EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. NCLN[ENSG00000125912.6]
Enhancers that regulate NCLN[ENSG00000125912.6]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr19 3083065 3088755 enh52834 3185561 96806
Large Intestine Stomach
chr19 3095151 3109595 enh48150 3185561 75966
Liver (HepG2) Brain (SK-N-SH) Large Intestine Esophagus Bone (Osteoblast) Stomach Thyroid Pancreas Uterus Thymus Epithelial (MCF-7)
chr19 3124095 3128297 enh89916 3185561 57264
Prostate (RWPE1)
chr19 3124672 3124910 vista28266 3185561 60651
VISTA
chr19 3131132 3131258 vista28267 3185561 54303
VISTA
chr19 3133345 3133760 vista28268 3185561 51801
VISTA
chr19 3138785 3144645 enh17859 3185561 40916
Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Blood (T-cell) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Lung Blood (GM12878) Stomach Muscle (A673) Placenta Lung (PC-9) Pancreas (Panc1) Uterus Thymus Heart
chr19 3140705 3140960 vista28269 3185561 44601
VISTA
chr19 3153392 3153939 vista28270 3185561 31622
VISTA
chr19 3154006 3154458 vista28271 3185561 31103
VISTA
chr19 3165816 3165994 vista28272 3185561 19567
VISTA
chr19 3170105 3178875 enh17860 3185561 6686
Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Stomach Placenta Colon (HCT116) Thyroid Lung (PC-9) Breast Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7)
chr19 3177322 3177366 vista28273 3185561 8195
VISTA
chr19 3186541 3192308 enh52835 3185561 980
Bone (Osteoblast) Large Intestine
chr19 3210773 3215590 enh60740 3185561 25212
Blood (OCI-LY7)
chr19 3222791 3223093 vista28274 3185561 37230
VISTA
chr19 3231384 3231772 vista28275 3185561 45823
VISTA
chr19 3242105 3246255 enh91204 3185561 56544
Bone Marrow (K562)
chr19 3271003 3271310 vista28276 3185561 85442
VISTA
Transcript facotrs that regulate NCLN[ENSG00000125912.6]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr19 3187022 3187032 RELA JASPAR yes 3185561 1461 112115736
chr19 3187022 3187033 NFKB1 JASPAR yes 3185561 1461 112115737
chr19 3187027 3187041 RXRB JASPAR yes 3185561 1466 112115738
chr19 3187027 3187041 RXRG JASPAR yes 3185561 1466 112115739
chr19 3187027 3187042 HNF4G JASPAR yes 3185561 1466 112115740
chr19 3187027 3187042 LEF1 JASPAR yes 3185561 1466 112115741
chr19 3187027 3187042 NR2C2 JASPAR yes 3185561 1466 112115742
chr19 3187028 3187042 PLAG1 JASPAR yes 3185561 1467 112115743
chr19 3187030 3187043 NR2F1 JASPAR yes 3185561 1469 112115744
chr19 3187033 3187047 RORA JASPAR yes 3185561 1472 112115745
chr19 3187037 3187058 ZNF263 JASPAR yes 3185561 1476 112115746
chr19 3187045 3187049 NFE TRANSFAC yes 3185561 1484 112115747
chr19 3187046 3187053 E2F1 TRANSFAC yes 3185561 1485 112115748
chr19 3187050 3187065 LEF1 JASPAR yes 3185561 1489 112115749
chr19 3187051 3187065 TCF7L2 JASPAR yes 3185561 1490 112115750
chr19 3187053 3187060 TCF4 TRANSFAC yes 3185561 1492 112115751
chr19 3187054 3187060 LEF1 TRANSFAC yes 3185561 1493 112115752
chr19 3187054 3187060 TCF4 TRANSFAC yes 3185561 1493 112115753
chr19 3187069 3187074 SP1 TRANSFAC yes 3185561 1508 112115754
chr19 3187071 3187092 ZNF263 JASPAR yes 3185561 1510 112115755
chr19 3187084 3187104 RREB1 JASPAR yes 3185561 1523 112115756
chr19 3187087 3187098 TBX20 JASPAR yes 3185561 1526 112115757
chr19 3187089 3187097 MGA JASPAR yes 3185561 1528 112115758
chr19 3187089 3187097 TBX15 JASPAR yes 3185561 1528 112115759
chr19 3187089 3187097 TBX1 JASPAR yes 3185561 1528 112115760
chr19 3187089 3187097 TBX4 JASPAR yes 3185561 1528 112115761
chr19 3187089 3187097 TBX5 JASPAR yes 3185561 1528 112115762
chr19 3187096 3187111 STAT1 JASPAR yes 3185561 1535 112115763
chr19 3187098 3187109 STAT1 JASPAR yes 3185561 1537 112115764
chr19 3187098 3187109 STAT3 JASPAR yes 3185561 1537 112115765
chr19 3187100 3187114 PLAG1 JASPAR yes 3185561 1539 112115766
chr19 3187108 3187123 SCRT1 JASPAR yes 3185561 1547 112115767
chr19 3187121 3187138 BCL6B JASPAR yes 3185561 1560 112115768
chr19 3187131 3187136 H4TF1 TRANSFAC yes 3185561 1570 112115769
