EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. COL4A1[ENSG00000187498.10]
Enhancers that regulate COL4A1[ENSG00000187498.10]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr13 110865085 110921672 enh15492 110959496 37824
Brain (SK-N-MC) Pancreas Uterus Kidney Stomach Brain (SK-N-SH) Ovary Bone (Osteoblast) Thyroid Neural Stem Cells (H9) Prostate (PC-3) Large Intestine Esophagus Placenta Lung (PC-9) Breast Muscle (Myoblast) Spleen Muscle (Myotube) Prostate (RWPE1) Lung Muscle (A673) Heart
chr13 110902548 110902879 vista17032 110959496 56617
VISTA
chr13 110917837 110918263 vista17033 110959496 41233
VISTA
chr13 110921763 110936315 enh15493 110959496 23181
Heart Placenta Pancreas Uterus Stomach
chr13 110932842 110933175 vista17034 110959496 26321
VISTA
chr13 110936365 110944895 enh15494 110959496 14601
Esophagus Placenta Lung (PC-9) Muscle (Myotube) Uterus Heart
chr13 110948985 110956594 enh15495 110959496 2902
Bone (Osteoblast) Placenta Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Uterus Heart
chr13 110950675 110951614 vista17035 110959496 7882
VISTA
chr13 110956468 110956902 vista17036 110959496 2594
VISTA
chr13 110962345 110978755 enh15496 110959496 2849
Prostate (PC-3) Esophagus Bone (Osteoblast) Lung Stomach Muscle (A673) Placenta Thyroid Muscle (Myoblast) Pancreas Uterus Thymus Heart
chr13 110965035 110965206 vista17037 110959496 5539
VISTA
chr13 110969695 110970088 vista17038 110959496 10199
VISTA
chr13 110972696 110972889 vista17039 110959496 13200
VISTA
chr13 110979129 111037007 enh15497 110959496 19633
Brain (SK-N-MC) Astrocyte Colon (HCT116) Embryonic Stem Cell Line (H1-hESC) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Stomach Skin (Keratinocyte) Brain (SK-N-SH) Bone (Osteoblast) Thyroid Neural Stem Cells (H9) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Blood (GM12878) Placenta Lung (PC-9) Breast Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Prostate (RWPE1) Lung Muscle (A673) Heart
chr13 110982194 110982608 vista17040 110959496 22698
VISTA
chr13 110991031 110991380 vista17041 110959496 31535
VISTA
chr13 110995670 110995825 vista17042 110959496 36174
VISTA
chr13 111013776 111014136 vista17043 110959496 54280
VISTA
chr13 111016537 111016818 vista17044 110959496 57041
VISTA
chr13 111022548 111022884 vista17045 110959496 63052
VISTA
chr13 111037685 111076655 enh15498 110959496 78189
Brain (SK-N-MC) Liver Pancreas Uterus Kidney Epithelial (MCF-7) Stomach Brain (SK-N-SH) Ovary Bone (Osteoblast) Neural Stem Cells (H9) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Placenta Lung (PC-9) Breast Muscle (Myoblast) Spleen Muscle (Myotube) Prostate (RWPE1) Lung Muscle (A673) Heart
chr13 111039905 111040155 vista17046 110959496 80409
VISTA
chr13 111040636 111040786 vista17047 110959496 81140
VISTA
chr13 111044675 111045176 vista17048 110959496 85179
VISTA
chr13 111048888 111049110 vista17049 110959496 89392
VISTA
chr13 111049993 111050394 vista17050 110959496 90497
VISTA
chr13 111053318 111053466 vista17051 110959496 93822
VISTA
Transcript facotrs that regulate COL4A1[ENSG00000187498.10]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr13 110954492 110954498 SOX10 JASPAR yes 110959496 4998 60335587
chr13 110954496 110954507 NFE2L2 JASPAR yes 110959496 4989 60335588
chr13 110954512 110954533 ZNF263 JASPAR yes 110959496 4963 60335589
chr13 110954515 110954520 GATA2 JASPAR yes 110959496 4976 60335590
chr13 110954524 110954531 SPIB JASPAR yes 110959496 4965 60335591
chr13 110954551 110954566 HNF4A JASPAR yes 110959496 4930 60335592
chr13 110954567 110954586 CTCF JASPAR yes 110959496 4910 60335593
