EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. KRT23[ENSG00000108244.12]
Enhancers that regulate KRT23[ENSG00000108244.12]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr17 38995625 38999775 enh112500 39093886 94111
Brain (SK-N-MC)
chr17 39001145 39015955 enh17144 39093886 77931
Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-MC) Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Muscle (A673) Placenta Colon (HCT116) Uterus Lung (PC-9) Breast Muscle (Myotube) Neural Stem Cells (H9) Epithelial (MCF-7)
chr17 39003172 39003257 vista24757 39093886 90629
VISTA
chr17 39010500 39010808 vista24758 39093886 83078
VISTA
chr17 39012522 39012675 vista24759 39093886 81211
VISTA
chr17 39055145 39077753 enh17145 39093886 16133
Brain (SK-N-MC) Astrocyte Colon (HCT116) Uterus Stomach Epithelial (MCF-7) Skin (Keratinocyte) Bone (Osteoblast) Lung (A549) Pancreas (Panc1) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Placenta Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Liver (HepG2) Prostate (RWPE1) Muscle (A673)
chr17 39066622 39066986 vista24760 39093886 26900
VISTA
chr17 39069125 39069341 vista24761 39093886 24545
VISTA
chr17 39086965 39091115 enh32191 39093886 2771
Astrocyte
chr17 39088847 39089143 vista24762 39093886 4743
VISTA
chr17 39091937 39092186 vista24763 39093886 1700
VISTA
chr17 39099743 39114455 enh17146 39093886 5857
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Brain (SK-N-MC) Large Intestine Ovary Esophagus Placenta Colon (HCT116) Lung (PC-9)
chr17 39108843 39109211 vista24764 39093886 14957
VISTA
chr17 39110175 39110404 vista24765 39093886 16289
VISTA
chr17 39113005 39113367 vista24766 39093886 19119
VISTA
chr17 39167445 39171815 enh81207 39093886 73559
Prostate (PC-3) Brain (SK-N-MC) Lung (PC-9)
Transcript facotrs that regulate KRT23[ENSG00000108244.12]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr17 39088893 39088904 PHOX2A JASPAR yes 39093886 4982 21237400
chr17 39088893 39088904 PROP1 JASPAR yes 39093886 4982 21237401
chr17 39088893 39088904 PHOX2A JASPAR yes 39093886 4982 54245538
chr17 39088893 39088904 PROP1 JASPAR yes 39093886 4982 54245539
chr17 39088908 39088924 ZNF143 JASPAR yes 39093886 4962 21237402
chr17 39088908 39088924 ZNF143 JASPAR yes 39093886 4962 54245540
chr17 39088918 39088931 NFKB2 JASPAR yes 39093886 4955 21237403
chr17 39088918 39088931 NFKB2 JASPAR yes 39093886 4955 54245541
chr17 39088919 39088929 REL JASPAR yes 39093886 4957 21237404
chr17 39088919 39088929 REL JASPAR yes 39093886 4957 54245542
chr17 39088920 39088930 NFKB1 JASPAR yes 39093886 4956 21237405
chr17 39088920 39088930 REL JASPAR yes 39093886 4956 21237406
chr17 39088920 39088930 NFKB1 JASPAR yes 39093886 4956 54245543
chr17 39088920 39088930 REL JASPAR yes 39093886 4956 54245544
chr17 39088929 39088933 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4953 21237407
chr17 39088929 39088933 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4953 54245545
chr17 39088930 39088945 FOXA1 JASPAR yes 39093886 4941 21237408
chr17 39088930 39088945 FOXA1 JASPAR yes 39093886 4941 54245546
chr17 39088932 39088944 FOXC2 JASPAR yes 39093886 4942 21237409
chr17 39088932 39088944 FOXC2 JASPAR yes 39093886 4942 54245547
chr17 39088932 39088945 POU2F2 JASPAR yes 39093886 4941 21237410
chr17 39088932 39088945 POU2F2 JASPAR yes 39093886 4941 54245548
chr17 39088933 39088944 FOXB1 JASPAR yes 39093886 4942 21237411
chr17 39088933 39088944 FOXC1 JASPAR yes 39093886 4942 21237412
chr17 39088933 39088944 FOXB1 JASPAR yes 39093886 4942 54245549
chr17 39088933 39088944 FOXC1 JASPAR yes 39093886 4942 54245550
chr17 39088933 39088945 POU3F1 JASPAR yes 39093886 4941 21237413
chr17 39088933 39088945 POU3F1 JASPAR yes 39093886 4941 54245551
chr17 39088934 39088938 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4948 21237414
chr17 39088934 39088938 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4948 54245552
chr17 39088934 39088945 FOXA1 JASPAR yes 39093886 4941 21237415
chr17 39088934 39088945 FOXA1 JASPAR yes 39093886 4941 54245553
