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Enhancers that regulate PRDM1[ENSG00000057657.10]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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VISTA
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Large Intestine
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Muscle (A673) Neural Stem Cells (H9)
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Blood (T-cell)
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Uterus
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VISTA
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VISTA
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Blood (GM12878)
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Bone Marrow (K562) Astrocyte Colon (HCT116) Blood (Karpas-422) Blood (T-cell) Stomach Epithelial (MCF-7) Skin (Keratinocyte) Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Peripheral Blood (MM.1S) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Blood (GM12878) Placenta Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Breast Muscle (Myotube)
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Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Large Intestine Esophagus Astrocyte Peripheral Blood (MM.1S) Muscle (Myoblast)
Transcript facotrs that regulate PRDM1[ENSG00000057657.10]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr6 106531127 106531145 RARA JASPAR yes 106534195 3050 104006596
chr6 106531129 106531134 SP1 TRANSFAC yes 106534195 3061 104006597
chr6 106531129 106531139 ZNF740 JASPAR yes 106534195 3056 104006598
chr6 106531130 106531140 SP1 JASPAR yes 106534195 3055 104006599
chr6 106531130 106531140 ZNF740 JASPAR yes 106534195 3055 104006600
chr6 106531145 106531160 RUNX2 JASPAR yes 106534195 3035 104006601
chr6 106531157 106531174 RARA JASPAR yes 106534195 3021 104006602
chr6 106531157 106531174 RXRA JASPAR yes 106534195 3021 104006603
chr6 106531160 106531168 MEIS2 JASPAR yes 106534195 3027 104006604
chr6 106531160 106531168 MEIS3 JASPAR yes 106534195 3027 104006605
chr6 106531161 106531165 NFE TRANSFAC yes 106534195 3030 104006606
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chr6 106531167 106531175 NR4A2 JASPAR yes 106534195 3020 104006609
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chr6 106531168 106531184 SRF JASPAR yes 106534195 3011 104006612
chr6 106531168 106531186 SRF JASPAR yes 106534195 3009 104006613
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chr6 106531196 106531217 IRF1 JASPAR yes 106534195 2978 104006615
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chr6 106531200 106531214 STAT1 JASPAR yes 106534195 2981 104006618
chr6 106531200 106531215 STAT2 JASPAR yes 106534195 2980 104006619
chr6 106531201 106531213 IRF1 JASPAR yes 106534195 2982 104006620
chr6 106531203 106531214 FOXA1 JASPAR yes 106534195 2981 104006621
chr6 106531204 106531215 FOXB1 JASPAR yes 106534195 2980 104006622
chr6 106531204 106531215 FOXC1 JASPAR yes 106534195 2980 104006623
chr6 106531206 106531214 FOXO3 JASPAR yes 106534195 2981 104006624
chr6 106531208 106531220 GRHL1 JASPAR yes 106534195 2975 104006625
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chr6 106531251 106531266 FOXP1 JASPAR yes 106534195 2929 104006631
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chr6 106531585 106531597 POU3F2 JASPAR yes 106534195 2598 104006665
chr6 106531589 106531599 LHX6 JASPAR yes 106534195 2596 104006666
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chr6 106531630 106531644 E2F7 JASPAR yes 106534195 2551 104006669
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chr6 106532263 106532278 HNF1A JASPAR yes 106534195 1917 104006742
chr6 106532264 106532277 HNF1B JASPAR yes 106534195 1918 104006743
chr6 106532267 106532277 EMX1 JASPAR yes 106534195 1918 104006744
chr6 106532267 106532277 EMX2 JASPAR yes 106534195 1918 104006745