chr13 110954568 110954582 TCF7L2 JASPAR yes 110959496 4914 60335594
chr13 110954568 110954583 LEF1 JASPAR yes 110959496 4913 60335595
chr13 110954568 110954583 NR2C2 JASPAR yes 110959496 4913 60335596
chr13 110954577 110954592 ESR2 JASPAR yes 110959496 4904 60335597
chr13 110954578 110954582 LFA1 TRANSFAC yes 110959496 4914 60335598
chr13 110954590 110954602 YY1 JASPAR yes 110959496 4894 60335599
chr13 110954605 110954610 ETS2 TRANSFAC yes 110959496 4886 60335600
chr13 110954626 110954632 TBP TRANSFAC yes 110959496 4864 60335601
chr13 110954645 110954661 SRF JASPAR yes 110959496 4835 60335602
chr13 110954647 110954662 FOXA1 JASPAR yes 110959496 4834 60335603
chr13 110954650 110954661 FOXC1 JASPAR yes 110959496 4835 60335604
chr13 110954651 110954655 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4841 60335605
chr13 110954651 110954662 FOXA1 JASPAR yes 110959496 4834 60335606
chr13 110954664 110954678 TCF7L2 JASPAR yes 110959496 4818 60335607
chr13 110954664 110954679 LEF1 JASPAR yes 110959496 4817 60335608
chr13 110954693 110954707 MTF1 JASPAR yes 110959496 4789 60335609
chr13 110954748 110954761 TFAP2A JASPAR yes 110959496 4735 60335610
chr13 110954748 110954761 TFAP2B JASPAR yes 110959496 4735 60335611
chr13 110954748 110954761 TFAP2C JASPAR yes 110959496 4735 60335612
chr13 110954801 110954816 HNF4G JASPAR yes 110959496 4680 60335613
chr13 110954802 110954817 HNF4A JASPAR yes 110959496 4679 60335614
chr13 110954805 110954811 TCF4 TRANSFAC yes 110959496 4685 60335615
chr13 110954808 110954822 TCF7L2 JASPAR yes 110959496 4674 60335616
chr13 110954808 110954823 LEF1 JASPAR yes 110959496 4673 60335617
chr13 110954809 110954824 AR JASPAR yes 110959496 4672 60335618
chr13 110954813 110954819 SOX10 JASPAR yes 110959496 4677 60335619
chr13 110954816 110954837 REST JASPAR yes 110959496 4659 60335620
chr13 110954817 110954836 REST JASPAR yes 110959496 4660 60335621
chr13 110954830 110954849 REST JASPAR yes 110959496 4647 60335622
chr13 110954833 110954839 NFE2 TRANSFAC yes 110959496 4657 60335623
chr13 110954858 110954879 ZNF263 JASPAR yes 110959496 4617 60335624
chr13 110954859 110954880 ZNF263 JASPAR yes 110959496 4616 60335625
chr13 110954860 110954864 LFA1 TRANSFAC yes 110959496 4632 60335626
chr13 110954866 110954871 ETS2 TRANSFAC yes 110959496 4625 60335627
chr13 110954866 110954880 SPI1 JASPAR yes 110959496 4616 60335628
chr13 110954866 110954880 SPIC JASPAR yes 110959496 4616 60335629
chr13 110954867 110954880 ELF1 JASPAR yes 110959496 4616 60335630
chr13 110954870 110954877 SPIB JASPAR yes 110959496 4619 60335631
chr13 110954896 110954902 ETS1 JASPAR yes 110959496 4594 60335632
chr13 110954943 110954952 SOX9 JASPAR yes 110959496 4544 60335633
chr13 110954949 110954960 E2F6 JASPAR yes 110959496 4536 60335634
chr13 110954971 110954988 NR3C1 JASPAR yes 110959496 4508 60335635
chr13 110954973 110954988 AR JASPAR yes 110959496 4508 60335636
chr13 110954990 110954994 NFE TRANSFAC yes 110959496 4502 60335637
chr13 110955050 110955060 HOXA13 JASPAR yes 110959496 4436 60335638
chr13 110955050 110955060 HOXB13 JASPAR yes 110959496 4436 60335639
chr13 110955050 110955060 HOXD13 JASPAR yes 110959496 4436 60335640
chr13 110955051 110955055 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4441 60335641
chr13 110955087 110955100 POU2F2 JASPAR yes 110959496 4396 60335642
chr13 110955137 110955141 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4355 60335643
chr13 110955148 110955159 CEBPB JASPAR yes 110959496 4337 60335644
chr13 110955149 110955160 CEBPA JASPAR yes 110959496 4336 60335645
chr13 110955153 110955165 MEF2A JASPAR yes 110959496 4331 60335646