chr17 39088934 39088946 POU2F1 JASPAR yes 39093886 4940 21237416
chr17 39088934 39088946 POU2F1 JASPAR yes 39093886 4940 54245554
chr17 39088935 39088944 POU3F4 JASPAR yes 39093886 4942 21237417
chr17 39088935 39088944 POU5F1B JASPAR yes 39093886 4942 21237418
chr17 39088935 39088944 POU3F4 JASPAR yes 39093886 4942 54245555
chr17 39088935 39088944 POU5F1B JASPAR yes 39093886 4942 54245556
chr17 39088936 39088944 FOXL1 JASPAR yes 39093886 4942 21237419
chr17 39088936 39088944 FOXL1 JASPAR yes 39093886 4942 54245557
chr17 39088949 39088954 ETS2 TRANSFAC yes 39093886 4932 21237420
chr17 39088949 39088954 ETS2 TRANSFAC yes 39093886 4932 54245558
chr17 39088949 39088967 SRF JASPAR yes 39093886 4919 21237421
chr17 39088949 39088967 SRF JASPAR yes 39093886 4919 54245559
chr17 39088955 39088959 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4927 21237422
chr17 39088955 39088959 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4927 54245560
chr17 39088966 39088970 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4916 21237423
chr17 39088966 39088970 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4916 54245561
chr17 39088978 39088984 SOX10 JASPAR yes 39093886 4902 21237424
chr17 39088978 39088984 SOX10 JASPAR yes 39093886 4902 54245562
chr17 39088991 39089005 TCF7L2 JASPAR yes 39093886 4881 21237425
chr17 39088991 39089005 TCF7L2 JASPAR yes 39093886 4881 54245563
chr17 39088996 39089002 SOX10 JASPAR yes 39093886 4884 21237426
chr17 39088996 39089002 SOX10 JASPAR yes 39093886 4884 54245564
chr17 39088998 39089661 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 39093886 4225 108257992
chr17 39089001 39089672 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 39093886 4214 108257993
chr17 39089007 39089385 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4501 108257994
chr17 39089019 39089023 H4TF2 TRANSFAC yes 39093886 4863 21237427
chr17 39089019 39089023 H4TF2 TRANSFAC yes 39093886 4863 54245565
chr17 39089020 39089035 MEF2A JASPAR yes 39093886 4851 21237428
chr17 39089020 39089035 MEF2A JASPAR yes 39093886 4851 54245566
chr17 39089021 39089036 MEF2C JASPAR yes 39093886 4850 21237429
chr17 39089021 39089036 MEF2C JASPAR yes 39093886 4850 54245567
chr17 39089022 39089034 MEF2A JASPAR yes 39093886 4852 21237430
chr17 39089022 39089034 MEF2B JASPAR yes 39093886 4852 21237431
chr17 39089022 39089034 MEF2D JASPAR yes 39093886 4852 21237432
chr17 39089022 39089034 MEF2A JASPAR yes 39093886 4852 54245568
chr17 39089022 39089034 MEF2B JASPAR yes 39093886 4852 54245569
chr17 39089022 39089034 MEF2D JASPAR yes 39093886 4852 54245570
chr17 39089023 39089033 MEF2A JASPAR yes 39093886 4853 21237433
chr17 39089023 39089033 MEF2A JASPAR yes 39093886 4853 54245571
chr17 39089024 39089028 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4858 21237434
chr17 39089024 39089028 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4858 54245572
chr17 39089032 39089853 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 39093886 4033 108257995
chr17 39089037 39089953 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 3933 108257996
chr17 39089046 39089056 TEAD1 JASPAR yes 39093886 4830 21237435
chr17 39089046 39089056 TEAD4 JASPAR yes 39093886 4830 21237436
chr17 39089046 39089056 TEAD1 JASPAR yes 39093886 4830 54245573
chr17 39089046 39089056 TEAD4 JASPAR yes 39093886 4830 54245574
chr17 39089050 39089846 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 39093886 4040 108257997
chr17 39089054 39089727 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4159 108257998
chr17 39089059 39089403 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4483 108257999
chr17 39089061 39089577 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 39093886 4309 108258000
chr17 39089062 39089523 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 4363 108258001
chr17 39089077 39089301 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4585 108258002
chr17 39089087 39089093 YY1 JASPAR yes 39093886 4793 21237437
chr17 39089087 39089093 YY1 JASPAR yes 39093886 4793 54245575
