EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. SV2A[ENSG00000159164.5]
Enhancers that regulate SV2A[ENSG00000159164.5]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr1 149816287 149817606 vista3237 149889434 71828
VISTA
chr1 149820361 149820952 vista3238 149889434 68482
VISTA
chr1 149821015 149821647 vista3239 149889434 67787
VISTA
chr1 149849205 149853375 enh47235 149889434 36059
Thymus Blood (T-cell)
chr1 149853331 149853687 vista3240 149889434 35747
VISTA
chr1 149888481 149888615 vista3241 149889434 819
VISTA
chr1 149910900 149911536 vista3242 149889434 21466
VISTA
chr1 149931955 149932255 vista3243 149889434 42521
VISTA
chr1 149948585 149954315 enh27131 149889434 59151
Astrocyte Large Intestine
chr1 149956365 149962355 enh27132 149889434 66931
Brain (SK-N-MC) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Stomach Thyroid Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Uterus Kidney
chr1 149957680 149957694 vista3244 149889434 68246
VISTA
chr1 149965165 149976375 enh27133 149889434 75731
Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Blood (GM12878) Thyroid Peripheral Blood (MM.1S) Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Uterus
chr1 149976685 149981375 enh12241 149889434 87251
Prostate (PC-3) Placenta Uterus
chr1 149978692 149979077 vista3245 149889434 89258
VISTA
chr1 149981648 149981889 vista3246 149889434 92214
VISTA
chr1 149984633 149984917 vista3247 149889434 95199
VISTA
chr1 149985905 149996955 enh49975 149889434 96471
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Stomach Colon (HCT116) Lung (PC-9) Pancreas Neural Stem Cells (H9) Epithelial (MCF-7)
Transcript facotrs that regulate SV2A[ENSG00000159164.5]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr1 149881737 149889865 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 431 107827368
chr1 149883101 149889037 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 397 107827369
chr1 149883199 149889492 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 58 107827370
chr1 149883309 149889460 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 26 107827371
chr1 149883436 149890351 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 917 107827372
chr1 149883441 149889503 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 69 107827373
chr1 149883497 149889187 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 247 107827374
chr1 149883577 149889417 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 17 107827375
chr1 149883608 149889448 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 14 107827376
chr1 149883852 149889535 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 101 107827377
chr1 149883870 149889355 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 79 107827378
chr1 149883908 149889547 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 113 107827379
chr1 149883953 149890089 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 655 107827380
chr1 149884013 149889525 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 91 107827381
chr1 149884118 149889606 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 172 107827382
chr1 149884206 149889450 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 16 107827383
chr1 149884294 149889401 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 33 107827384
chr1 149884316 149889421 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 13 107827385
chr1 149884354 149889137 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 297 107827386
chr1 149884366 149889308 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 126 107827387
chr1 149884373 149889228 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 206 107827388
chr1 149884379 149889279 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 155 107827389
chr1 149884388 149889477 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 43 107827390
chr1 149884390 149889237 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 197 107827391
chr1 149884390 149889311 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 123 107827392
chr1 149884393 149889206 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 228 107827393
chr1 149884401 149889338 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 96 107827394
chr1 149884410 149889354 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 80 107827395
chr1 149884430 149889334 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 100 107827396
chr1 149884432 149889727 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 293 107827397
chr1 149884435 149889809 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 375 107827398
chr1 149884441 149889293 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 141 107827399
chr1 149884443 149889508 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 74 107827400
chr1 149884445 149889381 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 53 107827401
chr1 149884446 149889119 STAT3 GTRD no Blood (OCI-LY7) 149889434 315 107827402
chr1 149884451 149889407 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 27 107827403
chr1 149884476 149889480 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 46 107827404
chr1 149884478 149889301 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 133 107827405
chr1 149884478 149889866 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 432 107827406
chr1 149884483 149889371 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 63 107827407
chr1 149884494 149889035 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 399 107827408
chr1 149884495 149889281 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 153 107827409
chr1 149884495 149889332 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 102 107827410
chr1 149884496 149889370 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 64 107827411
chr1 149884502 149889285 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 149 107827412
chr1 149884505 149889341 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 93 107827413
chr1 149884506 149889063 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 371 107827414
chr1 149884519 149889034 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 400 107827415
chr1 149884524 149889090 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 344 107827416