chr13 110955153 110955165 MEF2B JASPAR yes 110959496 4331 60335647
chr13 110955153 110955165 MEF2D JASPAR yes 110959496 4331 60335648
chr13 110955154 110955164 MEF2A JASPAR yes 110959496 4332 60335649
chr13 110955160 110955173 ELF1 JASPAR yes 110959496 4323 60335650
chr13 110955161 110955174 ELF3 JASPAR yes 110959496 4322 60335651
chr13 110955162 110955173 ELF5 JASPAR yes 110959496 4323 60335652
chr13 110955170 110955179 SOX9 JASPAR yes 110959496 4317 60335653
chr13 110955181 110955184 MYB TRANSFAC yes 110959496 4312 60335654
chr13 110955184 110955188 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4308 60335655
chr13 110955184 110955199 MEF2C JASPAR yes 110959496 4297 60335656
chr13 110955187 110955191 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4305 60335657
chr13 110955200 110955209 SOX9 JASPAR yes 110959496 4287 60335658
chr13 110955215 110955222 JUN TRANSFAC yes 110959496 4274 60335659
chr13 110955230 110955245 MEF2C JASPAR yes 110959496 4251 60335660
chr13 110955254 110955263 JDP2 JASPAR yes 110959496 4233 60335661
chr13 110955260 110955264 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4232 60335662
chr13 110955262 110955272 HOXC10 JASPAR yes 110959496 4224 60335663
chr13 110955262 110955272 HOXD13 JASPAR yes 110959496 4224 60335664
chr13 110955262 110955273 HOXC13 JASPAR yes 110959496 4223 60335665
chr13 110955263 110955273 GSX1 JASPAR yes 110959496 4223 60335666
chr13 110955263 110955273 GSX2 JASPAR yes 110959496 4223 60335667
chr13 110955264 110955272 NKX6-1 JASPAR yes 110959496 4224 60335668
chr13 110955264 110955272 NKX6-2 JASPAR yes 110959496 4224 60335669
chr13 110955264 110955274 POU6F2 JASPAR yes 110959496 4222 60335670
chr13 110955265 110955276 PHOX2A JASPAR yes 110959496 4220 60335671
chr13 110955265 110955276 PROP1 JASPAR yes 110959496 4220 60335672
chr13 110955265 110955276 RUNX1 JASPAR yes 110959496 4220 60335673
chr13 110955272 110955281 PITX3 JASPAR yes 110959496 4215 60335674
chr13 110955272 110955282 GSC2 JASPAR yes 110959496 4214 60335675
chr13 110955272 110955282 GSC JASPAR yes 110959496 4214 60335676
chr13 110955273 110955281 OTX1 JASPAR yes 110959496 4215 60335677
chr13 110955273 110955281 OTX2 JASPAR yes 110959496 4215 60335678
chr13 110955290 110955295 TFAP2A TRANSFAC yes 110959496 4201 60335679
chr13 110955290 110955296 MZF1 JASPAR yes 110959496 4200 60335680
chr13 110955304 110955308 TEAD2 TRANSFAC yes 110959496 4188 60335681
chr13 110955306 110955309 MYB TRANSFAC yes 110959496 4187 60335682
chr13 110955306 110955318 FOXI1 JASPAR yes 110959496 4178 60335683
chr13 110955331 110955341 MYF6 JASPAR yes 110959496 4155 60335684
chr13 110955339 110955353 TLX1 JASPAR yes 110959496 4143 60335685
chr13 110955343 110955347 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4149 60335686
chr13 110955350 110955368 NR3C1 JASPAR yes 110959496 4128 60335687
chr13 110955371 110955375 NFE TRANSFAC yes 110959496 4121 60335688
chr13 110955377 110955383 SOX10 JASPAR yes 110959496 4113 60335689
chr13 110955388 110955403 JUND JASPAR yes 110959496 4093 60335690
chr13 110955403 110955408 SP1 TRANSFAC yes 110959496 4088 60335691
chr13 110955412 110955416 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4080 60335692
chr13 110955432 110955442 MSC JASPAR yes 110959496 4054 60335693
chr13 110955439 110955449 HMBOX1 JASPAR yes 110959496 4047 60335694
chr13 110955441 110955444 MYB TRANSFAC yes 110959496 4052 60335695
chr13 110955441 110955452 PROP1 JASPAR yes 110959496 4044 60335696
chr13 110955442 110955454 FOXI1 JASPAR yes 110959496 4042 60335697
chr13 110955448 110955464 SOX4 JASPAR yes 110959496 4032 60335698