chr6 106532267 106532277 ESX1 JASPAR yes 106534195 1918 104006746
chr6 106532267 106532277 GSX1 JASPAR yes 106534195 1918 104006747
chr6 106532267 106532277 GSX2 JASPAR yes 106534195 1918 104006748
chr6 106532267 106532277 HESX1 JASPAR yes 106534195 1918 104006749
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chr6 106532267 106532277 LBX2 JASPAR yes 106534195 1918 104006752
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chr6 106532267 106532277 MIXL1 JASPAR yes 106534195 1918 104006755
chr6 106532267 106532277 MNX1 JASPAR yes 106534195 1918 104006756
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chr6 106532267 106532277 POU6F1 JASPAR yes 106534195 1918 104006758
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chr6 106532268 106532276 NKX6-2 JASPAR yes 106534195 1919 104006764
chr6 106532268 106532276 PRRX1 JASPAR yes 106534195 1919 104006765
chr6 106532268 106532276 RAX2 JASPAR yes 106534195 1919 104006766
chr6 106532268 106532276 SHOX JASPAR yes 106534195 1919 104006767
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chr6 106532268 106532276 VAX1 JASPAR yes 106534195 1919 104006769
chr6 106532273 106532276 MYB TRANSFAC yes 106534195 1919 104006770
chr6 106532303 106532313 GSX2 JASPAR yes 106534195 1882 104006771
chr6 106532303 106532313 HOXB3 JASPAR yes 106534195 1882 104006772
chr6 106532303 106532313 MEOX2 JASPAR yes 106534195 1882 104006773
chr6 106532303 106532313 MNX1 JASPAR yes 106534195 1882 104006774
chr6 106532303 106532314 HOXA10 JASPAR yes 106534195 1881 104006775
chr6 106532303 106532314 HOXC11 JASPAR yes 106534195 1881 104006776
chr6 106532304 106532312 NKX6-1 JASPAR yes 106534195 1883 104006777
chr6 106532304 106532314 HOXC10 JASPAR yes 106534195 1881 104006778
chr6 106532306 106532310 YY1 TRANSFAC yes 106534195 1885 104006779
chr6 106532309 106532320 FOXA1 JASPAR yes 106534195 1875 104006780
chr6 106532309 106532324 FOXA1 JASPAR yes 106534195 1871 104006781
chr6 106532310 106532321 FOXB1 JASPAR yes 106534195 1874 104006782
chr6 106532310 106532321 FOXC1 JASPAR yes 106534195 1874 104006783
chr6 106532310 106532322 FOXC2 JASPAR yes 106534195 1873 104006784
chr6 106532315 106532599 SPI1 UCSC Txn Factor no Conserved 106534195 1596 108541158
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chr6 106532324 106532336 MEF2D JASPAR yes 106534195 1859 104006790
chr6 106532325 106532335 MEF2A JASPAR yes 106534195 1860 104006791
chr6 106532338 106532349 E2F6 JASPAR yes 106534195 1846 104006792
chr6 106532338 106532352 E2F7 JASPAR yes 106534195 1843 104006793
chr6 106532339 106532350 TBX20 JASPAR yes 106534195 1845 104006794
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chr6 106532377 106532392 SOX21 JASPAR yes 106534195 1803 104006796
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chr6 106532388 106532399 FOSL2 JASPAR yes 106534195 1796 104006798
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chr6 106532445 106532459 SPI1 JASPAR yes 106534195 1736 104006805
chr6 106532445 106532459 SPIC JASPAR yes 106534195 1736 104006806
chr6 106532447 106532468 IRF1 JASPAR yes 106534195 1727 70410907
chr6 106532447 106532468 IRF1 JASPAR yes 106534195 1727 104006807
chr6 106532451 106532456 ETS2 TRANSFAC yes 106534195 1739 70410908
chr6 106532451 106532456 ETS2 TRANSFAC yes 106534195 1739 104006808
chr6 106532452 106532633 MAFF UCSC Txn Factor no Conserved 106534195 1562 108541160
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chr6 106532469 106532472 MYB TRANSFAC yes 106534195 1723 104006809
chr6 106532469 106532482 ZBTB18 JASPAR yes 106534195 1713 70410910
chr6 106532469 106532482 ZBTB18 JASPAR yes 106534195 1713 104006810
chr6 106532476 106532491 PRDM1 JASPAR yes 106534195 1704 70410911
chr6 106532476 106532491 PRDM1 JASPAR yes 106534195 1704 104006811
chr6 106532522 106532537 FOXP1 JASPAR yes 106534195 1658 70410912
