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Enhancers that regulate PNRC1[ENSG00000146278.10]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Kidney Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-MC) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Lung Stomach Muscle (A673) Placenta Muscle (Myoblast) Pancreas Muscle (Myotube) Uterus Thymus Heart
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Cervix (HeLa-S3) Esophagus Liver Placenta Pancreas Breast Stomach
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Pancreas
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VISTA
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VISTA
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Peripheral Blood (MM.1S) Large Intestine
Transcript facotrs that regulate PNRC1[ENSG00000146278.10]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr6 89793622 89793633 FOXP2 JASPAR yes 89790470 3152 103394793
chr6 89793623 89793631 FOXO3 JASPAR yes 89790470 3153 103394794
chr6 89793635 89793641 NFIC JASPAR yes 89790470 3165 103394795
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chr6 89793687 89793699 MEF2D JASPAR yes 89790470 3217 103394800
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chr6 89793921 89793926 H4TF1 TRANSFAC yes 89790470 3451 103394830
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chr6 89794317 89794327 HMBOX1 JASPAR yes 89790470 3847 103394891
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chr6 89794957 89794968 FOSL2 JASPAR yes 89790470 4487 103394946
chr6 89794957 89794968 JUNB JASPAR yes 89790470 4487 103394947
chr6 89794957 89794971 JUN JASPAR yes 89790470 4487 103394948
chr6 89794968 89794973 ETS2 TRANSFAC yes 89790470 4498 103394949
chr6 89794970 89794978 EHF JASPAR yes 89790470 4500 103394950
chr6 89794972 89794977 ETS2 TRANSFAC yes 89790470 4502 103394951
chr6 89794972 89794988 POU4F2 JASPAR yes 89790470 4502 103394952
chr6 89794993 89795001 EHF JASPAR yes 89790470 4523 103394953
chr6 89795011 89795016 ETS2 TRANSFAC yes 89790470 4541 103394954
chr6 89795019 89795023 YY1 TRANSFAC yes 89790470 4549 103394955
chr6 89795047 89795051 H1TF2 TRANSFAC yes 89790470 4577 103394956
chr6 89795047 89795051 NFE TRANSFAC yes 89790470 4577 103394957
chr6 89795047 89795051 SRF TRANSFAC yes 89790470 4577 103394958
chr6 89795047 89795059 MEF2B JASPAR yes 89790470 4577 103394959
chr6 89795061 89795065 H1TF2 TRANSFAC yes 89790470 4591 103394960
chr6 89795061 89795065 NFE TRANSFAC yes 89790470 4591 103394961
chr6 89795061 89795065 SRF TRANSFAC yes 89790470 4591 103394962
chr6 89795064 89795078 IRF7 JASPAR yes 89790470 4594 103394963
chr6 89795064 89795079 IRF9 JASPAR yes 89790470 4594 103394964
chr6 89795072 89795078 TCF4 TRANSFAC yes 89790470 4602 103394965
chr6 89795087 89795097 HOXD11 JASPAR yes 89790470 4617 103394966
chr6 89795102 89795112 EMX1 JASPAR yes 89790470 4632 103394967
chr6 89795102 89795112 HOXB3 JASPAR yes 89790470 4632 103394968
chr6 89795127 89795139 TGIF1 JASPAR yes 89790470 4657 103394969
chr6 89795169 89795173 YY1 TRANSFAC yes 89790470 4699 103394970
chr6 89795169 89795184 SCRT1 JASPAR yes 89790470 4699 103394971
chr6 89795171 89795183 GRHL1 JASPAR yes 89790470 4701 103394972
chr6 89795172 89795175 MYB TRANSFAC yes 89790470 4702 103394973
chr6 89795173 89795183 MSC JASPAR yes 89790470 4703 103394974
chr6 89795179 89795189 HOXD11 JASPAR yes 89790470 4709 103394975
