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Enhancers that regulate POLR2E[ENSG00000099817.7]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Blood (Karpas-422)
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Uterus
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VISTA
Transcript facotrs that regulate POLR2E[ENSG00000099817.7]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr19 1096038 1096049 ETV2 JASPAR yes 1095598 440 111992053
chr19 1096038 1096050 ELF1 JASPAR yes 1095598 440 111992054
chr19 1096038 1096050 ELF4 JASPAR yes 1095598 440 111992055
chr19 1096038 1096051 ELF1 JASPAR yes 1095598 440 111992056
chr19 1096039 1096046 SPI1 JASPAR yes 1095598 441 111992057
chr19 1096039 1096047 EHF JASPAR yes 1095598 441 111992058
chr19 1096039 1096047 FEV JASPAR yes 1095598 441 111992059
chr19 1096055 1096059 NFE TRANSFAC yes 1095598 457 111992060
chr19 1096062 1096065 MYB TRANSFAC yes 1095598 464 111992061
chr19 1096094 1096098 YY1 TRANSFAC yes 1095598 496 111992062
chr19 1096096 1096111 MAFK JASPAR yes 1095598 498 111992063
chr19 1096139 1096144 GATA2 JASPAR yes 1095598 541 111992064
chr19 1096151 1096165 GATA2 JASPAR yes 1095598 553 111992065
chr19 1096153 1096161 GATA3 JASPAR yes 1095598 555 111992066
chr19 1096176 1096190 ONECUT3 JASPAR yes 1095598 578 111992067
chr19 1096177 1096181 TEAD2 TRANSFAC yes 1095598 579 111992068
chr19 1096183 1096197 CREB3 JASPAR yes 1095598 585 111992069
chr19 1096186 1096189 MYB TRANSFAC yes 1095598 588 111992070
chr19 1096201 1096212 FOSL2 JASPAR yes 1095598 603 111992071
chr19 1096202 1096213 NFE2 JASPAR yes 1095598 604 111992072
chr19 1096215 1096219 TEAD2 TRANSFAC yes 1095598 617 111992073
chr19 1096216 1096224 RHOXF1 JASPAR yes 1095598 618 111992074
chr19 1096217 1096238 LUN1 TRANSFAC yes 1095598 619 111992075
chr19 1096241 1096246 SP1 TRANSFAC yes 1095598 643 111992076
chr19 1096242 1096247 SP1 TRANSFAC yes 1095598 644 111992077
chr19 1096242 1096251 THAP1 JASPAR yes 1095598 644 111992078
chr19 1096245 1096249 LFA1 TRANSFAC yes 1095598 647 111992079
chr19 1096256 1096274 RARA JASPAR yes 1095598 658 111992080
chr19 1096284 1096287 MYB TRANSFAC yes 1095598 686 111992081
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chr19 1096305 1096320 MEF2C JASPAR yes 1095598 707 111992084
chr19 1096306 1096321 MEF2A JASPAR yes 1095598 708 111992085
chr19 1096307 1096319 MEF2A JASPAR yes 1095598 709 111992086
chr19 1096307 1096319 MEF2B JASPAR yes 1095598 709 111992087
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chr19 1096338 1096350 HES7 JASPAR yes 1095598 740 111992089
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chr19 1096338 1096350 TGIF2 JASPAR yes 1095598 740 111992092
chr19 1096339 1096348 SNAI2 JASPAR yes 1095598 741 111992093
chr19 1096339 1096349 HEY2 JASPAR yes 1095598 741 111992094
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chr19 1096339 1096349 TCF4 JASPAR yes 1095598 741 111992096
chr19 1096400 1096418 RARA JASPAR yes 1095598 802 111992097
chr19 1096466 1096470 NFE TRANSFAC yes 1095598 868 111992098
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chr19 1096789 1096794 SP1 TRANSFAC yes 1095598 1191 111992145
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chr19 1096851 1096856 SP1 TRANSFAC yes 1095598 1253 111992148
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chr19 1096856 1096873 ESR1 JASPAR yes 1095598 1258 111992150
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chr19 1096918 1096939 IRF1 JASPAR yes 1095598 1320 111992153
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chr19 1096921 1096936 FOXP1 JASPAR yes 1095598 1323 111992155
chr19 1096922 1096937 FOXP1 JASPAR yes 1095598 1324 111992156
chr19 1096923 1096938 FOXP1 JASPAR yes 1095598 1325 111992157
chr19 1096924 1096939 FOXP1 JASPAR yes 1095598 1326 111992158
chr19 1096925 1096940 FOXP1 JASPAR yes 1095598 1327 111992159
chr19 1096937 1096953 NFYA JASPAR yes 1095598 1339 111992160
chr19 1096941 1096959 E2F3 JASPAR yes 1095598 1343 111992161
chr19 1096944 1096956 E2F1 JASPAR yes 1095598 1346 111992162
chr19 1096954 1096967 EOMES JASPAR yes 1095598 1356 111992163
chr19 1096956 1096966 TBR1 JASPAR yes 1095598 1358 111992164
chr19 1096957 1096967 TBX21 JASPAR yes 1095598 1359 111992165
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chr19 1096958 1096966 TBX1 JASPAR yes 1095598 1360 111992168