chr6 106532522 106532537 FOXP1 JASPAR yes 106534195 1658 104006812
chr6 106532523 106532532 SRY JASPAR yes 106534195 1663 70410913
chr6 106532523 106532532 SRY JASPAR yes 106534195 1663 104006813
chr6 106532528 106532549 REST JASPAR yes 106534195 1646 70410914
chr6 106532528 106532549 REST JASPAR yes 106534195 1646 104006814
chr6 106532532 106532536 NFE TRANSFAC yes 106534195 1659 70410915
chr6 106532532 106532536 NFE TRANSFAC yes 106534195 1659 104006815
chr6 106532533 106532933 CTCF UCSC Txn Factor no Conserved 106534195 1262 108541161
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chr6 106532539 106532557 MAFF JASPAR yes 106534195 1638 104006816
chr6 106532541 106532556 MAFK JASPAR yes 106534195 1639 70410917
chr6 106532541 106532556 MAFK JASPAR yes 106534195 1639 104006817
chr6 106532541 106532562 MAFG JASPAR yes 106534195 1633 70410918
chr6 106532541 106532562 MAFG JASPAR yes 106534195 1633 104006818
chr6 106532542 106532556 JUN JASPAR yes 106534195 1639 70410919
chr6 106532542 106532556 JUN JASPAR yes 106534195 1639 104006819
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chr6 106532544 106532555 BATF JASPAR yes 106534195 1640 104006820
chr6 106532545 106532556 FOSL2 JASPAR yes 106534195 1639 70410921
chr6 106532545 106532556 JUNB JASPAR yes 106534195 1639 70410922
chr6 106532545 106532556 NFE2L2 JASPAR yes 106534195 1639 70410923
chr6 106532545 106532556 FOSL2 JASPAR yes 106534195 1639 104006821
chr6 106532545 106532556 JUNB JASPAR yes 106534195 1639 104006822
chr6 106532545 106532556 NFE2L2 JASPAR yes 106534195 1639 104006823
chr6 106532546 106532557 FOS JASPAR yes 106534195 1638 70410924
chr6 106532546 106532557 FOSL1 JASPAR yes 106534195 1638 70410925
chr6 106532546 106532557 JUND JASPAR yes 106534195 1638 70410926
chr6 106532546 106532557 FOS JASPAR yes 106534195 1638 104006824
chr6 106532546 106532557 FOSL1 JASPAR yes 106534195 1638 104006825
chr6 106532546 106532557 JUND JASPAR yes 106534195 1638 104006826
chr6 106532546 106532564 MAFF JASPAR yes 106534195 1631 70410927
chr6 106532546 106532564 MAFF JASPAR yes 106534195 1631 104006827
chr6 106532547 106532558 JUNB JASPAR yes 106534195 1637 70410928
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chr6 106532547 106532558 JUNB JASPAR yes 106534195 1637 104006828
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chr6 106532547 106532561 JUN JASPAR yes 106534195 1634 70410930
chr6 106532547 106532561 JUN JASPAR yes 106534195 1634 104006830
chr6 106532547 106532562 MAFK JASPAR yes 106534195 1633 70410931
chr6 106532547 106532562 MAFK JASPAR yes 106534195 1633 104006831
chr6 106532548 106532559 BATF JASPAR yes 106534195 1636 70410932
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chr6 106532597 106532608 HOXA10 JASPAR yes 106534195 1587 70410934
chr6 106532597 106532608 HOXA10 JASPAR yes 106534195 1587 104006834
chr6 106532598 106532608 ALX3 JASPAR yes 106534195 1587 70410935
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chr6 106532599 106532607 LMX1A JASPAR yes 106534195 1588 70410939
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chr6 106532599 106532607 VAX1 JASPAR yes 106534195 1588 70410943
chr6 106532599 106532607 VAX2 JASPAR yes 106534195 1588 70410944
chr6 106532599 106532607 VSX1 JASPAR yes 106534195 1588 70410945
chr6 106532599 106532607 VSX2 JASPAR yes 106534195 1588 70410946
chr6 106532599 106532607 LMX1A JASPAR yes 106534195 1588 104006839
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chr6 106532599 106532607 NKX6-1 JASPAR yes 106534195 1588 104006841
chr6 106532599 106532607 NKX6-2 JASPAR yes 106534195 1588 104006842
chr6 106532599 106532607 VAX1 JASPAR yes 106534195 1588 104006843
chr6 106532599 106532607 VAX2 JASPAR yes 106534195 1588 104006844
chr6 106532599 106532607 VSX1 JASPAR yes 106534195 1588 104006845