chr1 149884528 149889072 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 362 107827417
chr1 149884530 149889288 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 146 107827418
chr1 149884532 149889278 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 156 107827419
chr1 149884532 149889361 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 73 107827420
chr1 149884534 149889152 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 282 107827421
chr1 149884540 149889533 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 99 107827422
chr1 149884545 149889295 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 139 107827423
chr1 149884550 149889071 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 363 107827424
chr1 149884550 149889124 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 310 107827425
chr1 149884554 149889485 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 51 107827426
chr1 149884558 149889504 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 70 107827427
chr1 149884565 149889222 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 212 107827428
chr1 149884569 149888882 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 552 107827429
chr1 149884572 149889173 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 261 107827430
chr1 149884584 149889000 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 434 107827431
chr1 149884586 149889475 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 41 107827432
chr1 149884589 149889404 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 30 107827433
chr1 149884595 149889240 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 194 107827434
chr1 149884599 149888801 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 633 107827435
chr1 149884610 149889323 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 111 107827436
chr1 149884612 149889168 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 266 107827437
chr1 149884614 149889148 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 286 107827438
chr1 149884615 149889018 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 416 107827439
chr1 149884643 149889844 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 410 107827440
chr1 149884677 149889323 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 111 107827441
chr1 149884683 149888911 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 523 107827442
chr1 149884683 149888995 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 439 107827443
chr1 149884696 149889491 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 57 107827444
chr1 149884776 149889345 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 89 107827445
chr1 149884783 149889076 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 358 107827446
chr1 149884798 149888710 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 724 107827447
chr1 149884805 149889351 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 83 107827448
chr1 149884806 149888836 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 598 107827449
chr1 149884837 149889296 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 138 107827450
chr1 149884849 149889060 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 374 107827451
chr1 149884850 149888889 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 545 107827452
chr1 149884860 149888736 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 698 107827453
chr1 149884865 149889781 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 347 107827454
chr1 149884913 149889387 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 47 107827455
chr1 149884942 149889085 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 349 107827456
chr1 149884945 149889265 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 169 107827457
chr1 149884948 149888952 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 482 107827458
chr1 149884949 149889386 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 48 107827459
chr1 149884999 149889188 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 246 107827460
chr1 149885009 149888802 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 632 107827461
chr1 149885012 149889179 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 255 107827462
chr1 149885024 149888837 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 597 107827463
chr1 149885024 149889220 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 214 107827464
chr1 149885033 149889112 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 322 107827465
chr1 149885040 149889295 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 139 107827466
chr1 149885093 149889352 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 82 107827467
chr1 149885094 149889318 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 116 107827468
chr1 149885096 149889327 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 107 107827469
chr1 149885120 149888874 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 560 107827470
chr1 149885122 149889211 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 223 107827471
chr1 149885156 149889491 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 57 107827472
chr1 149885161 149889107 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 327 107827473
chr1 149885162 149889171 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 263 107827474
chr1 149885187 149888972 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 462 107827475
chr1 149885206 149889555 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 121 107827476
chr1 149885228 149888660 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 774 107827477
chr1 149885228 149889233 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 201 107827478
chr1 149885249 149888992 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 442 107827479
chr1 149885302 149889131 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 303 107827480
chr1 149885335 149889006 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 428 107827481
chr1 149885372 149888948 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 486 107827482
chr1 149885407 149889006 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 428 107827483