chr19 3187131 3187142 ETV2 JASPAR yes 3185561 1570 112115770
chr19 3187132 3187140 FEV JASPAR yes 3185561 1571 112115771
chr19 3187134 3187141 SPIB JASPAR yes 3185561 1573 112115772
chr19 3187157 3187169 INSM1 JASPAR yes 3185561 1596 112115773
chr19 3187181 3187194 SMAD2 JASPAR yes 3185561 1620 112115774
chr19 3187185 3187205 RREB1 JASPAR yes 3185561 1624 112115775
chr19 3187205 3187211 SP1 TRANSFAC yes 3185561 1644 112115776
chr19 3187205 3187219 ZIC1 JASPAR yes 3185561 1644 112115777
chr19 3187205 3187220 ZIC3 JASPAR yes 3185561 1644 112115778
chr19 3187232 3187242 SMAD3 JASPAR yes 3185561 1671 112115779
chr19 3187232 3187247 HSF1 JASPAR yes 3185561 1671 112115780
chr19 3187233 3187246 HSF1 JASPAR yes 3185561 1672 112115781
chr19 3187233 3187246 HSF4 JASPAR yes 3185561 1672 112115782
chr19 3187239 3187250 FOXH1 JASPAR yes 3185561 1678 112115783
chr19 3187275 3187279 NFE TRANSFAC yes 3185561 1714 112115784
chr19 3187282 3187295 HSF2 JASPAR yes 3185561 1721 112115785
chr19 3187283 3187293 TEAD4 JASPAR yes 3185561 1722 112115786
chr19 3187284 3187292 TEAD3 JASPAR yes 3185561 1723 112115787
chr19 3187298 3187302 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 1737 112115788
chr19 3187335 3187339 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 1774 112115789
chr19 3187375 3187387 HINFP JASPAR yes 3185561 1814 112115790
chr19 3187427 3187432 NFY TRANSFAC yes 3185561 1866 112115791
chr19 3187431 3187435 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 1870 112115792
chr19 3187468 3187479 NFKB1 JASPAR yes 3185561 1907 112115793
chr19 3187472 3187486 GLIS2 JASPAR yes 3185561 1911 112115794
chr19 3187489 3187501 TFAP2C JASPAR yes 3185561 1928 112115795
chr19 3187490 3187501 EBF1 JASPAR yes 3185561 1929 112115796
chr19 3187495 3187500 TFAP2A TRANSFAC yes 3185561 1934 112115797
chr19 3187495 3187501 MZF1 JASPAR yes 3185561 1934 112115798
chr19 3187500 3187516 SRF JASPAR yes 3185561 1939 112115799
chr19 3187506 3187517 EBF1 JASPAR yes 3185561 1945 112115800
chr19 3187521 3187536 HNF4A JASPAR yes 3185561 1960 112115801
chr19 3187522 3187537 HNF4G JASPAR yes 3185561 1961 112115802
chr19 3187537 3187541 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 1976 112115803
chr19 3187539 3187553 PLAG1 JASPAR yes 3185561 1978 112115804
chr19 3187542 3187546 YY1 TRANSFAC yes 3185561 1981 112115805
chr19 3187562 3187577 FOXP1 JASPAR yes 3185561 2001 112115806
chr19 3187568 3187575 NKX3-1 JASPAR yes 3185561 2007 112115807
chr19 3187578 3187587 SOX9 JASPAR yes 3185561 2017 112115808
chr19 3187593 3187605 HINFP JASPAR yes 3185561 2032 112115809
chr19 3187614 3187619 TFAP2A TRANSFAC yes 3185561 2053 112115810
chr19 3187614 3187620 MZF1 JASPAR yes 3185561 2053 112115811
chr19 3187618 3187633 RUNX2 JASPAR yes 3185561 2057 112115812
chr19 3187621 3187632 RUNX1 JASPAR yes 3185561 2060 112115813
chr19 3187622 3187632 RUNX3 JASPAR yes 3185561 2061 112115814
chr19 3187622 3187634 ZBTB7A JASPAR yes 3185561 2061 112115815
chr19 3187651 3187671 RREB1 JASPAR yes 3185561 2090 112115816
chr19 3187709 3187718 SP1 TRANSFAC yes 3185561 2148 112115817
chr19 3187755 3187760 ETS2 TRANSFAC yes 3185561 2194 112115818
chr19 3187759 3187774 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2198 112115819
chr19 3187761 3187773 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2200 112115820
chr19 3187761 3187773 TFAP2B JASPAR yes 3185561 2200 112115821
chr19 3187761 3187773 TFAP2C JASPAR yes 3185561 2200 112115822
chr19 3187761 3187776 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2200 112115823
chr19 3187761 3187776 TFAP2C JASPAR yes 3185561 2200 112115824
chr19 3187762 3187771 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2201 112115825
chr19 3187762 3187773 EBF1 JASPAR yes 3185561 2201 112115826
chr19 3187763 3187772 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2202 112115827
chr19 3187767 3187772 SP1 TRANSFAC yes 3185561 2206 112115828
chr19 3187785 3187789 TEAD2 TRANSFAC yes 3185561 2224 112115829