chr6 106532599 106532607 VSX2 JASPAR yes 106534195 1588 104006846
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chr6 106533359 106533371 FOXC2 JASPAR yes 106534195 824 104006985
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chr6 106535037 106535045 FOXO3 JASPAR yes 106534195 842 104007288
chr6 106535037 106535048 FOXA1 JASPAR yes 106534195 842 104007289
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chr6 106536044 106536059 HNF4G JASPAR yes 106534195 1849 104007434
chr6 106536045 106536053 OTX1 JASPAR yes 106534195 1850 104007435
chr6 106536045 106536053 OTX2 JASPAR yes 106534195 1850 104007436
chr6 106536045 106536053 RHOXF1 JASPAR yes 106534195 1850 104007437
chr6 106536045 106536054 PITX3 JASPAR yes 106534195 1850 104007438
chr6 106536057 106536078 IRF1 JASPAR yes 106534195 1862 104007439
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chr6 106536431 106536442 FOXB1 JASPAR yes 106534195 2236 104007454
chr6 106536431 106536442 FOXC1 JASPAR yes 106534195 2236 104007455
chr6 106536431 106536443 FOXC2 JASPAR yes 106534195 2236 104007456
chr6 106536433 106536447 POU4F1 JASPAR yes 106534195 2238 104007457
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chr6 106536434 106536450 POU4F3 JASPAR yes 106534195 2239 104007462
chr6 106536438 106536452 ONECUT1 JASPAR yes 106534195 2243 104007463
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chr6 106536465 106536486 IRF1 JASPAR yes 106534195 2270 104007469
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chr6 106536535 106536543 FOXD1 JASPAR yes 106534195 2340 104007527
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chr6 106538666 106538682 SOX8 JASPAR yes 106534195 4471 104007829
chr6 106538677 106538695 MAFF JASPAR yes 106534195 4482 104007830
chr6 106538679 106538690 NRL JASPAR yes 106534195 4484 104007831
chr6 106538679 106538694 MAFK JASPAR yes 106534195 4484 104007832
chr6 106538706 106538717 HOXC13 JASPAR yes 106534195 4511 104007833
chr6 106538710 106538725 SOX21 JASPAR yes 106534195 4515 104007834
chr6 106538718 106538722 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4523 104007835
chr6 106538722 106538736 POU4F1 JASPAR yes 106534195 4527 104007836
chr6 106538722 106538738 POU4F3 JASPAR yes 106534195 4527 104007837
chr6 106538725 106538729 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4530 104007838
chr6 106538739 106538749 NEUROG2 JASPAR yes 106534195 4544 104007839
chr6 106538740 106538750 MAX JASPAR yes 106534195 4545 104007840
chr6 106538741 106538759 MAFF JASPAR yes 106534195 4546 104007841
chr6 106538742 106538757 MAFK JASPAR yes 106534195 4547 104007842
chr6 106538746 106538757 NRL JASPAR yes 106534195 4551 104007843
chr6 106538749 106538770 IRF1 JASPAR yes 106534195 4554 104007844
chr6 106538753 106538768 FOXP1 JASPAR yes 106534195 4558 104007845
chr6 106538753 106538773 RREB1 JASPAR yes 106534195 4558 104007846
chr6 106538754 106538769 FOXP1 JASPAR yes 106534195 4559 104007847
chr6 106538755 106538770 FOXP1 JASPAR yes 106534195 4560 104007848
chr6 106538756 106538771 FOXP1 JASPAR yes 106534195 4561 104007849
chr6 106538759 106538774 MEF2C JASPAR yes 106534195 4564 104007850
chr6 106538763 106538774 RUNX1 JASPAR yes 106534195 4568 104007851
chr6 106538774 106538794 RREB1 JASPAR yes 106534195 4579 104007852
chr6 106538781 106538794 POU2F2 JASPAR yes 106534195 4586 104007853
chr6 106538793 106538797 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4598 104007854
chr6 106538804 106538818 RORA JASPAR yes 106534195 4609 104007855
chr6 106538805 106538815 RORA JASPAR yes 106534195 4610 104007856
chr6 106538812 106538816 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4617 104007857
chr6 106538819 106538830 DUX4 JASPAR yes 106534195 4624 104007858
chr6 106538820 106538825 NFY TRANSFAC yes 106534195 4625 104007859
chr6 106538864 106538879 STAT2 JASPAR yes 106534195 4669 104007860
