464 30461479 STAT2 JASPAR yes 30457244 4220 101034309
chr6 30461485 30461494 HIC2 JASPAR yes 30457244 4241 101034310
chr6 30461488 30461498 SP1 JASPAR yes 30457244 4244 101034311
chr6 30461490 30461505 RUNX2 JASPAR yes 30457244 4246 101034312
chr6 30461521 30461530 NKX3-2 JASPAR yes 30457244 4277 101034313
chr6 30461539 30461549 NHLH1 JASPAR yes 30457244 4295 101034314
chr6 30461547 30461561 PLAG1 JASPAR yes 30457244 4303 101034315
chr6 30461585 30461591 ZNF354C JASPAR yes 30457244 4341 101034316
chr6 30461649 30461663 NR2F1 JASPAR yes 30457244 4405 101034317
chr6 30461682 30461701 CTCF JASPAR yes 30457244 4438 101034318
chr6 30461686 30461700 EBF1 JASPAR yes 30457244 4442 101034319
chr6 30461687 30461698 EBF1 JASPAR yes 30457244 4443 101034320
chr6 30461688 30461699 EBF1 JASPAR yes 30457244 4444 101034321
chr6 30461699 30461710 TFAP2C JASPAR yes 30457244 4455 101034322
chr6 30461731 30461745 CREB3L1 JASPAR yes 30457244 4487 101034323
chr6 30461754 30461769 RUNX2 JASPAR yes 30457244 4510 101034324
chr6 30461756 30461767 TFAP2C JASPAR yes 30457244 4512 101034325
chr6 30461778 30461792 PLAG1 JASPAR yes 30457244 4534 101034326
chr6 30461780 30461793 TFAP2A JASPAR yes 30457244 4536 101034327
chr6 30461780 30461793 TFAP2B JASPAR yes 30457244 4536 101034328
chr6 30461780 30461793 TFAP2C JASPAR yes 30457244 4536 101034329
chr6 30461787 30461792 SP1 TRANSFAC yes 30457244 4543 101034330
chr6 30461792 30461796 H1TF2 TRANSFAC yes 30457244 4548 101034331
chr6 30461792 30461796 NFE TRANSFAC yes 30457244 4548 101034332
chr6 30461792 30461796 SRF TRANSFAC yes 30457244 4548 101034333
chr6 30461815 30461826 NFE2L2 JASPAR yes 30457244 4571 101034334
chr6 30461873 30461886 NR2F1 JASPAR yes 30457244 4629 101034335
chr6 30461885 30461888 MYB TRANSFAC yes 30457244 4641 101034336
chr6 30461889 30461899 NHLH1 JASPAR yes 30457244 4645 101034337
chr6 30461924 30461935 RUNX1 JASPAR yes 30457244 4680 101034338
chr6 30461967 30461980 POU2F2 JASPAR yes 30457244 4723 101034339
chr6 30461969 30461973 YY1 TRANSFAC yes 30457244 4725 101034340
chr6 30461975 30461979 YY1 TRANSFAC yes 30457244 4731 101034341
chr6 30461980 30461984 YY1 TRANSFAC yes 30457244 4736 101034342
chr6 30462016 30462019 MYB TRANSFAC yes 30457244 4772 101034343
chr6 30462016 30462027 RUNX1 JASPAR yes 30457244 4772 101034344
chr6 30462030 30462034 NFE TRANSFAC yes 30457244 4786 101034345
chr6 30462031 30462036 GATA2 JASPAR yes 30457244 4787 101034346
chr6 30462044 30462048 H1TF2 TRANSFAC yes 30457244 4800 101034347
chr6 30462044 30462048 NFE TRANSFAC yes 30457244 4800 101034348
chr6 30462044 30462048 SRF TRANSFAC yes 30457244 4800 101034349
chr6 30462054 30462058 H4TF2 TRANSFAC yes 30457244 4810 101034350
chr6 30462094 30462112 ESR1 JASPAR yes 30457244 4850 101034351
chr6 30462096 30462100 ESR1 TRANSFAC yes 30457244 4852 101034352