chr19 3187785 3187790 TBP TRANSFAC yes 3185561 2224 112115830
chr19 3187812 3187817 SP1 TRANSFAC yes 3185561 2251 112115831
chr19 3187822 3187842 PPARG JASPAR yes 3185561 2261 112115832
chr19 3187855 3187861 ETS1 JASPAR yes 3185561 2294 112115833
chr19 3187868 3187878 REL JASPAR yes 3185561 2307 112115834
chr19 3187868 3187879 NFKB1 JASPAR yes 3185561 2307 112115835
chr19 3187868 3187881 NFKB2 JASPAR yes 3185561 2307 112115836
chr19 3187869 3187879 NFKB1 JASPAR yes 3185561 2308 112115837
chr19 3187869 3187879 RELA JASPAR yes 3185561 2308 112115838
chr19 3187869 3187879 REL JASPAR yes 3185561 2308 112115839
chr19 3187869 3187880 NFKB1 JASPAR yes 3185561 2308 112115840
chr19 3187874 3187888 EBF1 JASPAR yes 3185561 2313 112115841
chr19 3187880 3187890 SP1 JASPAR yes 3185561 2319 112115842
chr19 3187882 3187887 ETS2 TRANSFAC yes 3185561 2321 112115843
chr19 3187888 3187892 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 2327 112115844
chr19 3187897 3187901 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 2336 112115845
chr19 3187917 3187929 YY1 JASPAR yes 3185561 2356 112115846
chr19 3187925 3187931 TCF4 TRANSFAC yes 3185561 2364 112115847
chr19 3187967 3187986 PAX5 JASPAR yes 3185561 2406 112115848
chr19 3187999 3188003 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 2438 112115849
chr19 3188014 3188029 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2453 112115850
chr19 3188017 3188028 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2456 112115851
chr19 3188024 3188035 CDX2 JASPAR yes 3185561 2463 112115852
chr19 3188025 3188036 HOXA10 JASPAR yes 3185561 2464 112115853
chr19 3188026 3188035 CDX1 JASPAR yes 3185561 2465 112115854
chr19 3188050 3188061 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2489 112115855
chr19 3188050 3188061 TFAP2B JASPAR yes 3185561 2489 112115856
chr19 3188050 3188061 TFAP2C JASPAR yes 3185561 2489 112115857
chr19 3188071 3188077 ETS1 JASPAR yes 3185561 2510 112115858
chr19 3188071 3188077 SPI1 JASPAR yes 3185561 2510 112115859
chr19 3188076 3188095 RFX2 JASPAR yes 3185561 2515 112115860
chr19 3188077 3188087 RELA JASPAR yes 3185561 2516 112115861
chr19 3188077 3188087 REL JASPAR yes 3185561 2516 112115862
chr19 3188077 3188088 NFKB1 JASPAR yes 3185561 2516 112115863
chr19 3188082 3188102 ESR1 JASPAR yes 3185561 2521 112115864
chr19 3188085 3188103 ESR2 JASPAR yes 3185561 2524 112115865
chr19 3188087 3188102 ESR2 JASPAR yes 3185561 2526 112115866
chr19 3188088 3188092 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 2527 112115867
chr19 3188088 3188102 MTF1 JASPAR yes 3185561 2527 112115868
chr19 3188098 3188112 PLAG1 JASPAR yes 3185561 2537 112115869
chr19 3188099 3188119 RREB1 JASPAR yes 3185561 2538 112115870
chr19 3188107 3188121 GLIS2 JASPAR yes 3185561 2546 112115871
chr19 3188107 3188121 GLIS3 JASPAR yes 3185561 2546 112115872
chr19 3188131 3188150 REST JASPAR yes 3185561 2570 112115873
chr19 3188134 3188147 EOMES JASPAR yes 3185561 2573 112115874
chr19 3188137 3188147 TBX21 JASPAR yes 3185561 2576 112115875
chr19 3188144 3188154 NFIA JASPAR yes 3185561 2583 112115876
chr19 3188145 3188154 NFIX JASPAR yes 3185561 2584 112115877
chr19 3188146 3188152 NFIC JASPAR yes 3185561 2585 112115878
chr19 3188155 3188170 TP53 JASPAR yes 3185561 2594 112115879
chr19 3188157 3188176 REST JASPAR yes 3185561 2596 112115880
chr19 3188162 3188166 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 2601 112115881
chr19 3188180 3188191 E2F6 JASPAR yes 3185561 2619 112115882
chr19 3188187 3188208 REST JASPAR yes 3185561 2626 112115883
chr19 3188188 3188207 REST JASPAR yes 3185561 2627 112115884
chr19 3188190 3188203 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2629 112115885
chr19 3188190 3188203 TFAP2B JASPAR yes 3185561 2629 112115886
chr19 3188190 3188203 TFAP2C JASPAR yes 3185561 2629 112115887
chr19 3188191 3188203 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2630 112115888