chr6 106538865 106538875 ERF JASPAR yes 106534195 4670 104007861
chr6 106538865 106538879 SPI1 JASPAR yes 106534195 4670 104007862
chr6 106538865 106538879 SPIC JASPAR yes 106534195 4670 104007863
chr6 106538866 106538873 SPI1 JASPAR yes 106534195 4671 104007864
chr6 106538869 106538884 MEF2C JASPAR yes 106534195 4674 104007865
chr6 106538872 106538876 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4677 104007866
chr6 106538873 106538884 STAT3 JASPAR yes 106534195 4678 104007867
chr6 106538886 106538901 MEF2C JASPAR yes 106534195 4691 104007868
chr6 106538887 106538902 MEF2A JASPAR yes 106534195 4692 104007869
chr6 106538912 106538928 SOX4 JASPAR yes 106534195 4717 104007870
chr6 106538938 106538953 HNF1A JASPAR yes 106534195 4743 104007871
chr6 106538945 106538955 HOXA13 JASPAR yes 106534195 4750 104007872
chr6 106538945 106538955 HOXB13 JASPAR yes 106534195 4750 104007873
chr6 106538945 106538955 HOXD13 JASPAR yes 106534195 4750 104007874
chr6 106538946 106538955 CDX1 JASPAR yes 106534195 4751 104007875
chr6 106538947 106538959 INSM1 JASPAR yes 106534195 4752 104007876
chr6 106538949 106538959 GCM2 JASPAR yes 106534195 4754 104007877
chr6 106538952 106538962 REL JASPAR yes 106534195 4757 104007878
chr6 106538952 106538963 NFKB1 JASPAR yes 106534195 4757 104007879
chr6 106538952 106538965 NFKB1 JASPAR yes 106534195 4757 104007880
chr6 106538952 106538965 NFKB2 JASPAR yes 106534195 4757 104007881
chr6 106538953 106538963 NFKB1 JASPAR yes 106534195 4758 104007882
chr6 106538953 106538963 RELA JASPAR yes 106534195 4758 104007883
chr6 106538953 106538963 REL JASPAR yes 106534195 4758 104007884
chr6 106538953 106538964 NFKB1 JASPAR yes 106534195 4758 104007885
chr6 106538953 106538966 NFKB1 JASPAR yes 106534195 4758 104007886
chr6 106538953 106538966 NFKB2 JASPAR yes 106534195 4758 104007887
chr6 106538954 106538965 NFKB1 JASPAR yes 106534195 4759 104007888
chr6 106538982 106538988 MYC TRANSFAC yes 106534195 4787 104007889
chr6 106539003 106539021 NR3C1 JASPAR yes 106534195 4808 104007890
chr6 106539021 106539025 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4826 104007891
chr6 106539027 106539031 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4832 104007892
chr6 106539085 106539101 ZNF143 JASPAR yes 106534195 4890 104007893
chr6 106539126 106539140 FOXF2 JASPAR yes 106534195 4931 104007894
chr6 106539127 106539141 GATA2 JASPAR yes 106534195 4932 104007895
chr6 106539131 106539139 FOXG1 JASPAR yes 106534195 4936 104007896
chr6 106539155 106539170 LEF1 JASPAR yes 106534195 4960 104007897
chr6 106539180 106539190 PAX3 JASPAR yes 106534195 4985 104007898
chr6 106539180 106539190 PAX7 JASPAR yes 106534195 4985 104007899
chr6 106539181 106539195 POU4F1 JASPAR yes 106534195 4986 104007900
chr6 106539182 106539196 POU4F1 JASPAR yes 106534195 4987 104007901
chr6 106539182 106539198 POU4F3 JASPAR yes 106534195 4987 104007902
chr6 106539185 106539189 YY1 TRANSFAC yes 106534195 4990 104007903
chr6 106539191 106539194 MYB TRANSFAC yes 106534195 4996 104007904
SNPs associated with PRDM1[ENSG00000057657.10], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 106959961 rs4946759 A G 402147 Esophagus 0.0995211 9235115
chr6 106587356 rs117197514 C A,G 29542 Heart 0.324822 9232139
chr6 105948901 rs6906748 T G 585294 Heart 0.0865952 9227303
chr6 106317196 rs9372110 G A 216999 Ovary 0.201247 9230009
chr6 106568239 rs544287 C T 10425 Adrenal 0.17841 9231870
Details of PRDM1[ENSG00000057657.10]
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Genomic Location chr6:106534195-106557814[+]
TSS 106534195
Gene Name PRDM1
Ensembl ID ENSG00000057657.10
ENTREZID 639
Uniprot
Q5T4E8
B4DW27
O75626
Protein Name
with ZNF domain
PR domain containing 1
PR domain zinc finger protein 1
Truncated PRDM1 isoform 2
Expression levels of PRDM1[ENSG00000057657.10]
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