chr17 39089097 39089599 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4287 108258003
chr17 39089099 39089619 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 4267 108258004
chr17 39089105 39089544 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 4342 108258005
chr17 39089110 39089638 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 39093886 4248 108258006
chr17 39089112 39089834 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4052 108258007
chr17 39089122 39089791 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4095 108258008
chr17 39089126 39089650 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4236 108258009
chr17 39089135 39089767 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 4119 108258010
chr17 39089159 39089177 MAFF JASPAR yes 39093886 4709 54245576
chr17 39089161 39089166 NFY TRANSFAC yes 39093886 4720 54245577
chr17 39089213 39089222 SRY JASPAR yes 39093886 4664 54245578
chr17 39089215 39089218 MYB TRANSFAC yes 39093886 4668 54245579
chr17 39089215 39089224 SOX9 JASPAR yes 39093886 4662 54245580
chr17 39089221 39089235 BATF3 JASPAR yes 39093886 4651 54245581
chr17 39089227 39089241 TCF7L2 JASPAR yes 39093886 4645 54245582
chr17 39089227 39089242 LEF1 JASPAR yes 39093886 4644 54245583
chr17 39089275 39089288 POU3F3 JASPAR yes 39093886 4598 54245584
chr17 39089276 39089288 POU2F1 JASPAR yes 39093886 4598 54245585
chr17 39089317 39089332 IRF9 JASPAR yes 39093886 4554 54245586
chr17 39089318 39089332 IRF7 JASPAR yes 39093886 4554 54245587
chr17 39089320 39089336 SOX4 JASPAR yes 39093886 4550 54245588
chr17 39089339 39089353 FOXF2 JASPAR yes 39093886 4533 54245589
chr17 39089339 39089354 FOXP1 JASPAR yes 39093886 4532 54245590
chr17 39089340 39089351 FOXA1 JASPAR yes 39093886 4535 54245591
chr17 39089340 39089355 FOXA1 JASPAR yes 39093886 4531 54245592
chr17 39089341 39089352 FOXB1 JASPAR yes 39093886 4534 54245593
chr17 39089341 39089352 FOXC1 JASPAR yes 39093886 4534 54245594
chr17 39089341 39089353 FOXC2 JASPAR yes 39093886 4533 54245595
chr17 39089411 39089417 MZF1 JASPAR yes 39093886 4469 54245596
chr17 39089420 39089438 MAFF JASPAR yes 39093886 4448 54245597
chr17 39089422 39089433 NRL JASPAR yes 39093886 4453 54245598
chr17 39089422 39089437 MAFK JASPAR yes 39093886 4449 54245599
chr17 39089460 39089465 SP1 TRANSFAC yes 39093886 4421 54245600
chr17 39089462 39089476 TLX1 JASPAR yes 39093886 4410 54245601
chr17 39089488 39089509 IRF1 JASPAR yes 39093886 4377 54245602
chr17 39089498 39089512 SPIC JASPAR yes 39093886 4374 54245603
chr17 39089501 39089508 SPIB JASPAR yes 39093886 4378 54245604
chr17 39089530 39089542 INSM1 JASPAR yes 39093886 4344 54245605
chr17 39089545 39089555 MEF2A JASPAR yes 39093886 4331 54245606
chr17 39089546 39089550 TEAD2 TRANSFAC yes 39093886 4336 54245607
chr17 39089546 39089551 TBP TRANSFAC yes 39093886 4335 54245608
chr17 39089567 39089580 ELF3 JASPAR yes 39093886 4306 54245609
chr17 39089568 39089572 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4314 54245610
chr17 39089568 39089579 ELF5 JASPAR yes 39093886 4307 54245611
chr17 39089569 39089577 FEV JASPAR yes 39093886 4309 54245612
chr17 39089570 39089591 ZNF263 JASPAR yes 39093886 4295 54245613
chr17 39089571 39089576 ETS2 TRANSFAC yes 39093886 4310 54245614
chr17 39089578 39089599 REST JASPAR yes 39093886 4287 54245615
chr17 39089579 39089598 REST JASPAR yes 39093886 4288 54245616
chr17 39089599 39089619 PPARG JASPAR yes 39093886 4267 54245617
chr17 39089602 39089606 LFA1 TRANSFAC yes 39093886 4280 54245618
chr17 39089603 39089615 TEAD1 JASPAR yes 39093886 4271 54245619
chr17 39089613 39089617 H1TF2 TRANSFAC yes 39093886 4269 54245620
chr17 39089613 39089617 NFE TRANSFAC yes 39093886 4269 54245621
chr17 39089613 39089617 SRF TRANSFAC yes 39093886 4269 54245622
chr17 39089620 39089631 E2F6 JASPAR yes 39093886 4255 54245623
chr17 39089646 39089657 NFIL3 JASPAR yes 39093886 4229 54245624
chr17 39089647 39089651 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4235 54245625