chr19 3188191 3188203 TFAP2B JASPAR yes 3185561 2630 112115889
chr19 3188191 3188203 TFAP2C JASPAR yes 3185561 2630 112115890
chr19 3188193 3188202 TFAP2A JASPAR yes 3185561 2632 112115891
chr19 3188198 3188202 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 2637 112115892
chr19 3188198 3188210 PKNOX2 JASPAR yes 3185561 2637 112115893
chr19 3188198 3188218 TP63 JASPAR yes 3185561 2637 112115894
chr19 3188199 3188208 SNAI2 JASPAR yes 3185561 2638 112115895
chr19 3188199 3188209 ID4 JASPAR yes 3185561 2638 112115896
chr19 3188199 3188209 NHLH1 JASPAR yes 3185561 2638 112115897
chr19 3188199 3188209 TCF3 JASPAR yes 3185561 2638 112115898
chr19 3188199 3188209 TCF4 JASPAR yes 3185561 2638 112115899
chr19 3188201 3188210 ZEB1 JASPAR yes 3185561 2640 112115900
chr19 3188201 3188211 TBX21 JASPAR yes 3185561 2640 112115901
chr19 3188201 3188212 TBX2 JASPAR yes 3185561 2640 112115902
chr19 3188201 3188214 EOMES JASPAR yes 3185561 2640 112115903
chr19 3188202 3188210 MGA JASPAR yes 3185561 2641 112115904
chr19 3188202 3188210 TBX15 JASPAR yes 3185561 2641 112115905
chr19 3188202 3188210 TBX1 JASPAR yes 3185561 2641 112115906
chr19 3188202 3188210 TBX4 JASPAR yes 3185561 2641 112115907
chr19 3188202 3188210 TBX5 JASPAR yes 3185561 2641 112115908
chr19 3188202 3188212 TBR1 JASPAR yes 3185561 2641 112115909
chr19 3188226 3188230 NFE TRANSFAC yes 3185561 2665 112115910
chr19 3188234 3188238 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 2673 112115911
chr19 3188235 3188244 SNAI2 JASPAR yes 3185561 2674 112115912
chr19 3188235 3188245 ID4 JASPAR yes 3185561 2674 112115913
chr19 3188235 3188245 NHLH1 JASPAR yes 3185561 2674 112115914
chr19 3188235 3188245 TCF3 JASPAR yes 3185561 2674 112115915
chr19 3188235 3188245 TCF4 JASPAR yes 3185561 2674 112115916
chr19 3188237 3188246 ZEB1 JASPAR yes 3185561 2676 112115917
chr19 3188238 3188246 TBX5 JASPAR yes 3185561 2677 112115918
chr19 3188248 3188263 PRDM1 JASPAR yes 3185561 2687 112115919
chr19 3188254 3188266 E2F8 JASPAR yes 3185561 2693 112115920
chr19 3188258 3188264 MZF1 JASPAR yes 3185561 2697 112115921
chr19 3188303 3188307 NFE TRANSFAC yes 3185561 2742 112115922
chr19 3188310 3188323 ZBTB18 JASPAR yes 3185561 2749 112115923
chr19 3188311 3188315 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 2750 112115924
chr19 3188325 3188340 PRDM1 JASPAR yes 3185561 2764 112115925
chr19 3188346 3188351 SP1 TRANSFAC yes 3185561 2785 112115926
chr19 3188368 3188372 NFE TRANSFAC yes 3185561 2807 112115927
chr19 3188378 3188388 NEUROG2 JASPAR yes 3185561 2817 112115928
chr19 3188410 3188415 SP1 TRANSFAC yes 3185561 2849 112115929
chr19 3188444 3188449 ETS2 TRANSFAC yes 3185561 2883 112115930
chr19 3188478 3188483 ATF1 TRANSFAC yes 3185561 2917 112115931
chr19 3188483 3188504 ZNF263 JASPAR yes 3185561 2922 112115932
chr19 3188492 3188513 ZNF263 JASPAR yes 3185561 2931 112115933
chr19 3188494 3188499 ETS2 TRANSFAC yes 3185561 2933 112115934
chr19 3188530 3188541 E2F6 JASPAR yes 3185561 2969 112115935
chr19 3188537 3188552 PRDM1 JASPAR yes 3185561 2976 112115936
chr19 3188538 3188548 SP1 JASPAR yes 3185561 2977 112115937
chr19 3188552 3188567 PRDM1 JASPAR yes 3185561 2991 112115938
chr19 3188558 3188579 ZNF263 JASPAR yes 3185561 2997 112115939
chr19 3188574 3188585 EBF1 JASPAR yes 3185561 3013 112115940
chr19 3188579 3188584 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3018 112115941
chr19 3188579 3188594 HNF4A JASPAR yes 3185561 3018 112115942
chr19 3188580 3188594 NR2F1 JASPAR yes 3185561 3019 112115943
chr19 3188580 3188595 HNF4G JASPAR yes 3185561 3019 112115944
chr19 3188586 3188595 THAP1 JASPAR yes 3185561 3025 112115945
chr19 3188591 3188603 TEAD1 JASPAR yes 3185561 3030 112115946
chr19 3188617 3188638 ZNF263 JASPAR yes 3185561 3056 112115947
chr19 3188620 3188641 ZNF263 JASPAR yes 3185561 3059 112115948
chr19 3188632 3188653 ZNF263 JASPAR yes 3185561 3071 112115949
chr19 3188635 3188656 ZNF263 JASPAR yes 3185561 3074 112115950
chr19 3188695 3188710 PRDM1 JASPAR yes 3185561 3134 112115951