chr1 149885429 149888971 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 463 107827484
chr1 149885475 149889378 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 56 107827485
chr1 149885526 149888834 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 600 107827486
chr1 149885534 149889197 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 237 107827487
chr1 149885578 149888788 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 646 107827488
chr1 149885585 149888834 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 600 107827489
chr1 149885804 149888990 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 444 107827490
chr1 149886148 149890574 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 1140 107827491
chr1 149886153 149888698 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 736 107827492
chr1 149886169 149888901 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 533 107827493
chr1 149886183 149888976 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 458 107827494
chr1 149886193 149889192 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 242 107827495
chr1 149886233 149889334 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 100 107827496
chr1 149886240 149889138 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 296 107827497
chr1 149886241 149889229 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 205 107827498
chr1 149886243 149889055 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 379 107827499
chr1 149886247 149888844 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 590 107827500
chr1 149886253 149888853 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 581 107827501
chr1 149886259 149889127 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 307 107827502
chr1 149886260 149889143 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 291 107827503
chr1 149886260 149889307 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 127 107827504
chr1 149886287 149888938 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 496 107827505
chr1 149886296 149889348 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 86 107827506
chr1 149886302 149889139 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 295 107827507
chr1 149886302 149889218 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 216 107827508
chr1 149886308 149889151 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 283 107827509
chr1 149886311 149888864 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 570 107827510
chr1 149886312 149888927 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 507 107827511
chr1 149886314 149889025 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 409 107827512
chr1 149886317 149889038 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 396 107827513
chr1 149886331 149889178 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 256 107827514
chr1 149886347 149888942 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 492 107827515
chr1 149886370 149888821 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 613 107827516
chr1 149886370 149889233 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 201 107827517
chr1 149886371 149889001 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 433 107827518
chr1 149886371 149889264 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 170 107827519
chr1 149886373 149889489 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 55 107827520
chr1 149886374 149888830 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 604 107827521
chr1 149886377 149889178 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 256 107827522
chr1 149886378 149888849 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 585 107827523
chr1 149886380 149888881 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 553 107827524
chr1 149886381 149889420 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 14 107827525
chr1 149886385 149889448 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 14 107827526
chr1 149886385 149889514 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 80 107827527
chr1 149886388 149889206 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 228 107827528
chr1 149886394 149888857 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 577 107827529
chr1 149886398 149889393 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 41 107827530
chr1 149886403 149888797 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 637 107827531
chr1 149886405 149888898 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 536 107827532
chr1 149886411 149889473 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 39 107827533
chr1 149886414 149888875 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 559 107827534
chr1 149886414 149888894 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 540 107827535
chr1 149886436 149888795 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 639 107827536
chr1 149886437 149888763 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 671 107827537
chr1 149886480 149889250 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 184 107827538
chr1 149886481 149888806 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 628 107827539
chr1 149886486 149888992 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 442 107827540
chr1 149886496 149888797 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 637 107827541
chr1 149886518 149889361 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 73 107827542
chr1 149886873 149889869 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 435 107827543
chr1 149887108 149889454 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 20 107827544
chr1 149887210 149889187 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 247 107827545
chr1 149887215 149888842 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 592 107827546
chr1 149887222 149888783 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 651 107827547
chr1 149887228 149888713 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 721 107827548
chr1 149887228 149889366 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 68 107827549
chr1 149887234 149889404 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 30 107827550