chr17 39089647 39089659 DBP JASPAR yes 39093886 4227 54245626
chr17 39089647 39089659 HLF JASPAR yes 39093886 4227 54245627
chr17 39089647 39089659 TEF JASPAR yes 39093886 4227 54245628
chr17 39089649 39089660 NFIL3 JASPAR yes 39093886 4226 54245629
chr17 39089664 39089676 IRF1 JASPAR yes 39093886 4210 54245630
chr17 39089681 39089685 NFE TRANSFAC yes 39093886 4201 54245631
chr17 39089682 39089687 GATA2 JASPAR yes 39093886 4199 54245632
chr17 39089689 39089704 TFAP2A JASPAR yes 39093886 4182 54245633
chr17 39089691 39089706 TFAP2C JASPAR yes 39093886 4180 54245634
chr17 39089692 39089704 TFAP2A JASPAR yes 39093886 4182 54245635
chr17 39089693 39089702 TFAP2A JASPAR yes 39093886 4184 54245636
chr17 39089698 39089703 SP1 TRANSFAC yes 39093886 4183 54245637
chr17 39089713 39089716 MYB TRANSFAC yes 39093886 4170 54245638
chr17 39089719 39089726 NKX3-1 JASPAR yes 39093886 4160 54245639
chr17 39089745 39089749 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4137 54245640
chr17 39089762 39089772 TBX21 JASPAR yes 39093886 4114 54245641
chr17 39089762 39089773 TBX20 JASPAR yes 39093886 4113 54245642
chr17 39089762 39089773 TBX2 JASPAR yes 39093886 4113 54245643
chr17 39089762 39089775 EOMES JASPAR yes 39093886 4111 54245644
chr17 39089763 39089771 MGA JASPAR yes 39093886 4115 54245645
chr17 39089763 39089771 TBX15 JASPAR yes 39093886 4115 54245646
chr17 39089763 39089771 TBX1 JASPAR yes 39093886 4115 54245647
chr17 39089763 39089771 TBX4 JASPAR yes 39093886 4115 54245648
chr17 39089763 39089771 TBX5 JASPAR yes 39093886 4115 54245649
chr17 39089763 39089773 TBR1 JASPAR yes 39093886 4113 54245650
chr17 39089789 39089803 ONECUT2 JASPAR yes 39093886 4083 54245651
chr17 39089789 39089803 ONECUT3 JASPAR yes 39093886 4083 54245652
chr17 39089804 39089808 NFE TRANSFAC yes 39093886 4078 54245653
chr17 39089817 39089821 YY1 TRANSFAC yes 39093886 4065 54245654
chr17 39089848 39089853 GATA2 JASPAR yes 39093886 4033 54245655
chr17 39089851 39089866 HNF4G JASPAR yes 39093886 4020 54245656
chr17 39089852 39089866 NR2F1 JASPAR yes 39093886 4020 54245657
chr17 39089852 39089867 HNF4A JASPAR yes 39093886 4019 54245658
chr17 39089855 39089861 TCF4 TRANSFAC yes 39093886 4025 54245659
chr17 39089867 39089876 NKX2-8 JASPAR yes 39093886 4010 54245660
chr17 39089889 39089893 NFE TRANSFAC yes 39093886 3993 54245661
chr17 39089899 39089919 TBX19 JASPAR yes 39093886 3967 54245662
chr17 39089901 39089917 T JASPAR yes 39093886 3969 54245663
chr17 39089954 39089958 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3928 54245664
chr17 39089961 39089965 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3921 54245665
chr17 39089973 39089980 NKX3-1 JASPAR yes 39093886 3906 54245666
chr17 39089986 39090001 JUND JASPAR yes 39093886 3885 54245667
chr17 39089989 39090001 HLF JASPAR yes 39093886 3885 54245668
chr17 39089994 39089998 TEAD2 TRANSFAC yes 39093886 3888 54245669
chr17 39089996 39089999 MYB TRANSFAC yes 39093886 3887 54245670
chr17 39090003 39090007 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3879 54245671
chr17 39090028 39090037 NKX3-2 JASPAR yes 39093886 3849 54245672
chr17 39090032 39090038 ZNF354C JASPAR yes 39093886 3848 54245673
chr17 39090088 39090098 EMX1 JASPAR yes 39093886 3788 54245674
chr17 39090088 39090098 GSX2 JASPAR yes 39093886 3788 54245675
chr17 39090088 39090098 HOXB2 JASPAR yes 39093886 3788 54245676
chr17 39090088 39090098 MEOX2 JASPAR yes 39093886 3788 54245677
chr17 39090088 39090098 MNX1 JASPAR yes 39093886 3788 54245678
chr17 39090089 39090097 LMX1A JASPAR yes 39093886 3789 54245679
chr17 39090089 39090097 LMX1B JASPAR yes 39093886 3789 54245680
chr17 39090089 39090097 NKX6-1 JASPAR yes 39093886 3789 54245681
chr17 39090089 39090097 NKX6-2 JASPAR yes 39093886 3789 54245682
chr17 39090089 39090097 PDX1 JASPAR yes 39093886 3789 54245683
chr17 39090089 39090097 VAX1 JASPAR yes 39093886 3789 54245684
chr17 39090089 39090097 VAX2 JASPAR yes 39093886 3789 54245685
chr17 39090089 39090097 VSX1 JASPAR yes 39093886 3789 54245686
chr17 39090090 39090100 PAX3 JASPAR yes 39093886 3786 54245687