chr19 3188719 3188731 NHLH1 JASPAR yes 3185561 3158 112115952
chr19 3188720 3188730 TFAP4 JASPAR yes 3185561 3159 112115953
chr19 3188720 3188732 TAL1 JASPAR yes 3185561 3159 112115954
chr19 3188727 3188731 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 3166 112115955
chr19 3188756 3188769 TFAP2A JASPAR yes 3185561 3195 112115956
chr19 3188756 3188769 TFAP2B JASPAR yes 3185561 3195 112115957
chr19 3188756 3188769 TFAP2C JASPAR yes 3185561 3195 112115958
chr19 3188757 3188768 EBF1 JASPAR yes 3185561 3196 112115959
chr19 3188763 3188774 NRF1 JASPAR yes 3185561 3202 112115960
chr19 3188764 3188768 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 3203 112115961
chr19 3188770 3188775 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3209 112115962
chr19 3188809 3188814 ETS2 TRANSFAC yes 3185561 3248 112115963
chr19 3188810 3188825 HNF4A JASPAR yes 3185561 3249 112115964
chr19 3188854 3188869 ZIC3 JASPAR yes 3185561 3293 112115965
chr19 3188864 3188881 ESR1 JASPAR yes 3185561 3303 112115966
chr19 3188865 3188880 ESR2 JASPAR yes 3185561 3304 112115967
chr19 3188877 3188882 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3316 112115968
chr19 3188877 3188883 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3316 112115969
chr19 3188878 3188889 EBF1 JASPAR yes 3185561 3317 112115970
chr19 3188888 3188908 RREB1 JASPAR yes 3185561 3327 112115971
chr19 3188928 3188939 EBF1 JASPAR yes 3185561 3367 112115972
chr19 3188951 3188964 TFAP2B JASPAR yes 3185561 3390 112115973
chr19 3188951 3188964 TFAP2C JASPAR yes 3185561 3390 112115974
chr19 3188962 3188983 ZNF263 JASPAR yes 3185561 3401 112115975
chr19 3188965 3188985 RREB1 JASPAR yes 3185561 3404 112115976
chr19 3188971 3188983 YY1 JASPAR yes 3185561 3410 112115977
chr19 3188995 3189007 TFAP2A JASPAR yes 3185561 3434 112115978
chr19 3188997 3189006 TFAP2A JASPAR yes 3185561 3436 112115979
chr19 3189033 3189047 EBF1 JASPAR yes 3185561 3472 112115980
chr19 3189039 3189044 TFAP2A TRANSFAC yes 3185561 3478 112115981
chr19 3189039 3189045 MZF1 JASPAR yes 3185561 3478 112115982
chr19 3189054 3189065 FLI1 JASPAR yes 3185561 3493 112115983
chr19 3189056 3189063 SPI1 JASPAR yes 3185561 3495 112115984
chr19 3189056 3189064 FEV JASPAR yes 3185561 3495 112115985
chr19 3189058 3189063 ETS2 TRANSFAC yes 3185561 3497 112115986
chr19 3189058 3189069 FLI1 JASPAR yes 3185561 3497 112115987
chr19 3189060 3189068 EHF JASPAR yes 3185561 3499 112115988
chr19 3189085 3189091 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3524 112115989
chr19 3189086 3189091 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3525 112115990
chr19 3189087 3189092 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3526 112115991
chr19 3189087 3189093 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3526 112115992
chr19 3189091 3189096 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3530 112115993
chr19 3189095 3189106 ESRRA JASPAR yes 3185561 3534 112115994
chr19 3189101 3189107 SOX10 JASPAR yes 3185561 3540 112115995
chr19 3189103 3189115 FOXI1 JASPAR yes 3185561 3542 112115996
chr19 3189104 3189124 RREB1 JASPAR yes 3185561 3543 112115997
chr19 3189106 3189126 RREB1 JASPAR yes 3185561 3545 112115998
chr19 3189110 3189120 TBX21 JASPAR yes 3185561 3549 112115999
chr19 3189110 3189121 TBX20 JASPAR yes 3185561 3549 112116000
chr19 3189110 3189123 EOMES JASPAR yes 3185561 3549 112116001
chr19 3189111 3189119 MGA JASPAR yes 3185561 3550 112116002
chr19 3189111 3189119 TBX15 JASPAR yes 3185561 3550 112116003
chr19 3189111 3189119 TBX1 JASPAR yes 3185561 3550 112116004
chr19 3189111 3189119 TBX4 JASPAR yes 3185561 3550 112116005
chr19 3189111 3189119 TBX5 JASPAR yes 3185561 3550 112116006
chr19 3189120 3189138 ESR1 JASPAR yes 3185561 3559 112116007
chr19 3189133 3189143 ID4 JASPAR yes 3185561 3572 112116008
chr19 3189133 3189143 TCF4 JASPAR yes 3185561 3572 112116009
chr19 3189150 3189164 EBF1 JASPAR yes 3185561 3589 112116010