chr6 89795182 89795185 MYB TRANSFAC yes 89790470 4712 103394976
chr6 89795190 89795194 YY1 TRANSFAC yes 89790470 4720 103394977
chr6 89795195 89795205 MAX JASPAR yes 89790470 4725 103394978
chr6 89795203 89795214 HOXA10 JASPAR yes 89790470 4733 103394979
chr6 89795203 89795214 HOXC12 JASPAR yes 89790470 4733 103394980
chr6 89795204 89795214 HOXD11 JASPAR yes 89790470 4734 103394981
chr6 89795204 89795214 HOXD13 JASPAR yes 89790470 4734 103394982
chr6 89795206 89795210 TEAD2 TRANSFAC yes 89790470 4736 103394983
chr6 89795206 89795211 TBP TRANSFAC yes 89790470 4736 103394984
chr6 89795206 89795212 TFIID TRANSFAC yes 89790470 4736 103394985
chr6 89795230 89795234 TEAD2 TRANSFAC yes 89790470 4760 103394986
chr6 89795260 89795265 ETS2 TRANSFAC yes 89790470 4790 103394987
chr6 89795272 89795276 YY1 TRANSFAC yes 89790470 4802 103394988
chr6 89795289 89795293 YY1 TRANSFAC yes 89790470 4819 103394989
chr6 89795315 89795325 TBX21 JASPAR yes 89790470 4845 103394990
chr6 89795315 89795326 TBX20 JASPAR yes 89790470 4845 103394991
chr6 89795335 89795338 MYB TRANSFAC yes 89790470 4865 103394992
chr6 89795335 89795347 BHLHE23 JASPAR yes 89790470 4865 103394993
chr6 89795336 89795346 BHLHE22 JASPAR yes 89790470 4866 103394994
chr6 89795336 89795346 OLIG1 JASPAR yes 89790470 4866 103394995
chr6 89795336 89795346 OLIG2 JASPAR yes 89790470 4866 103394996
chr6 89795336 89795346 OLIG3 JASPAR yes 89790470 4866 103394997
chr6 89795346 89795354 FEV JASPAR yes 89790470 4876 103394998
chr6 89795358 89795363 GATA2 JASPAR yes 89790470 4888 103394999
chr6 89795370 89795384 RXRG JASPAR yes 89790470 4900 103395000
chr6 89795382 89795393 TBX20 JASPAR yes 89790470 4912 103395001
chr6 89795383 89795391 TBX15 JASPAR yes 89790470 4913 103395002
chr6 89795384 89795389 SP1 TRANSFAC yes 89790470 4914 103395003
chr6 89795385 89795395 SP1 JASPAR yes 89790470 4915 103395004
chr6 89795388 89795398 MZF1 JASPAR yes 89790470 4918 103395005
chr6 89795391 89795396 TFAP2A TRANSFAC yes 89790470 4921 103395006
chr6 89795391 89795397 MZF1 JASPAR yes 89790470 4921 103395007
chr6 89795400 89795415 MEF2C JASPAR yes 89790470 4930 103395008
chr6 89795401 89795413 FOXI1 JASPAR yes 89790470 4931 103395009
chr6 89795401 89795416 MEF2A JASPAR yes 89790470 4931 103395010
chr6 89795408 89795412 TEAD2 TRANSFAC yes 89790470 4938 103395011
chr6 89795409 89795424 MEF2C JASPAR yes 89790470 4939 103395012
chr6 89795410 89795413 MYB TRANSFAC yes 89790470 4940 103395013
chr6 89795431 89795437 MZF1 JASPAR yes 89790470 4961 103395014
chr6 89795446 89795456 NEUROG2 JASPAR yes 89790470 4976 103395015
chr6 89795460 89795478 RARA JASPAR yes 89790470 4990 103395016
SNPs associated with PNRC1[ENSG00000146278.10], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 89075280 rs113751782 T G 715190 Esophagus 0.12608 9178949
chr6 89314909 rs76829931 A G 475561 Heart 0.153647 9179795
chr6 89948034 rs282137 G A 153155 Breast 0.305547 9182567
chr6 89769158 rs9451129 A G 21312 Spleen 0.0197358 9182169
Details of PNRC1[ENSG00000146278.10]
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Genomic Location chr6:89790470-89794879[+]
TSS 89790470
Gene Name PNRC1
Ensembl ID ENSG00000146278.10
ENTREZID 10957
Uniprot
Q12796
Protein Name
PNRC1 protein
Proline-rich nuclear receptor coactivator 1
Expression levels of PNRC1[ENSG00000146278.10]
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