chr17 39090090 39090100 PAX7 JASPAR yes 39093886 3786 54245688
chr17 39090143 39090152 HIC2 JASPAR yes 39093886 3734 54245689
chr17 39090143 39090153 NFIA JASPAR yes 39093886 3733 54245690
chr17 39090145 39090151 NFIC JASPAR yes 39093886 3735 54245691
chr17 39090173 39090180 PEA3 TRANSFAC yes 39093886 3706 54245692
chr17 39090194 39090209 FOXP1 JASPAR yes 39093886 3677 54245693
chr17 39090195 39090202 SPIB JASPAR yes 39093886 3684 54245694
chr17 39090195 39090216 IRF1 JASPAR yes 39093886 3670 54245695
chr17 39090197 39090208 FOXP2 JASPAR yes 39093886 3678 54245696
chr17 39090198 39090206 FOXO3 JASPAR yes 39093886 3680 54245697
chr17 39090213 39090228 FOXP1 JASPAR yes 39093886 3658 54245698
chr17 39090214 39090225 FOXA1 JASPAR yes 39093886 3661 54245699
chr17 39090214 39090229 FOXA1 JASPAR yes 39093886 3657 54245700
chr17 39090215 39090227 FOXC2 JASPAR yes 39093886 3659 54245701
chr17 39090216 39090227 FOXP2 JASPAR yes 39093886 3659 54245702
chr17 39090217 39090225 FOXO3 JASPAR yes 39093886 3661 54245703
chr17 39090218 39090225 FOXD2 JASPAR yes 39093886 3661 54245704
chr17 39090218 39090225 FOXI1 JASPAR yes 39093886 3661 54245705
chr17 39090218 39090225 FOXL1 JASPAR yes 39093886 3661 54245706
chr17 39090218 39090225 FOXO4 JASPAR yes 39093886 3661 54245707
chr17 39090218 39090225 FOXO6 JASPAR yes 39093886 3661 54245708
chr17 39090218 39090225 FOXP3 JASPAR yes 39093886 3661 54245709
chr17 39090218 39090226 FOXD1 JASPAR yes 39093886 3660 54245710
chr17 39090218 39090226 FOXG1 JASPAR yes 39093886 3660 54245711
chr17 39090218 39090226 FOXO3 JASPAR yes 39093886 3660 54245712
chr17 39090218 39090227 SRY JASPAR yes 39093886 3659 54245713
chr17 39090226 39090244 SRF JASPAR yes 39093886 3642 54245714
chr17 39090227 39090237 NFIA JASPAR yes 39093886 3649 54245715
chr17 39090228 39090243 MEF2C JASPAR yes 39093886 3643 54245716
chr17 39090228 39090244 SRF JASPAR yes 39093886 3642 54245717
chr17 39090229 39090235 NFIC JASPAR yes 39093886 3651 54245718
chr17 39090229 39090244 MEF2A JASPAR yes 39093886 3642 54245719
chr17 39090230 39090242 MEF2B JASPAR yes 39093886 3644 54245720
chr17 39090230 39090242 MEF2D JASPAR yes 39093886 3644 54245721
chr17 39090231 39090241 MEF2A JASPAR yes 39093886 3645 54245722
chr17 39090250 39090262 PBX1 JASPAR yes 39093886 3624 54245723
chr17 39090264 39090279 MEF2A JASPAR yes 39093886 3607 54245724
chr17 39090265 39090280 MEF2C JASPAR yes 39093886 3606 54245725
chr17 39090266 39090280 FOXF2 JASPAR yes 39093886 3606 54245726
chr17 39090268 39090272 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3614 54245727
chr17 39090268 39090278 HOXC10 JASPAR yes 39093886 3608 54245728
chr17 39090268 39090278 HOXD11 JASPAR yes 39093886 3608 54245729
chr17 39090294 39090298 H1TF2 TRANSFAC yes 39093886 3588 54245730
chr17 39090294 39090298 NFE TRANSFAC yes 39093886 3588 54245731
chr17 39090294 39090298 SRF TRANSFAC yes 39093886 3588 54245732
chr17 39090303 39090308 H4TF1 TRANSFAC yes 39093886 3578 54245733
chr17 39090315 39090320 MYB TRANSFAC yes 39093886 3566 54245734
chr17 39090317 39090333 POU4F3 JASPAR yes 39093886 3553 54245735
chr17 39090318 39090328 PAX3 JASPAR yes 39093886 3558 54245736
chr17 39090319 39090333 POU4F1 JASPAR yes 39093886 3553 54245737
chr17 39090319 39090334 HNF1A JASPAR yes 39093886 3552 54245738
chr17 39090320 39090333 HNF1B JASPAR yes 39093886 3553 54245739
chr17 39090334 39090351 RXRA JASPAR yes 39093886 3535 54245740
chr17 39090346 39090359 SCRT2 JASPAR yes 39093886 3527 54245741
chr17 39090361 39090365 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3521 54245742
chr17 39090394 39090405 DMRT3 JASPAR yes 39093886 3481 54245743
chr17 39090398 39090403 GATA2 JASPAR yes 39093886 3483 54245744
chr17 39090399 39090405 ZNF354C JASPAR yes 39093886 3481 54245745
chr17 39090410 39090431 REST JASPAR yes 39093886 3455 54245746
chr17 39090411 39090415 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3471 54245747
chr17 39090422 39090426 H4TF2 TRANSFAC yes 39093886 3460 54245748