chr13 110955449 110955452 MYB TRANSFAC yes 110959496 4044 60335699
chr13 110955477 110955492 STAT1 JASPAR yes 110959496 4004 60335700
chr13 110955479 110955490 STAT1 JASPAR yes 110959496 4006 60335701
chr13 110955490 110955500 NFIA JASPAR yes 110959496 3996 60335702
chr13 110955492 110955498 NFIC JASPAR yes 110959496 3998 60335703
chr13 110955504 110955519 HNF1A JASPAR yes 110959496 3977 60335704
chr13 110955505 110955518 HNF1B JASPAR yes 110959496 3978 60335705
chr13 110955505 110955519 POU4F1 JASPAR yes 110959496 3977 60335706
chr13 110955506 110955522 POU4F2 JASPAR yes 110959496 3974 60335707
chr13 110955506 110955522 POU4F3 JASPAR yes 110959496 3974 60335708
chr13 110955508 110955522 POU4F1 JASPAR yes 110959496 3974 60335709
chr13 110955509 110955523 POU4F1 JASPAR yes 110959496 3973 60335710
chr13 110955528 110955538 NFKB1 JASPAR yes 110959496 3958 60335711
chr13 110955528 110955538 RELA JASPAR yes 110959496 3958 60335712
chr13 110955567 110955577 RORA JASPAR yes 110959496 3919 60335713
chr13 110955570 110955576 ESR1 TRANSFAC yes 110959496 3920 60335714
chr13 110955572 110955576 ESR1 TRANSFAC yes 110959496 3920 60335715
chr13 110955599 110955618 PAX5 JASPAR yes 110959496 3878 60335716
chr13 110955602 110955619 PAX9 JASPAR yes 110959496 3877 60335717
chr13 110955641 110955655 TLX1 JASPAR yes 110959496 3841 60335718
chr13 110955685 110955690 SP1 TRANSFAC yes 110959496 3806 60335719
chr13 110955692 110955697 MYC TRANSFAC yes 110959496 3799 60335720
chr13 110955716 110955719 MYB TRANSFAC yes 110959496 3777 60335721
chr13 110955730 110955744 NR2F1 JASPAR yes 110959496 3752 60335722
chr13 110955730 110955745 NR2C2 JASPAR yes 110959496 3751 60335723
chr13 110955733 110955743 SP1 JASPAR yes 110959496 3753 60335724
chr13 110955744 110955748 H1TF2 TRANSFAC yes 110959496 3748 60335725
chr13 110955744 110955748 NFE TRANSFAC yes 110959496 3748 60335726
chr13 110955744 110955748 SRF TRANSFAC yes 110959496 3748 60335727
chr13 110955763 110955778 HNF4G JASPAR yes 110959496 3718 60335728
chr13 110955763 110955778 NR2C2 JASPAR yes 110959496 3718 60335729
chr13 110955764 110955778 NR2F1 JASPAR yes 110959496 3718 60335730
chr13 110955764 110955778 RXRB JASPAR yes 110959496 3718 60335731
chr13 110955764 110955778 RXRG JASPAR yes 110959496 3718 60335732
chr13 110955764 110955779 HNF4A JASPAR yes 110959496 3717 60335733
chr13 110955787 110955796 SRY JASPAR yes 110959496 3700 60335734
chr13 110955801 110955810 SOX9 JASPAR yes 110959496 3686 60335735
chr13 110955801 110955817 SOX4 JASPAR yes 110959496 3679 60335736
chr13 110955802 110955817 SOX21 JASPAR yes 110959496 3679 60335737
chr13 110955802 110955818 SOX4 JASPAR yes 110959496 3678 60335738
chr13 110955804 110955822 RARA JASPAR yes 110959496 3674 60335739
chr13 110955810 110955814 YY1 TRANSFAC yes 110959496 3682 60335740
chr13 110955817 110955822 GATA1 TRANSFAC yes 110959496 3674 60335741
chr13 110955836 110955846 RORA JASPAR yes 110959496 3650 60335742
chr13 110955837 110955848 ESRRA JASPAR yes 110959496 3648 60335743
chr13 110955837 110955848 ESRRB JASPAR yes 110959496 3648 60335744
chr13 110955841 110955845 ESR1 TRANSFAC yes 110959496 3651 60335745
chr13 110955854 110955860 TCF4 TRANSFAC yes 110959496 3636 60335746
chr13 110955876 110955889 SMAD2 JASPAR yes 110959496 3607 60335747
chr13 110955925 110955935 MAX JASPAR yes 110959496 3561 60335748
chr13 110955929 110955941 POU3F2 JASPAR yes 110959496 3555 60335749
chr13 110955941 110955952 GCM1 JASPAR yes 110959496 3544 60335750
chr13 110955950 110955971 IRF1 JASPAR yes 110959496 3525 60335751
chr13 110955952 110955967 STAT2 JASPAR yes 110959496 3529 60335752
chr13 110955953 110955967 SPI1 JASPAR yes 110959496 3529 60335753