chr19 3189151 3189162 EBF1 JASPAR yes 3185561 3590 112116011
chr19 3189162 3189177 HNF4A JASPAR yes 3185561 3601 112116012
chr19 3189163 3189177 NR2F1 JASPAR yes 3185561 3602 112116013
chr19 3189163 3189178 HNF4G JASPAR yes 3185561 3602 112116014
chr19 3189191 3189210 PAX5 JASPAR yes 3185561 3630 112116015
chr19 3189209 3189228 CTCF JASPAR yes 3185561 3648 112116016
chr19 3189210 3189225 ZIC3 JASPAR yes 3185561 3649 112116017
chr19 3189210 3189225 ZIC4 JASPAR yes 3185561 3649 112116018
chr19 3189211 3189225 ZIC1 JASPAR yes 3185561 3650 112116019
chr19 3189214 3189223 SNAI2 JASPAR yes 3185561 3653 112116020
chr19 3189214 3189224 TCF3 JASPAR yes 3185561 3653 112116021
chr19 3189214 3189224 TCF4 JASPAR yes 3185561 3653 112116022
chr19 3189216 3189225 ZEB1 JASPAR yes 3185561 3655 112116023
chr19 3189218 3189223 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3657 112116024
chr19 3189249 3189257 TBX15 JASPAR yes 3185561 3688 112116025
chr19 3189250 3189255 SP1 TRANSFAC yes 3185561 3689 112116026
chr19 3189255 3189269 NR2F1 JASPAR yes 3185561 3694 112116027
chr19 3189310 3189319 NFIX JASPAR yes 3185561 3749 112116028
chr19 3189310 3189320 NFIA JASPAR yes 3185561 3749 112116029
chr19 3189312 3189318 NFIC JASPAR yes 3185561 3751 112116030
chr19 3189315 3189327 PROX1 JASPAR yes 3185561 3754 112116031
chr19 3189332 3189337 GATA2 JASPAR yes 3185561 3771 112116032
chr19 3189341 3189344 MYB TRANSFAC yes 3185561 3780 112116033
chr19 3189356 3189360 ESR1 TRANSFAC yes 3185561 3795 112116034
chr19 3189364 3189378 TLX1 JASPAR yes 3185561 3803 112116035
chr19 3189408 3189412 ESR1 TRANSFAC yes 3185561 3847 112116036
chr19 3189412 3189421 HIC2 JASPAR yes 3185561 3851 112116037
chr19 3189423 3189429 NFIC JASPAR yes 3185561 3862 112116038
chr19 3189455 3189467 NHLH1 JASPAR yes 3185561 3894 112116039
chr19 3189456 3189466 MSC JASPAR yes 3185561 3895 112116040
chr19 3189456 3189466 NHLH1 JASPAR yes 3185561 3895 112116041
chr19 3189456 3189466 TFAP4 JASPAR yes 3185561 3895 112116042
chr19 3189497 3189512 NR2C2 JASPAR yes 3185561 3936 112116043
chr19 3189498 3189512 RXRB JASPAR yes 3185561 3937 112116044
chr19 3189498 3189512 RXRG JASPAR yes 3185561 3937 112116045
chr19 3189529 3189535 GATA3 JASPAR yes 3185561 3968 112116046
chr19 3189533 3189545 PKNOX2 JASPAR yes 3185561 3972 112116047
chr19 3189534 3189543 SNAI2 JASPAR yes 3185561 3973 112116048
chr19 3189534 3189544 HEY2 JASPAR yes 3185561 3973 112116049
chr19 3189534 3189544 ID4 JASPAR yes 3185561 3973 112116050
chr19 3189534 3189544 TCF4 JASPAR yes 3185561 3973 112116051
chr19 3189553 3189573 TP63 JASPAR yes 3185561 3992 112116052
chr19 3189558 3189562 H4TF2 TRANSFAC yes 3185561 3997 112116053
chr19 3189558 3189578 TP63 JASPAR yes 3185561 3997 112116054
chr19 3189566 3189574 MEIS3 JASPAR yes 3185561 4005 112116055
chr19 3189567 3189571 NFE TRANSFAC yes 3185561 4006 112116056
chr19 3189583 3189595 TGIF1 JASPAR yes 3185561 4022 112116057
chr19 3189615 3189627 ZBTB7A JASPAR yes 3185561 4054 112116058
chr19 3189624 3189634 NKX2-3 JASPAR yes 3185561 4063 112116059
chr19 3189634 3189644 SREBF1 JASPAR yes 3185561 4073 112116060
chr19 3189634 3189644 SREBF2 JASPAR yes 3185561 4073 112116061
chr19 3189690 3189704 MTF1 JASPAR yes 3185561 4129 112116062
chr19 3189732 3189745 TFAP2A JASPAR yes 3185561 4171 112116063
chr19 3189732 3189745 TFAP2B JASPAR yes 3185561 4171 112116064
chr19 3189732 3189745 TFAP2C JASPAR yes 3185561 4171 112116065
chr19 3189742 3189752 SP1 JASPAR yes 3185561 4181 112116066
chr19 3189743 3189761 ESR1 JASPAR yes 3185561 4182 112116067
chr19 3189749 3189754 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4188 112116068
chr19 3189749 3189766 RARA JASPAR yes 3185561 4188 112116069
chr19 3189757 3189768 ESRRB JASPAR yes 3185561 4196 112116070
chr19 3189760 3189772 TAL1 JASPAR yes 3185561 4199 112116071
chr19 3189762 3189768 YY1 JASPAR yes 3185561 4201 112116072
chr19 3189762 3189772 NEUROG2 JASPAR yes 3185561 4201 112116073