chr17 39090425 39090432 ETS1 TRANSFAC yes 39093886 3454 54245749
chr17 39090426 39090434 EHF JASPAR yes 39093886 3452 54245750
chr17 39090432 39090437 GATA2 JASPAR yes 39093886 3449 54245751
chr17 39090444 39090454 EN2 JASPAR yes 39093886 3432 54245752
chr17 39090468 39090483 FOXP1 JASPAR yes 39093886 3403 54245753
chr17 39090469 39090480 FOXP2 JASPAR yes 39093886 3406 54245754
chr17 39090471 39090482 FOXA1 JASPAR yes 39093886 3404 54245755
chr17 39090490 39090511 ZNF263 JASPAR yes 39093886 3375 54245756
chr17 39090505 39090511 GATA3 JASPAR yes 39093886 3375 54245757
chr17 39090539 39090548 NKX2-8 JASPAR yes 39093886 3338 54245758
chr17 39090546 39090561 FOXP1 JASPAR yes 39093886 3325 54245759
chr17 39090547 39090558 FOXA1 JASPAR yes 39093886 3328 54245760
chr17 39090549 39090560 FOXP2 JASPAR yes 39093886 3326 54245761
chr17 39090553 39090559 HiNF-A TRANSFAC yes 39093886 3327 54245762
chr17 39090556 39090571 SOX21 JASPAR yes 39093886 3315 54245763
chr17 39090570 39090583 HSF2 JASPAR yes 39093886 3303 54245764
chr17 39090582 39090597 PRDM1 JASPAR yes 39093886 3289 54245765
chr17 39090589 39090601 IRF1 JASPAR yes 39093886 3285 54245766
chr17 39090589 39090603 TCF7L2 JASPAR yes 39093886 3283 54245767
chr17 39090593 39090599 TCF1 TRANSFAC yes 39093886 3287 54245768
chr17 39090593 39090600 TCF4 TRANSFAC yes 39093886 3286 54245769
chr17 39090595 39090607 IRF1 JASPAR yes 39093886 3279 54245770
chr17 39090636 39090646 RORA JASPAR yes 39093886 3240 54245771
chr17 39090640 39090657 RARA JASPAR yes 39093886 3229 54245772
chr17 39090640 39090657 RXRA JASPAR yes 39093886 3229 54245773
chr17 39090641 39090645 ESR1 TRANSFAC yes 39093886 3241 54245774
chr17 39090653 39090658 SP1 TRANSFAC yes 39093886 3228 54245775
chr17 39090656 39090660 LFA1 TRANSFAC yes 39093886 3226 54245776
chr17 39090667 39090673 MZF1 JASPAR yes 39093886 3213 54245777
chr17 39090673 39090683 ZNF740 JASPAR yes 39093886 3203 54245778
chr17 39090673 39090688 ZIC3 JASPAR yes 39093886 3198 54245779
chr17 39090728 39090741 DUXA JASPAR yes 39093886 3145 54245780
chr17 39090729 39090740 DUX4 JASPAR yes 39093886 3146 54245781
chr17 39090732 39090752 PPARG JASPAR yes 39093886 3134 54245782
chr17 39090742 39090756 GATA2 JASPAR yes 39093886 3130 54245783
chr17 39090746 39090754 GATA3 JASPAR yes 39093886 3132 54245784
chr17 39090746 39090754 GATA5 JASPAR yes 39093886 3132 54245785
chr17 39090765 39090777 FOXI1 JASPAR yes 39093886 3109 54245786
chr17 39090785 39090790 MYC TRANSFAC yes 39093886 3096 54245787
chr17 39090792 39090802 GSC2 JASPAR yes 39093886 3084 54245788
chr17 39090793 39090801 OTX1 JASPAR yes 39093886 3085 54245789
chr17 39090793 39090801 OTX2 JASPAR yes 39093886 3085 54245790
chr17 39090797 39090812 JUND JASPAR yes 39093886 3074 54245791
chr17 39090815 39090832 ZNF410 JASPAR yes 39093886 3054 54245792
chr17 39090815 39090835 RREB1 JASPAR yes 39093886 3051 54245793
chr17 39090824 39090839 RUNX2 JASPAR yes 39093886 3047 54245794
chr17 39090827 39090838 RUNX1 JASPAR yes 39093886 3048 54245795
chr17 39090828 39090838 RUNX3 JASPAR yes 39093886 3048 54245796
chr17 39090831 39090847 POU4F2 JASPAR yes 39093886 3039 54245797
chr17 39090831 39090847 POU4F3 JASPAR yes 39093886 3039 54245798
chr17 39090834 39090849 JUND JASPAR yes 39093886 3037 54245799
chr17 39090835 39090848 JUN JASPAR yes 39093886 3038 54245800
chr17 39090836 39090849 ATF4 JASPAR yes 39093886 3037 54245801
chr17 39090837 39090848 CEBPA JASPAR yes 39093886 3038 54245802
chr17 39090838 39090849 CEBPB JASPAR yes 39093886 3037 54245803
chr17 39090848 39090852 TEAD2 TRANSFAC yes 39093886 3034 54245804
chr17 39090855 39090859 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3027 54245805
chr17 39090870 39090888 IRF2 JASPAR yes 39093886 2998 54245806
chr17 39090875 39090887 IRF1 JASPAR yes 39093886 2999 54245807
chr17 39090880 39090884 YY1 TRANSFAC yes 39093886 3002 54245808
chr17 39090893 39090898 SP1 TRANSFAC yes 39093886 2988 54245809
chr17 39090923 39090933 HOXC10 JASPAR yes 39093886 2953 54245810
chr17 39090923 39090934 HOXC13 JASPAR yes 39093886 2952 54245811