chr13 110955960 110955964 YY1 TRANSFAC yes 110959496 3532 60335754
chr13 110955973 110955977 YY1 TRANSFAC yes 110959496 3519 60335755
chr13 110955981 110955986 SP1 TRANSFAC yes 110959496 3510 60335756
chr13 110955982 110955993 ELK4 JASPAR yes 110959496 3503 60335757
chr13 110955984 110955990 ETS1 JASPAR yes 110959496 3506 60335758
chr13 110955984 110955990 SPI1 JASPAR yes 110959496 3506 60335759
chr13 110955990 110955996 SP1 TRANSFAC yes 110959496 3500 60335760
chr13 110955990 110956000 SP1 JASPAR yes 110959496 3496 60335761
chr13 110955993 110956008 HSF1 JASPAR yes 110959496 3488 60335762
chr13 110955994 110956007 HSF1 JASPAR yes 110959496 3489 60335763
chr13 110955994 110956007 HSF4 JASPAR yes 110959496 3489 60335764
chr13 110956004 110956011 SPIB JASPAR yes 110959496 3485 60335765
chr13 110956015 110956021 MZF1 JASPAR yes 110959496 3475 60335766
chr13 110956068 110956072 YY1 TRANSFAC yes 110959496 3424 60335767
chr13 110956091 110956112 IRF1 JASPAR yes 110959496 3384 60335768
chr13 110956093 110956108 STAT2 JASPAR yes 110959496 3388 60335769
chr13 110956094 110956108 STAT1 JASPAR yes 110959496 3388 60335770
chr13 110956101 110956108 NFATC2 JASPAR yes 110959496 3388 60335771
chr13 110956105 110956109 H1TF2 TRANSFAC yes 110959496 3387 60335772
chr13 110956105 110956109 NFE TRANSFAC yes 110959496 3387 60335773
chr13 110956105 110956109 SRF TRANSFAC yes 110959496 3387 60335774
chr13 110956109 110956113 YY1 TRANSFAC yes 110959496 3383 60335775
chr13 110956109 110956122 EOMES JASPAR yes 110959496 3374 60335776
chr13 110956111 110956121 TBR1 JASPAR yes 110959496 3375 60335777
chr13 110956111 110956122 TBX2 JASPAR yes 110959496 3374 60335778
chr13 110956113 110956122 ZEB1 JASPAR yes 110959496 3374 60335779
chr13 110956114 110956124 SREBF1 JASPAR yes 110959496 3372 60335780
chr13 110956114 110956124 SREBF2 JASPAR yes 110959496 3372 60335781
chr13 110956114 110956125 USF1 JASPAR yes 110959496 3371 60335782
chr13 110956116 110956121 USF2 TRANSFAC yes 110959496 3375 60335783
chr13 110956116 110956129 NR2F1 JASPAR yes 110959496 3367 60335784
chr13 110956119 110956127 NR4A2 JASPAR yes 110959496 3369 60335785
chr13 110956123 110956131 EHF JASPAR yes 110959496 3365 60335786
chr13 110956141 110956151 ZNF740 JASPAR yes 110959496 3345 60335787
chr13 110956144 110956157 NFKB2 JASPAR yes 110959496 3339 60335788
chr13 110956154 110956173 REST JASPAR yes 110959496 3323 60335789
chr13 110956168 110956178 ID4 JASPAR yes 110959496 3318 60335790
chr13 110956168 110956178 TCF3 JASPAR yes 110959496 3318 60335791
chr13 110956168 110956178 TCF4 JASPAR yes 110959496 3318 60335792
chr13 110956170 110956175 USF2 TRANSFAC yes 110959496 3321 60335793
chr13 110956176 110956187 ESRRA JASPAR yes 110959496 3309 60335794
chr13 110956176 110956187 ESRRB JASPAR yes 110959496 3309 60335795
chr13 110956180 110956184 ESR1 TRANSFAC yes 110959496 3312 60335796
chr13 110956187 110956198 FLI1 JASPAR yes 110959496 3298 60335797
chr13 110956188 110956196 EHF JASPAR yes 110959496 3300 60335798
chr13 110956189 110956206 NR3C1 JASPAR yes 110959496 3290 60335799
chr13 110956214 110956225 FOXH1 JASPAR yes 110959496 3271 60335800
chr13 110956223 110956228 ETS2 TRANSFAC yes 110959496 3268 60335801
chr13 110956223 110956231 EHF JASPAR yes 110959496 3265 60335802
chr13 110956239 110956243 H4TF2 TRANSFAC yes 110959496 3253 60335803
chr13 110956248 110956256 EHF JASPAR yes 110959496 3240 60335804
chr13 110956257 110956277 TP53 JASPAR yes 110959496 3219 60335805
chr13 110956264 110956279 PRDM1 JASPAR yes 110959496 3217 60335806
chr13 110956279 110956603 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 110959496 2893 108089144