chr19 3189762 3189774 TAL1 JASPAR yes 3185561 4201 112116074
chr19 3189770 3189781 EBF1 JASPAR yes 3185561 4209 112116075
chr19 3189776 3189781 TFAP2A TRANSFAC yes 3185561 4215 112116076
chr19 3189776 3189782 MZF1 JASPAR yes 3185561 4215 112116077
chr19 3189786 3189801 RFX5 JASPAR yes 3185561 4225 112116078
chr19 3189808 3189822 PLAG1 JASPAR yes 3185561 4247 112116079
chr19 3189830 3189840 SP1 JASPAR yes 3185561 4269 112116080
chr19 3189831 3189841 SP1 JASPAR yes 3185561 4270 112116081
chr19 3189836 3189855 CTCF JASPAR yes 3185561 4275 112116082
chr19 3189837 3189852 HNF4G JASPAR yes 3185561 4276 112116083
chr19 3189838 3189853 HNF4A JASPAR yes 3185561 4277 112116084
chr19 3189841 3189861 ESR1 JASPAR yes 3185561 4280 112116085
chr19 3189843 3189863 PPARG JASPAR yes 3185561 4282 112116086
chr19 3189844 3189862 ESR2 JASPAR yes 3185561 4283 112116087
chr19 3189845 3189862 ESR1 JASPAR yes 3185561 4284 112116088
chr19 3189845 3189863 ESR1 JASPAR yes 3185561 4284 112116089
chr19 3189845 3189863 ESR2 JASPAR yes 3185561 4284 112116090
chr19 3189846 3189861 ESR2 JASPAR yes 3185561 4285 112116091
chr19 3189846 3189866 ESR1 JASPAR yes 3185561 4285 112116092
chr19 3189847 3189851 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 4286 112116093
chr19 3189853 3189864 ESRRB JASPAR yes 3185561 4292 112116094
chr19 3189876 3189886 SP1 JASPAR yes 3185561 4315 112116095
chr19 3189878 3189883 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4317 112116096
chr19 3189879 3189884 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4318 112116097
chr19 3189879 3189885 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4318 112116098
chr19 3189891 3189901 SP1 JASPAR yes 3185561 4330 112116099
chr19 3189892 3189901 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4331 112116100
chr19 3189893 3189898 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4332 112116101
chr19 3189894 3189899 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4333 112116102
chr19 3189894 3189900 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4333 112116103
chr19 3189918 3189932 PLAG1 JASPAR yes 3185561 4357 112116104
chr19 3189935 3189955 PPARG JASPAR yes 3185561 4374 112116105
chr19 3189947 3189957 MZF1 JASPAR yes 3185561 4386 112116106
chr19 3189950 3189956 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4389 112116107
chr19 3189958 3189965 SPIB JASPAR yes 3185561 4397 112116108
chr19 3189974 3189995 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4413 112116109
chr19 3189975 3189996 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4414 112116110
chr19 3189978 3189999 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4417 112116111
chr19 3189985 3190006 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4424 112116112
chr19 3189986 3189997 E2F6 JASPAR yes 3185561 4425 112116113
chr19 3189987 3190008 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4426 112116114
chr19 3189989 3190010 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4428 112116115
chr19 3190007 3190011 NFE TRANSFAC yes 3185561 4446 112116116
chr19 3190008 3190013 GATA2 JASPAR yes 3185561 4447 112116117
chr19 3190054 3190059 MYC TRANSFAC yes 3185561 4493 112116118
chr19 3190085 3190102 RARA JASPAR yes 3185561 4524 112116119
chr19 3190085 3190102 RXRA JASPAR yes 3185561 4524 112116120
chr19 3190104 3190122 TP53 JASPAR yes 3185561 4543 112116121
chr19 3190113 3190117 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 4552 112116122
chr19 3190113 3190133 TP63 JASPAR yes 3185561 4552 112116123
chr19 3190114 3190132 TP53 JASPAR yes 3185561 4553 112116124
chr19 3190114 3190132 TP63 JASPAR yes 3185561 4553 112116125
chr19 3190114 3190132 TP73 JASPAR yes 3185561 4553 112116126
chr19 3190116 3190131 TP53 JASPAR yes 3185561 4555 112116127
chr19 3190120 3190125 TFAP2A TRANSFAC yes 3185561 4559 112116128
chr19 3190120 3190126 MZF1 JASPAR yes 3185561 4559 112116129
chr19 3190124 3190133 SNAI2 JASPAR yes 3185561 4563 112116130