chr17 39090938 39090946 FOXO3 JASPAR yes 39093886 2940 54245812
chr17 39090960 39090968 TBX15 JASPAR yes 39093886 2918 54245813
chr17 39090980 39090986 YY1 JASPAR yes 39093886 2900 54245814
chr17 39090990 39090996 YY1 JASPAR yes 39093886 2890 54245815
chr17 39090992 39091013 IRF1 JASPAR yes 39093886 2873 54245816
chr17 39090994 39091009 PRDM1 JASPAR yes 39093886 2877 54245817
chr17 39090996 39091000 YY1 TRANSFAC yes 39093886 2886 54245818
chr17 39090996 39091010 IRF7 JASPAR yes 39093886 2876 54245819
chr17 39091005 39091015 NFATC3 JASPAR yes 39093886 2871 54245820
chr17 39091006 39091013 NFATC2 JASPAR yes 39093886 2873 54245821
chr17 39091012 39091026 STAT1 JASPAR yes 39093886 2860 54245822
chr17 39091012 39091027 STAT2 JASPAR yes 39093886 2859 54245823
chr17 39091019 39091023 YY1 TRANSFAC yes 39093886 2863 54245824
chr17 39091020 39091028 FEV JASPAR yes 39093886 2858 54245825
chr17 39091022 39091027 ETS2 TRANSFAC yes 39093886 2859 54245826
chr17 39091046 39091056 HOXB13 JASPAR yes 39093886 2830 54245827
chr17 39091062 39091078 SOX4 JASPAR yes 39093886 2808 54245828
chr17 39091064 39091077 POU3F3 JASPAR yes 39093886 2809 54245829
chr17 39091065 39091069 YY1 TRANSFAC yes 39093886 2817 54245830
chr17 39091091 39091096 GATA2 JASPAR yes 39093886 2790 54245831
chr17 39091100 39091112 PKNOX1 JASPAR yes 39093886 2774 54245832
chr17 39091100 39091112 PKNOX2 JASPAR yes 39093886 2774 54245833
chr17 39091100 39091112 TGIF1 JASPAR yes 39093886 2774 54245834
chr17 39091101 39091111 CLOCK JASPAR yes 39093886 2775 54245835
chr17 39091102 39091112 MAX JASPAR yes 39093886 2774 54245836
chr17 39091888 39092178 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Liver (HepG2) 39093886 1708 108258011
chr17 39091903 39092183 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Liver (HepG2) 39093886 1703 108258012
chr17 39091925 39092994 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 39093886 892 108258013
chr17 39091937 39092296 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 1590 108258014
chr17 39091943 39092296 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 39093886 1590 108258015
chr17 39091960 39091963 MYB TRANSFAC yes 39093886 1923 21237438
chr17 39091973 39092884 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 1002 108258016
chr17 39091978 39091983 GATA2 JASPAR yes 39093886 1903 21237439
chr17 39091978 39092911 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 975 108258017
chr17 39091980 39092388 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 39093886 1498 108258018
chr17 39091981 39091984 MYB TRANSFAC yes 39093886 1902 21237440
chr17 39091981 39091992 RUNX1 JASPAR yes 39093886 1894 21237441
chr17 39091982 39092388 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 39093886 1498 108258019
chr17 39091986 39092388 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 39093886 1498 108258020
chr17 39091992 39092884 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 1002 108258021
chr17 39092016 39092029 JUN JASPAR yes 39093886 1857 21237442
chr17 39092017 39092028 RUNX1 JASPAR yes 39093886 1858 21237443
chr17 39092021 39092942 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 39093886 944 108258022
chr17 39092023 39092033 HOXA2 JASPAR yes 39093886 1853 21237444
chr17 39092024 39092038 SPIC JASPAR yes 39093886 1848 21237445
chr17 39092030 39092044 FOXF2 JASPAR yes 39093886 1842 21237446
chr17 39092030 39092045 FOXP1 JASPAR yes 39093886 1841 21237447
chr17 39092031 39092042 FOXA1 JASPAR yes 39093886 1844 21237448
chr17 39092031 39092046 FOXA1 JASPAR yes 39093886 1840 21237449
chr17 39092032 39092043 FOXB1 JASPAR yes 39093886 1843 21237450
chr17 39092032 39092043 FOXC1 JASPAR yes 39093886 1843 21237451
chr17 39092032 39092044 FOXC2 JASPAR yes 39093886 1842 21237452
chr17 39092033 39092044 FOXP2 JASPAR yes 39093886 1842 21237453
chr17 39092035 39092042 FOXD2 JASPAR yes 39093886 1844 21237454
chr17 39092035 39092042 FOXI1 JASPAR yes 39093886 1844 21237455
chr17 39092035 39092042 FOXL1 JASPAR yes 39093886 1844 21237456
