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Enhancers that regulate GOLT1A[ENSG00000174567.7]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr1 204093945 204099995 enh12574 204183220 83225
Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Ovary Esophagus Muscle (A673) Placenta Stomach
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VISTA
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Bone Marrow (K562)
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Large Intestine
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Epithelial (MCF-7) Colon (HCT116) Lung (PC-9) Neural Stem Cells (H9) Stomach
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Prostate (PC-3) Bone (Osteoblast) Placenta Lung (PC-9) Stomach
chr1 204216945 204224635 enh12576 204183220 33725
Placenta
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Muscle (Myoblast)
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VISTA
chr1 204245511 204275535 enh12577 204183220 62291
Colon (HCT116) Embryonic Stem Cell Line (H1-hESC) Pancreas Uterus Epithelial (MCF-7) Stomach Brain (SK-N-SH) Ovary Bone (Osteoblast) Peripheral Blood (MM.1S) Neural Stem Cells (H9) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Esophagus Placenta Lung (PC-9) Breast Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Liver (HepG2) Prostate (RWPE1) Lung Muscle (A673) Heart
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VISTA
chr1 204255998 204256379 vista4676 204183220 72778
VISTA
chr1 204261217 204266185 vista127 204183220 77997
VISTA
chr1 204274077 204274452 vista4677 204183220 90857
VISTA
chr1 204280925 204295275 enh12578 204183220 97705
Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-SH) Brain (SK-N-MC) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Lung (PC-9) Stomach Placenta Colon (HCT116) Peripheral Blood (MM.1S) Muscle (Myoblast) Breast Neural Stem Cells (H9) Epithelial (MCF-7)
Transcript facotrs that regulate GOLT1A[ENSG00000174567.7]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr1 204179187 204179202 RUNX2 JASPAR yes 204183220 4018 34684391
chr1 204179188 204179203 FOXP1 JASPAR yes 204183220 4017 34684392
chr1 204179188 204179203 MEF2C JASPAR yes 204183220 4017 34684393
chr1 204179188 204179208 RREB1 JASPAR yes 204183220 4012 34684394
chr1 204179188 204179209 IRF1 JASPAR yes 204183220 4011 34684395
chr1 204179190 204179205 IRF9 JASPAR yes 204183220 4015 34684396
chr1 204179190 204179210 RREB1 JASPAR yes 204183220 4010 34684397
chr1 204179191 204179205 IRF7 JASPAR yes 204183220 4015 34684398
chr1 204179192 204179207 STAT2 JASPAR yes 204183220 4013 34684399
chr1 204179193 204179205 IRF1 JASPAR yes 204183220 4015 34684400
chr1 204179193 204179208 FOXP1 JASPAR yes 204183220 4012 34684401
chr1 204179193 204179214 IRF1 JASPAR yes 204183220 4006 34684402
chr1 204179195 204179215 RREB1 JASPAR yes 204183220 4005 34684403
chr1 204179198 204179210 IRF1 JASPAR yes 204183220 4010 34684404
chr1 204179198 204179213 FOXP1 JASPAR yes 204183220 4007 34684405
chr1 204179199 204179220 IRF1 JASPAR yes 204183220 4000 34684406