chr19 1096958 1096966 TBX4 JASPAR yes 1095598 1360 111992169
chr19 1096958 1096966 TBX5 JASPAR yes 1095598 1360 111992170
chr19 1096958 1096967 ZEB1 JASPAR yes 1095598 1360 111992171
chr19 1096958 1096970 PKNOX1 JASPAR yes 1095598 1360 111992172
chr19 1096958 1096970 TGIF1 JASPAR yes 1095598 1360 111992173
chr19 1096958 1096971 ZBTB18 JASPAR yes 1095598 1360 111992174
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chr19 1096959 1096969 ID4 JASPAR yes 1095598 1361 111992176
chr19 1096959 1096969 TCF3 JASPAR yes 1095598 1361 111992177
chr19 1096959 1096969 TCF4 JASPAR yes 1095598 1361 111992178
chr19 1096960 1096969 SNAI2 JASPAR yes 1095598 1362 111992179
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chr19 1096971 1096992 REST JASPAR yes 1095598 1373 111992181
chr19 1096981 1097002 ZNF263 JASPAR yes 1095598 1383 111992182
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chr19 1097005 1097011 LEF1 TRANSFAC yes 1095598 1407 111992186
chr19 1097005 1097011 SOX10 JASPAR yes 1095598 1407 111992187
chr19 1097016 1097027 NFIL3 JASPAR yes 1095598 1418 111992188
chr19 1097020 1097032 MEF2B JASPAR yes 1095598 1422 111992189
chr19 1097059 1097063 YY1 TRANSFAC yes 1095598 1461 111992190
chr19 1097070 1097084 GLIS3 JASPAR yes 1095598 1472 111992191
chr19 1097078 1097092 PLAG1 JASPAR yes 1095598 1480 111992192
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chr19 1097090 1097111 IRF1 JASPAR yes 1095598 1492 111992195
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chr19 1097095 1097110 FOXP1 JASPAR yes 1095598 1497 111992198
chr19 1097096 1097111 FOXP1 JASPAR yes 1095598 1498 111992199
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chr19 1097131 1097142 TFAP2B JASPAR yes 1095598 1533 111992203
chr19 1097132 1097141 TFAP2A JASPAR yes 1095598 1534 111992204
chr19 1097190 1097200 SREBF2 JASPAR yes 1095598 1592 111992205
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chr19 1097235 1097247 PKNOX1 JASPAR yes 1095598 1637 111992208
chr19 1097235 1097247 PKNOX2 JASPAR yes 1095598 1637 111992209
chr19 1097235 1097247 TGIF2 JASPAR yes 1095598 1637 111992210
chr19 1097236 1097246 HEY2 JASPAR yes 1095598 1638 111992211
chr19 1097236 1097246 ID4 JASPAR yes 1095598 1638 111992212
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chr19 1097237 1097246 SNAI2 JASPAR yes 1095598 1639 111992214
chr19 1097238 1097243 USF2 TRANSFAC yes 1095598 1640 111992215
chr19 1097246 1097256 SP1 JASPAR yes 1095598 1648 111992216
chr19 1097246 1097265 PAX5 JASPAR yes 1095598 1648 111992217
chr19 1097249 1097254 SP1 TRANSFAC yes 1095598 1651 111992218
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chr19 1097266 1097278 MEF2A JASPAR yes 1095598 1668 111992221
chr19 1097266 1097278 MEF2B JASPAR yes 1095598 1668 111992222
chr19 1097266 1097278 MEF2D JASPAR yes 1095598 1668 111992223
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chr19 1098013 1098034 ZNF263 JASPAR yes 1095598 2415 111992347
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chr19 1098045 1098051 MZF1 JASPAR yes 1095598 2447 111992352
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chr19 1098079 1098084 GATA2 JASPAR yes 1095598 2481 111992355
SNPs associated with POLR2E[ENSG00000099817.7], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr19 1088078 rs2238586 G T 0 Esophagus 1.84061e-11 5371485
chr19 1100074 rs4806971 C G 4476 Esophagus 0.00216525 5371680
chr19 1088285 rs6843 T C 0 Esophagus 7.4941e-31 5371491
chr19 1095061 rs2074445 C T 0 Pancreas 9.58353e-05 5371582
chr19 1097006 rs72975527 C A,G 1408 Breast 5.14649e-05 5371624
chr19 1098809 rs11668388 T A 3211 Spleen 0.0597128 5371664
chr19 1095122 rs2074446 C G 0 Ovary 0.171262 5371583
chr19 1095061 rs2074445 C T 0 Thyroid 1.5446e-22 5371582
chr19 1085966 rs3761028 A C,G,T 628 Liver 0.278292 5371415
chr19 1095430 rs17554909 T G 0 Lung 6.7485e-13 5371592
chr19 1095030 rs2074444 C T 0 Adrenal 0.00041162 5371581
Details of POLR2E[ENSG00000099817.7]
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Genomic Location chr19:1086594-1095598[-]
TSS 1095598
Gene Name POLR2E
Ensembl ID ENSG00000099817.7
ENTREZID 5434
Uniprot
P19388
B4DJ89
Protein Name
II
and III subunit RPABC1
DNA-directed RNA polymerases I
Polymerase
Expression levels of POLR2E[ENSG00000099817.7]
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