chr6 30462105 30462119 STAT1 JASPAR yes 30457244 4861 101034353
chr6 30462121 30462134 NFKB1 JASPAR yes 30457244 4877 101034354
chr6 30462136 30462146 SREBF2 JASPAR yes 30457244 4892 101034355
chr6 30462138 30462143 USF2 TRANSFAC yes 30457244 4894 101034356
chr6 30462153 30462157 NFE TRANSFAC yes 30457244 4909 101034357
chr6 30462155 30462165 SREBF1 JASPAR yes 30457244 4911 101034358
chr6 30462155 30462165 SREBF2 JASPAR yes 30457244 4911 101034359
chr6 30462155 30462165 TFEB JASPAR yes 30457244 4911 101034360
chr6 30462155 30462166 USF2 JASPAR yes 30457244 4911 101034361
chr6 30462164 30462169 GATA2 JASPAR yes 30457244 4920 101034362
chr6 30462176 30462191 SCRT1 JASPAR yes 30457244 4932 101034363
chr6 30462197 30462217 ESR1 JASPAR yes 30457244 4953 101034364
chr6 30462211 30462221 TBX21 JASPAR yes 30457244 4967 101034365
chr6 30462211 30462222 TBX20 JASPAR yes 30457244 4967 101034366
chr6 30462211 30462222 TBX2 JASPAR yes 30457244 4967 101034367
chr6 30462211 30462224 EOMES JASPAR yes 30457244 4967 101034368
chr6 30462212 30462220 MGA JASPAR yes 30457244 4968 101034369
chr6 30462212 30462220 TBX15 JASPAR yes 30457244 4968 101034370
chr6 30462212 30462220 TBX1 JASPAR yes 30457244 4968 101034371
chr6 30462212 30462220 TBX4 JASPAR yes 30457244 4968 101034372
chr6 30462212 30462220 TBX5 JASPAR yes 30457244 4968 101034373
chr6 30462212 30462222 TBR1 JASPAR yes 30457244 4968 101034374
chr6 30462216 30462232 POU4F2 JASPAR yes 30457244 4972 101034375
chr6 30462220 30462232 IRF1 JASPAR yes 30457244 4976 101034376
chr6 30462233 30462237 YY1 TRANSFAC yes 30457244 4989 101034377
chr6 30462235 30462246 FLI1 JASPAR yes 30457244 4991 101034378
chr6 30462236 30462249 ELF1 JASPAR yes 30457244 4992 101034379
chr6 30462239 30462251 HNF1B JASPAR yes 30457244 4995 101034380
SNPs associated with HLA-E[ENSG00000204592.5], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 30458064 rs1264457 G A 0 Esophagus 0.000166652 8947162
chr6 30500536 rs3130039 C T 38554 Esophagus 0.0251344 8947595
chr6 30495743 rs2534825 A G 33761 Heart 0.000803701 8947535
chr6 30458064 rs1264457 G A 0 Pancreas 0.108744 8947162
chr6 30539438 rs3132612 C G 77456 Breast 0.000119554 8947685
chr6 31316526 rs9265994 T C 854544 Ovary 0.0868768 8955823
chr6 30496816 rs2534823 C G 34834 Uterus 0.0247979 8947553
chr6 30070932 rs2240071 C G 386312 Liver 0.0939366 8945779
chr6 31320242 rs2442721 C T 858260 Adrenal 0.410588 8956056
Details of HLA-E[ENSG00000204592.5]
Back to top
Genomic Location chr6:30457244-30461982[+]
TSS 30457244
Gene Name HLA-E
Ensembl ID ENSG00000204592.5
ENTREZID 3133
Uniprot
Q6DU44
P13747
O19682
A8K8M6
Protein Name
E
alpha chain E
class I
HLA class I histocompatibility antigen
HLA-E
HLA-E protein
Leucocyte Antigen
MHC antigen
MHC class I antigen
MHC class Ib antigen
Major histocompatibility complex
Expression levels of HLA-E[ENSG00000204592.5]
Back to top