chr13 110956326 110956330 TEAD2 TRANSFAC yes 110959496 3166 60335807
chr13 110956326 110956331 TBP TRANSFAC yes 110959496 3165 60335808
chr13 110956326 110956332 TFIID TRANSFAC yes 110959496 3164 60335809
chr13 110956338 110956342 H4TF2 TRANSFAC yes 110959496 3154 60335810
chr13 110956348 110956359 TFAP2C JASPAR yes 110959496 3137 60335811
chr13 110956372 110956382 BHLHE40 JASPAR yes 110959496 3114 60335812
chr13 110956372 110956382 HEY1 JASPAR yes 110959496 3114 60335813
chr13 110956372 110956382 HEY2 JASPAR yes 110959496 3114 60335814
chr13 110956372 110956382 MLXIPL JASPAR yes 110959496 3114 60335815
chr13 110956372 110956382 MLX JASPAR yes 110959496 3114 60335816
chr13 110956372 110956382 MNT JASPAR yes 110959496 3114 60335817
chr13 110956372 110956382 TFE3 JASPAR yes 110959496 3114 60335818
chr13 110956372 110956383 USF1 JASPAR yes 110959496 3113 60335819
chr13 110956373 110956383 MAX JASPAR yes 110959496 3113 60335820
chr13 110956374 110956379 MYC TRANSFAC yes 110959496 3117 60335821
chr13 110956374 110956379 USF1 TRANSFAC yes 110959496 3117 60335822
chr13 110956374 110956379 USF2 TRANSFAC yes 110959496 3117 60335823
chr13 110956380 110956392 MEF2A JASPAR yes 110959496 3104 60335824
chr13 110956380 110956392 MEF2B JASPAR yes 110959496 3104 60335825
chr13 110956380 110956392 MEF2D JASPAR yes 110959496 3104 60335826
chr13 110956381 110956391 MEF2A JASPAR yes 110959496 3105 60335827
chr13 110956382 110956396 POU4F1 JASPAR yes 110959496 3100 60335828
chr13 110956383 110956397 POU4F1 JASPAR yes 110959496 3099 60335829
chr13 110956383 110956399 POU4F3 JASPAR yes 110959496 3097 60335830
chr13 110956430 110956447 NR3C1 JASPAR yes 110959496 3049 60335831
chr13 110956430 110956447 NR3C2 JASPAR yes 110959496 3049 60335832
chr13 110956440 110956458 NFYA JASPAR yes 110959496 3038 60335833
chr13 110956465 110956479 RXRB JASPAR yes 110959496 3017 19342368
chr13 110956465 110956479 RXRB JASPAR yes 110959496 3017 60335834
chr13 110956482 110956486 H1TF2 TRANSFAC yes 110959496 3010 19342369
chr13 110956482 110956486 NFE TRANSFAC yes 110959496 3010 19342370
chr13 110956482 110956486 SRF TRANSFAC yes 110959496 3010 19342371
chr13 110956482 110956486 H1TF2 TRANSFAC yes 110959496 3010 60335835
chr13 110956482 110956486 NFE TRANSFAC yes 110959496 3010 60335836
chr13 110956482 110956486 SRF TRANSFAC yes 110959496 3010 60335837
chr13 110956491 110956503 MEF2A JASPAR yes 110959496 2993 19342372
chr13 110956491 110956503 MEF2B JASPAR yes 110959496 2993 19342373
chr13 110956491 110956503 MEF2D JASPAR yes 110959496 2993 19342374
chr13 110956491 110956503 MEF2A JASPAR yes 110959496 2993 60335838
chr13 110956491 110956503 MEF2B JASPAR yes 110959496 2993 60335839
chr13 110956491 110956503 MEF2D JASPAR yes 110959496 2993 60335840
chr13 110956492 110956502 MEF2A JASPAR yes 110959496 2994 19342375
chr13 110956492 110956502 MEF2A JASPAR yes 110959496 2994 60335841
chr13 110956499 110956503 TEAD2 TRANSFAC yes 110959496 2993 19342376
chr13 110956499 110956503 TEAD2 TRANSFAC yes 110959496 2993 60335842
chr13 110956499 110956504 TBP TRANSFAC yes 110959496 2992 19342377
chr13 110956499 110956504 TBP TRANSFAC yes 110959496 2992 60335843
chr13 110956516 110956520 TEAD2 TRANSFAC yes 110959496 2976 19342378
chr13 110956516 110956520 TEAD2 TRANSFAC yes 110959496 2976 60335844
chr13 110956519 110956524 ETS2 TRANSFAC yes 110959496 2972 19342379
chr13 110956519 110956524 ETS2 TRANSFAC yes 110959496 2972 60335845
chr13 110956533 110956537 H1TF2 TRANSFAC yes 110959496 2959 19342380
chr13 110956533 110956537 NFE TRANSFAC yes 110959496 2959 19342381