chr1 149887236 149889069 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 365 107827551
chr1 149887240 149889323 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 111 107827552
chr1 149887248 149889348 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 86 107827553
chr1 149887261 149889276 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 158 107827554
chr1 149887269 149888667 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 767 107827555
chr1 149887335 149888727 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 707 107827556
chr1 149887348 149889241 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 193 107827557
chr1 149887375 149888987 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 447 107827558
chr1 149887381 149888981 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 453 107827559
chr1 149887393 149889194 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 240 107827560
chr1 149887394 149889123 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 311 107827561
chr1 149887396 149888887 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 547 107827562
chr1 149887397 149888827 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 607 107827563
chr1 149887413 149888827 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 607 107827564
chr1 149887418 149889462 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 28 107827565
chr1 149887421 149888943 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 491 107827566
chr1 149887424 149888816 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 149889434 618 107827567
chr1 149887443 149889010 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 424 107827568
chr1 149887452 149888769 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 665 107827569
chr1 149887487 149888885 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 549 107827570
chr1 149887492 149889404 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 30 107827571
chr1 149887547 149888935 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 499 107827572
chr1 149887619 149889184 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 250 107827573
chr1 149887621 149889110 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 324 107827574
chr1 149887637 149888971 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 463 107827575
chr1 149887682 149888695 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 739 107827576
chr1 149887695 149888770 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 664 107827577
chr1 149887734 149888994 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 440 107827578
chr1 149887737 149888705 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 729 107827579
chr1 149887773 149888859 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 575 107827580
chr1 149887782 149888982 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 452 107827581
chr1 149887784 149888757 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 677 107827582
chr1 149887791 149888715 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 719 107827583
chr1 149887830 149888615 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 819 107827584
chr1 149887832 149888941 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 493 107827585
chr1 149887836 149888929 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 505 107827586
chr1 149887854 149888958 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 476 107827587
chr1 149887895 149888989 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 445 107827588
chr1 149887982 149889317 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 117 107827589
chr1 149887987 149888711 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 723 107827590
chr1 149888010 149888695 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 739 107827591
chr1 149888032 149889110 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 324 107827592
chr1 149888051 149889306 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 128 107827593
chr1 149888052 149888790 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 644 107827594
chr1 149888067 149888693 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 741 107827595
chr1 149888088 149888939 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 495 107827596
chr1 149888098 149888842 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 592 107827597
chr1 149888103 149888913 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 521 107827598
chr1 149888109 149889153 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 281 107827599
chr1 149888116 149888844 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 590 107827600
chr1 149888116 149889328 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 106 107827601
chr1 149888122 149888770 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 664 107827602
chr1 149888123 149888784 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 650 107827603
chr1 149888130 149888805 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 629 107827604
chr1 149888133 149888837 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 597 107827605
chr1 149888158 149889033 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 401 107827606
chr1 149888171 149889146 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 288 107827607
chr1 149888182 149889012 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 422 107827608
chr1 149888185 149888891 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 543 107827609
chr1 149888190 149888487 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 947 107827610
chr1 149888194 149889033 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 401 107827611
chr1 149888200 149888815 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 619 107827612
chr1 149888205 149889073 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 361 107827613
chr1 149888206 149889415 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 19 107827614
chr1 149888208 149888982 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 452 107827615
chr1 149888211 149888796 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 638 107827616
chr1 149888212 149889302 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 132 107827617
chr1 149888215 149888991 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 443 107827618