chr17 39092035 39092042 FOXO4 JASPAR yes 39093886 1844 21237457
chr17 39092035 39092042 FOXO6 JASPAR yes 39093886 1844 21237458
chr17 39092035 39092042 FOXP3 JASPAR yes 39093886 1844 21237459
chr17 39092035 39092043 FOXD1 JASPAR yes 39093886 1843 21237460
chr17 39092035 39092043 FOXG1 JASPAR yes 39093886 1843 21237461
chr17 39092035 39092043 FOXO3 JASPAR yes 39093886 1843 21237462
chr17 39092036 39092798 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 39093886 1088 108258023
chr17 39092038 39092268 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 39093886 1618 108258024
chr17 39092038 39092361 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 39093886 1525 108258025
chr17 39092043 39092049 MYC TRANSFAC yes 39093886 1837 21237463
chr17 39092073 39092699 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 39093886 1187 108258026
chr17 39092086 39092094 GATA5 JASPAR yes 39093886 1792 21237464
chr17 39092087 39092699 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 39093886 1187 108258027
chr17 39092087 39092766 CTCF GTRD no Spleen 39093886 1120 108258028
chr17 39092092 39092096 YY1 TRANSFAC yes 39093886 1790 21237465
chr17 39092100 39092763 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 1123 108258029
chr17 39092101 39093307 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 579 108258030
chr17 39092109 39092115 ESR1 TRANSFAC yes 39093886 1771 21237466
chr17 39092111 39092115 ESR1 TRANSFAC yes 39093886 1771 21237467
chr17 39092118 39092802 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 1084 108258031
chr17 39092118 39092805 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 39093886 1081 108258032
chr17 39092119 39093169 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 717 108258033
chr17 39092123 39092127 YY1 TRANSFAC yes 39093886 1759 21237468
chr17 39092130 39092142 NHLH1 JASPAR yes 39093886 1744 21237469
chr17 39092131 39092141 MSC JASPAR yes 39093886 1745 21237470
chr17 39092131 39092141 NHLH1 JASPAR yes 39093886 1745 21237471
chr17 39092131 39092141 TFAP4 JASPAR yes 39093886 1745 21237472
chr17 39092131 39092143 TAL1 JASPAR yes 39093886 1743 21237473
chr17 39092133 39092740 CTCF GTRD no Lung 39093886 1146 108258034
chr17 39092139 39092996 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 890 108258035
chr17 39092144 39092960 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 39093886 926 108258036
chr17 39092146 39092802 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 39093886 1084 108258037
chr17 39092148 39092152 YY1 TRANSFAC yes 39093886 1734 21237474
chr17 39092157 39092172 RUNX2 JASPAR yes 39093886 1714 21237475
chr17 39092161 39092801 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 39093886 1085 108258038
chr17 39092170 39092648 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 39093886 1238 108258039
chr17 39092170 39092663 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 39093886 1223 108258040
chr17 39092183 39092799 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 39093886 1087 108258041
SNPs associated with KRT23[ENSG00000108244.12], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr17 39822667 rs8071016 C T 728781 Esophagus 0.288824 4874339
chr17 38769691 rs138748230 A C 309257 Heart 0.326946 4868850
chr17 39940502 rs59527388 C G 846616 Breast 0.43881 4875263
chr17 39088597 rs12600439 A G 0 Spleen 1.69699e-08 4870494
chr17 38300671 rs111327046 C T 778277 Ovary 0.12511 4865371
chr17 38500946 rs112509970 C T 578002 Uterus 0.252349 4866378
chr17 39790113 rs73297904 G A 696227 Liver 0.400917 4873964
chr17 39092063 rs2315604 T C 0 Lung 1.02118e-10 4870536
chr17 39092735 rs34861030 C A 0 Stomach 0.00741752 4870541
chr17 38618104 rs7214466 T C,G 460844 Adrenal 0.174442 4867102
Details of KRT23[ENSG00000108244.12]
Back to top
Genomic Location chr17:39078948-39093886[-]
TSS 39093886
Gene Name KRT23
Ensembl ID ENSG00000108244.12
ENTREZID 25984
Uniprot
Q8TC04
A0A024R1X9
Q9C075
Protein Name
type I cytoskeletal 23
Keratin
Keratin 23
Expression levels of KRT23[ENSG00000108244.12]
Back to top