chr1 204179200 204179220 RREB1 JASPAR yes 204183220 4000 34684407
chr1 204179207 204179219 MEF2D JASPAR yes 204183220 4001 34684408
chr1 204179209 204179224 FOXP1 JASPAR yes 204183220 3996 34684409
chr1 204179210 204179225 PRDM1 JASPAR yes 204183220 3995 34684410
chr1 204179210 204179225 STAT2 JASPAR yes 204183220 3995 34684411
chr1 204179228 204179231 MYB TRANSFAC yes 204183220 3989 34684412
chr1 204179277 204179281 YY1 TRANSFAC yes 204183220 3939 34684413
chr1 204179277 204179288 HOXC11 JASPAR yes 204183220 3932 34684414
chr1 204179278 204179288 EMX1 JASPAR yes 204183220 3932 34684415
chr1 204179278 204179288 MEOX2 JASPAR yes 204183220 3932 34684416
chr1 204179279 204179287 NKX6-1 JASPAR yes 204183220 3933 34684417
chr1 204179279 204179289 POU6F2 JASPAR yes 204183220 3931 34684418
chr1 204179281 204179292 ESRRA JASPAR yes 204183220 3928 34684419
chr1 204179281 204179292 ESRRB JASPAR yes 204183220 3928 34684420
chr1 204179283 204179293 RORA JASPAR yes 204183220 3927 34684421
chr1 204179296 204179311 NFYB JASPAR yes 204183220 3909 34684422
chr1 204179298 204179314 NFYA JASPAR yes 204183220 3906 34684423
chr1 204179303 204179307 H1TF2 TRANSFAC yes 204183220 3913 34684424
chr1 204179303 204179307 NFE TRANSFAC yes 204183220 3913 34684425
chr1 204179303 204179307 SRF TRANSFAC yes 204183220 3913 34684426
chr1 204179308 204179312 LFA1 TRANSFAC yes 204183220 3908 34684427
chr1 204179308 204179320 PKNOX2 JASPAR yes 204183220 3900 34684428
chr1 204179309 204179318 SNAI2 JASPAR yes 204183220 3902 34684429
chr1 204179309 204179319 ID4 JASPAR yes 204183220 3901 34684430
chr1 204179309 204179319 NHLH1 JASPAR yes 204183220 3901 34684431
chr1 204179309 204179319 TCF3 JASPAR yes 204183220 3901 34684432
chr1 204179309 204179319 TCF4 JASPAR yes 204183220 3901 34684433
chr1 204179311 204179320 ZEB1 JASPAR yes 204183220 3900 34684434
chr1 204179311 204179321 TBX21 JASPAR yes 204183220 3899 34684435
chr1 204179311 204179322 TBX20 JASPAR yes 204183220 3898 34684436
chr1 204179311 204179322 TBX2 JASPAR yes 204183220 3898 34684437
chr1 204179311 204179324 EOMES JASPAR yes 204183220 3896 34684438
chr1 204179312 204179320 MGA JASPAR yes 204183220 3900 34684439
chr1 204179312 204179320 TBX15 JASPAR yes 204183220 3900 34684440
chr1 204179312 204179320 TBX1 JASPAR yes 204183220 3900 34684441
chr1 204179312 204179320 TBX4 JASPAR yes 204183220 3900 34684442
chr1 204179312 204179320 TBX5 JASPAR yes 204183220 3900 34684443
chr1 204179312 204179322 TBR1 JASPAR yes 204183220 3898 34684444
chr1 204179344 204179358 MTF1 JASPAR yes 204183220 3862 34684445
chr1 204179376 204179393 NR3C1 JASPAR yes 204183220 3827 34684446
chr1 204179376 204179393 NR3C2 JASPAR yes 204183220 3827 34684447
chr1 204179387 204179401 ONECUT3 JASPAR yes 204183220 3819 34684448
chr1 204179412 204179415 MYB TRANSFAC yes 204183220 3805 34684449
chr1 204179415 204179436 IRF1 JASPAR yes 204183220 3784 34684450
chr1 204179416 204179437 ZNF263 JASPAR yes 204183220 3783 34684451
chr1 204179417 204179432 PRDM1 JASPAR yes 204183220 3788 34684452
chr1 204179426 204179430 NFE TRANSFAC yes 204183220 3790 34684453
chr1 204179443 204179464 ZNF263 JASPAR yes 204183220 3756 34684454