chr13 110956533 110956537 SRF TRANSFAC yes 110959496 2959 19342382
chr13 110956533 110956537 H1TF2 TRANSFAC yes 110959496 2959 60335846
chr13 110956533 110956537 NFE TRANSFAC yes 110959496 2959 60335847
chr13 110956533 110956537 SRF TRANSFAC yes 110959496 2959 60335848
chr13 110956573 110956587 JUN JASPAR yes 110959496 2909 19342383
chr13 110956573 110956587 JUN JASPAR yes 110959496 2909 60335849
chr13 110956611 110956615 YY1 TRANSFAC yes 110959496 2881 19342384
chr13 110956628 110956632 H4TF2 TRANSFAC yes 110959496 2864 19342385
chr13 110956632 110956648 SRF JASPAR yes 110959496 2848 19342386
chr13 110956633 110956640 NKX3-1 JASPAR yes 110959496 2856 19342387
chr13 110956666 110956680 RORA JASPAR yes 110959496 2816 19342388
chr13 110956668 110956688 ESR1 JASPAR yes 110959496 2808 19342389
chr13 110956669 110956679 RORA JASPAR yes 110959496 2817 19342390
chr13 110956670 110956681 ESRRB JASPAR yes 110959496 2815 19342391
chr13 110956671 110956689 ESR2 JASPAR yes 110959496 2807 19342392
chr13 110956671 110956691 PPARG JASPAR yes 110959496 2805 19342393
chr13 110956673 110956688 ESR2 JASPAR yes 110959496 2808 19342394
chr13 110956674 110956678 ESR1 TRANSFAC yes 110959496 2818 19342395
chr13 110956690 110956704 JUN JASPAR yes 110959496 2792 19342396
chr13 110956693 110956704 FOSL2 JASPAR yes 110959496 2792 19342397
chr13 110956693 110956704 JUNB JASPAR yes 110959496 2792 19342398
chr13 110956694 110956705 FOSL1 JASPAR yes 110959496 2791 19342399
chr13 110956694 110956705 JUND JASPAR yes 110959496 2791 19342400
chr13 110956695 110956702 JUN TRANSFAC yes 110959496 2794 19342401
chr13 110956703 110956722 CTCF JASPAR yes 110959496 2774 19342402
chr13 110956704 110956708 ESR1 TRANSFAC yes 110959496 2788 19342403
chr13 110956745 110956755 MZF1 JASPAR yes 110959496 2741 19342404
chr13 110956745 110956760 HNF4G JASPAR yes 110959496 2736 19342405
chr13 110956745 110956760 NR2C2 JASPAR yes 110959496 2736 19342406
chr13 110956746 110956760 RXRB JASPAR yes 110959496 2736 19342407
chr13 110956746 110956760 RXRG JASPAR yes 110959496 2736 19342408
chr13 110956749 110956760 NFKB1 JASPAR yes 110959496 2736 19342409
chr13 110956765 110956773 OTX2 JASPAR yes 110959496 2723 19342410
chr13 110956802 110956817 HSF1 JASPAR yes 110959496 2679 19342411
chr13 110956817 110956828 TBX2 JASPAR yes 110959496 2668 19342412
chr13 110956817 110956830 EOMES JASPAR yes 110959496 2666 19342413
chr13 110956818 110956828 TBR1 JASPAR yes 110959496 2668 19342414
chr13 110956834 110956845 FLI1 JASPAR yes 110959496 2651 19342415
chr13 110956835 110956843 EHF JASPAR yes 110959496 2653 19342416
chr13 110956850 110956855 SP1 TRANSFAC yes 110959496 2641 19342417
chr13 110956865 110956876 FOSL2 JASPAR yes 110959496 2620 19342418
chr13 110956865 110956876 JUNB JASPAR yes 110959496 2620 19342419
chr13 110956866 110956877 FOSL1 JASPAR yes 110959496 2619 19342420
chr13 110956867 110956874 JUN TRANSFAC yes 110959496 2622 19342421
chr13 110963042 110966115 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 3546 108089145
chr13 110963360 110966360 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 3864 108089146
chr13 110963451 110965972 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 3955 108089147
chr13 110963470 110965946 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 3974 108089148
chr13 110963496 110965975 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4000 108089149
chr13 110963887 110966112 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 110959496 4391 108089150
chr13 110964049 110965104 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4553 108089151