chr19 3190124 3190134 FIGLA JASPAR yes 3185561 4563 112116131
chr19 3190124 3190134 TCF4 JASPAR yes 3185561 4563 112116132
chr19 3190126 3190135 ZEB1 JASPAR yes 3185561 4565 112116133
chr19 3190128 3190133 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4567 112116134
chr19 3190138 3190148 SP1 JASPAR yes 3185561 4577 112116135
chr19 3190140 3190146 MAZ TRANSFAC yes 3185561 4579 112116136
chr19 3190189 3190195 TCF4 TRANSFAC yes 3185561 4628 112116137
chr19 3190202 3190215 TFAP2B JASPAR yes 3185561 4641 112116138
chr19 3190209 3190214 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4648 112116139
chr19 3190209 3190226 RARA JASPAR yes 3185561 4648 112116140
chr19 3190214 3190225 EBF1 JASPAR yes 3185561 4653 112116141
chr19 3190217 3190228 ESRRA JASPAR yes 3185561 4656 112116142
chr19 3190221 3190225 LFA1 TRANSFAC yes 3185561 4660 112116143
chr19 3190225 3190232 SPIB JASPAR yes 3185561 4664 112116144
chr19 3190246 3190261 JUND JASPAR yes 3185561 4685 112116145
chr19 3190247 3190260 JUN JASPAR yes 3185561 4686 112116146
chr19 3190248 3190262 BATF3 JASPAR yes 3185561 4687 112116147
chr19 3190249 3190261 JDP2 JASPAR yes 3185561 4688 112116148
chr19 3190269 3190284 NR2C2 JASPAR yes 3185561 4708 112116149
chr19 3190341 3190361 PPARG JASPAR yes 3185561 4780 112116150
chr19 3190351 3190360 HIC2 JASPAR yes 3185561 4790 112116151
chr19 3190354 3190375 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4793 112116152
chr19 3190379 3190387 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4818 112116153
chr19 3190379 3190389 SP1 JASPAR yes 3185561 4818 112116154
chr19 3190380 3190386 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4819 112116155
chr19 3190380 3190390 SP1 JASPAR yes 3185561 4819 112116156
chr19 3190382 3190387 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4821 112116157
chr19 3190390 3190398 TBX15 JASPAR yes 3185561 4829 112116158
chr19 3190390 3190399 ZEB1 JASPAR yes 3185561 4829 112116159
chr19 3190393 3190398 USF2 TRANSFAC yes 3185561 4832 112116160
chr19 3190406 3190413 E2F1 TRANSFAC yes 3185561 4845 112116161
chr19 3190410 3190430 TP63 JASPAR yes 3185561 4849 112116162
chr19 3190414 3190418 NFE TRANSFAC yes 3185561 4853 112116163
chr19 3190418 3190432 PLAG1 JASPAR yes 3185561 4857 112116164
chr19 3190434 3190444 SREBF1 JASPAR yes 3185561 4873 112116165
chr19 3190434 3190444 SREBF2 JASPAR yes 3185561 4873 112116166
chr19 3190467 3190478 E2F6 JASPAR yes 3185561 4906 112116167
chr19 3190468 3190489 ZNF263 JASPAR yes 3185561 4907 112116168
chr19 3190514 3190519 TFAP2A TRANSFAC yes 3185561 4953 112116169
chr19 3190514 3190520 MZF1 JASPAR yes 3185561 4953 112116170
chr19 3190527 3190532 SP1 TRANSFAC yes 3185561 4966 112116171
chr19 3190534 3190546 INSM1 JASPAR yes 3185561 4973 112116172
chr19 3190534 3190548 TLX1 JASPAR yes 3185561 4973 112116173
chr19 3190542 3190553 TFAP2A JASPAR yes 3185561 4981 112116174
chr19 3190542 3190553 TFAP2B JASPAR yes 3185561 4981 112116175
chr19 3190542 3190553 TFAP2C JASPAR yes 3185561 4981 112116176
chr19 3190543 3190552 TFAP2A JASPAR yes 3185561 4982 112116177
chr19 3190555 3190566 NRF1 JASPAR yes 3185561 4994 112116178
SNPs associated with NCLN[ENSG00000125912.6], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr19 3191604 rs550581 A G 0 Esophagus 4.78718e-09 5392422
chr19 3193484 rs499877 A G 0 Heart 7.46516e-10 5392444
chr19 3193484 rs499877 A G 0 Pancreas 0.11306 5392444
chr19 3193484 rs499877 A G 0 Breast 1.84039e-07 5392444
chr19 3192280 rs529914 T C 0 Spleen 4.92911e-06 5392436
chr19 3193484 rs499877 A G 0 Thyroid 1.38506e-38 5392444
chr19 3189634 rs490218 T C 0 Lung 9.00768e-14 5392366
chr19 3189652 rs518669 C T 0 Stomach 0.0624821 5392368
chr19 3185829 rs509977 G A 0 Adrenal 0.00144816 5392303
Details of NCLN[ENSG00000125912.6]
Back to top
Genomic Location chr19:3185561-3209573[+]
TSS 3185561
Gene Name NCLN
Ensembl ID ENSG00000125912.6
ENTREZID 56926
Uniprot
Q969V3
Protein Name
Nicalin
Expression levels of NCLN[ENSG00000125912.6]
Back to top