chr1 149888232 149888979 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 455 107827619
chr1 149888240 149888689 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 745 107827620
chr1 149888240 149889045 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 389 107827621
chr1 149888243 149888810 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 624 107827622
chr1 149888256 149888677 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 757 107827623
chr1 149888257 149888775 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 659 107827624
chr1 149888259 149888755 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 679 107827625
chr1 149888263 149888790 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 644 107827626
chr1 149888263 149888848 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 586 107827627
chr1 149888263 149889391 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 43 107827628
chr1 149888265 149888969 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 465 107827629
chr1 149888269 149888883 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 551 107827630
chr1 149888273 149888548 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 886 107827631
chr1 149888277 149888743 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 691 107827632
chr1 149888281 149888772 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 662 107827633
chr1 149888296 149888781 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 653 107827634
chr1 149888311 149888942 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 492 107827635
chr1 149888317 149888772 CTCF GTRD no Kidney 149889434 662 107827636
chr1 149888320 149888849 CTCF GTRD no Lung 149889434 585 107827637
chr1 149888327 149888971 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 463 107827638
chr1 149888328 149888651 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 783 107827639
chr1 149888333 149888787 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 647 107827640
chr1 149888334 149888891 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 543 107827641
chr1 149888340 149888839 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 595 107827642
chr1 149888342 149888785 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 649 107827643
chr1 149888342 149888926 CTCF GTRD no Spleen 149889434 508 107827644
chr1 149888343 149888742 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 692 107827645
chr1 149888349 149888813 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 149889434 621 107827646
chr1 149888351 149888747 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 687 107827647
chr1 149888372 149888768 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 666 107827648
chr1 149888375 149888752 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 149889434 682 107827649
chr1 149888393 149888870 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 149889434 564 107827650
chr1 149888407 149888840 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 149889434 594 107827651
chr1 149888408 149888908 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 526 107827652
chr1 149888409 149888804 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 630 107827653
chr1 149888413 149888824 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 610 107827654
chr1 149888423 149888804 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 630 107827655
chr1 149888435 149888821 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 149889434 613 107827656
chr1 149888467 149888842 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 592 107827657
chr1 149888484 149889018 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 416 107827658
chr1 149888496 149888877 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 149889434 557 107827659
chr1 149888503 149888699 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 149889434 735 107827660
chr1 149888518 149888533 TP53 JASPAR yes 149889434 901 118365961
chr1 149888537 149888542 SP1 TRANSFAC yes 149889434 892 118365962
chr1 149888537 149888543 SP1 TRANSFAC yes 149889434 891 118365963
chr1 149888540 149888558 MAFF JASPAR yes 149889434 876 118365964
chr1 149888541 149888556 MAFK JASPAR yes 149889434 878 118365965
chr1 149888543 149888547 NFE TRANSFAC yes 149889434 887 118365966
chr1 149888544 149888774 YY1 GTRD no Embryonic Stem Cell Line (H1-hESC) 149889434 660 107827661
chr1 149888545 149888556 NRL JASPAR yes 149889434 878 118365967
chr1 149888550 149888554 YY1 TRANSFAC yes 149889434 880 118365968
chr1 149888557 149888569 ZBTB7A JASPAR yes 149889434 865 118365969
chr1 149888558 149888570 ZBTB7B JASPAR yes 149889434 864 118365970
chr1 149888558 149888570 ZBTB7C JASPAR yes 149889434 864 118365971
chr1 149888560 149888580 RREB1 JASPAR yes 149889434 854 118365972
chr1 149888561 149888571 SP1 JASPAR yes 149889434 863 118365973
chr1 149888561 149888571 ZNF740 JASPAR yes 149889434 863 118365974
chr1 149888562 149888582 RREB1 JASPAR yes 149889434 852 118365975
chr1 149888563 149888573 ZNF740 JASPAR yes 149889434 861 118365976
chr1 149888565 149888586 ZNF263 JASPAR yes 149889434 848 118365977
chr1 149888599 149888610 NFKB1 JASPAR yes 149889434 824 118365978
chr1 149888600 149888610 REL JASPAR yes 149889434 824 118365979
chr1 149888600 149888611 NFKB1 JASPAR yes 149889434 823 118365980
chr1 149888601 149888611 REL JASPAR yes 149889434 823 118365981
SNPs associated with SV2A[ENSG00000159164.5], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr1 149889489 rs112851681 A G 55 Esophagus 1.09062e-12 619097
chr1 149882811 rs72708162 G T 0 Esophagus 3.56042e-08 619029
chr1 150878649 rs115298177 C T 989215 Pancreas 0.117066 623542
chr1 150607787 rs190018150 G A 718353 Spleen 0.35566 622664
chr1 149747295 rs2791026 T C 127575 Ovary 0.026976 618719
chr1 149889489 rs112851681 A G 55 Lung 5.06307e-10 619097
chr1 150078692 rs11205327 C T 189258 Stomach 0.0290928 619843
Details of SV2A[ENSG00000159164.5]
Back to top
Genomic Location chr1:149874870-149889434[-]
TSS 149889434
Gene Name SV2A
Ensembl ID ENSG00000159164.5
ENTREZID 9900
Uniprot
Q7L0J3
B4E000
Protein Name
Alternative protein SV2A
Synaptic vesicle glycoprotein 2A
Expression levels of SV2A[ENSG00000159164.5]
Back to top