chr13 110964078 110966231 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 110959496 4582 108089152
chr13 110964088 110965927 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4592 108089153
chr13 110964088 110966088 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 110959496 4592 108089154
chr13 110964105 110965112 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4609 108089155
chr13 110964109 110965946 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4613 108089156
chr13 110964120 110965778 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4624 108089157
chr13 110964127 110966011 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 110959496 4631 108089158
chr13 110964139 110966279 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4643 108089159
chr13 110964161 110965876 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 110959496 4665 108089160
chr13 110964184 110966339 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 110959496 4688 108089161
chr13 110964216 110965891 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 110959496 4720 108089162
chr13 110964245 110964257 INSM1 JASPAR yes 110959496 4749 60335850
chr13 110964251 110964259 FEV JASPAR yes 110959496 4755 60335851
chr13 110964260 110964273 NR2F1 JASPAR yes 110959496 4764 60335852
chr13 110964263 110964271 NR4A2 JASPAR yes 110959496 4767 60335853
chr13 110964266 110964276 GABPA JASPAR yes 110959496 4770 60335854
chr13 110964267 110964275 EHF JASPAR yes 110959496 4771 60335855
chr13 110964295 110964308 TFAP2A JASPAR yes 110959496 4799 60335856
chr13 110964295 110964308 TFAP2B JASPAR yes 110959496 4799 60335857
chr13 110964295 110964308 TFAP2C JASPAR yes 110959496 4799 60335858
chr13 110964307 110964319 NHLH1 JASPAR yes 110959496 4811 60335859
chr13 110964308 110964318 NHLH1 JASPAR yes 110959496 4812 60335860
chr13 110964329 110964335 ETS1 JASPAR yes 110959496 4833 60335861
chr13 110964400 110964405 ETS2 TRANSFAC yes 110959496 4904 60335862
chr13 110964404 110964422 NR3C1 JASPAR yes 110959496 4908 60335863
chr13 110964419 110966301 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 110959496 4923 108089163
chr13 110964420 110964431 ELK4 JASPAR yes 110959496 4924 60335864
chr13 110964421 110964425 YY1 TRANSFAC yes 110959496 4925 60335865
chr13 110964421 110964432 ELF5 JASPAR yes 110959496 4925 60335866
chr13 110964421 110964434 ELF1 JASPAR yes 110959496 4925 60335867
chr13 110964421 110964436 STAT1 JASPAR yes 110959496 4925 60335868
chr13 110964422 110964430 FEV JASPAR yes 110959496 4926 60335869
chr13 110964423 110964434 STAT1 JASPAR yes 110959496 4927 60335870
chr13 110964451 110964463 YY1 JASPAR yes 110959496 4955 60335871
chr13 110964456 110965503 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 110959496 4960 108089164
SNPs associated with COL4A1[ENSG00000187498.10], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr13 111017784 rs9521719 G A 58288 Esophagus 0.0205279 3393694
chr13 111212771 rs140416382 G A 253275 Pancreas 0.362514 3396077
chr13 111107485 rs7326335 G T 147989 Ovary 0.473041 3394869
chr13 110143471 rs9587882 T C 657847 Uterus 0.236481 3385296
chr13 111198459 rs11617401 C T 238963 Liver 0.367212 3395838
chr13 111121199 rs9521794 G A 161703 Lung 0.176243 3394954
Details of COL4A1[ENSG00000187498.10]
Back to top
Genomic Location chr13:110801318-110959496[-]
TSS 110959496
Gene Name COL4A1
Ensembl ID ENSG00000187498.10
ENTREZID 1282
Uniprot
P02462
F5H5K0
A5PKV2
Protein Name
COL4A1 protein
Collagen alpha-1(IV) chain
Collagen alpha-1(IV) chain [Cleaved into: Arresten]
Collagen type IV:alpha1 chain
Expression levels of COL4A1[ENSG00000187498.10]
Back to top