chr1 204179444 204179465 ZNF263 JASPAR yes 204183220 3755 34684455
chr1 204179517 204179521 YY1 TRANSFAC yes 204183220 3699 34684456
chr1 204179534 204179544 MAX JASPAR yes 204183220 3676 34684457
chr1 204179535 204179550 FOXA1 JASPAR yes 204183220 3670 34684458
chr1 204179536 204179548 FOXI1 JASPAR yes 204183220 3672 34684459
chr1 204179536 204179551 FOXP1 JASPAR yes 204183220 3669 34684460
chr1 204179537 204179548 FOXP2 JASPAR yes 204183220 3672 34684461
chr1 204179537 204179549 FOXC2 JASPAR yes 204183220 3671 34684462
chr1 204179537 204179551 FOXF2 JASPAR yes 204183220 3669 34684463
chr1 204179538 204179546 FOXG1 JASPAR yes 204183220 3674 34684464
chr1 204179539 204179550 FOXA1 JASPAR yes 204183220 3670 34684465
chr1 204179539 204179554 MEF2A JASPAR yes 204183220 3666 34684466
chr1 204179540 204179555 MEF2C JASPAR yes 204183220 3665 34684467
chr1 204179540 204179561 IRF1 JASPAR yes 204183220 3659 34684468
chr1 204179543 204179547 YY1 TRANSFAC yes 204183220 3673 34684469
chr1 204179544 204179556 IRF1 JASPAR yes 204183220 3664 34684470
chr1 204179546 204179552 TCF4 TRANSFAC yes 204183220 3668 34684471
chr1 204179546 204179561 FOXP1 JASPAR yes 204183220 3659 34684472
chr1 204179546 204179567 IRF1 JASPAR yes 204183220 3653 34684473
chr1 204179552 204179567 MEF2C JASPAR yes 204183220 3653 34684474
chr1 204179576 204179595 PAX5 JASPAR yes 204183220 3625 34684475
chr1 204179631 204179649 RARA JASPAR yes 204183220 3571 34684476
chr1 204179644 204179655 EBF1 JASPAR yes 204183220 3565 34684477
chr1 204179703 204179713 SP1 JASPAR yes 204183220 3507 34684478
chr1 204179706 204179715 HIC2 JASPAR yes 204183220 3505 34684479
chr1 204179725 204179736 PHOX2A JASPAR yes 204183220 3484 34684480
chr1 204179741 204179747 TCF4 TRANSFAC yes 204183220 3473 34684481
chr1 204179759 204179770 CEBPA JASPAR yes 204183220 3450 34684482
chr1 204179760 204179771 CEBPB JASPAR yes 204183220 3449 34684483
chr1 204179783 204179801 RARA JASPAR yes 204183220 3419 34684484
chr1 204179794 204179809 TFAP2A JASPAR yes 204183220 3411 34684485
chr1 204179812 204179830 MAFF JASPAR yes 204183220 3390 34684486
chr1 204179814 204179825 NRL JASPAR yes 204183220 3395 34684487
chr1 204179814 204179829 MAFK JASPAR yes 204183220 3391 34684488
SNPs associated with GOLT1A[ENSG00000174567.7], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr1 204642591 rs2782525 C T 459371 Esophagus 0.339493 877986
chr1 204077306 rs61029411 T G 89982 Esophagus 0.223273 873753
chr1 204253206 rs6659692 G A 69986 Pancreas 0.00715659 874698
chr1 203481855 rs112029148 G C 685433 Breast 0.385927 868702
chr1 203483087 rs78377534 C T 684201 Uterus 0.284543 868723
chr1 204852372 rs12022103 G A 669152 Lung 0.112476 879792
Details of GOLT1A[ENSG00000174567.7]
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Genomic Location chr1:204167288-204183220[-]
TSS 204183220
Gene Name GOLT1A
Ensembl ID ENSG00000174567.7
ENTREZID 127845
Uniprot
Q6ZVE7
Protein Name
Vesicle transport protein GOT1A
Expression levels of GOLT1A[ENSG00000174567.7]
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